MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853 chromosome

Total Repeats: 16792

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011205	CCAG	2	8	198158	198165	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
502	NC_011205	AAG	2	6	198177	198182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
503	NC_011205	TGC	2	6	198198	198203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_011205	T	6	6	198287	198292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_011205	TG	3	6	198320	198325	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
506	NC_011205	TCA	2	6	198330	198335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_011205	GAAT	2	8	198364	198371	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
508	NC_011205	GCG	2	6	198408	198413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_011205	TTA	2	6	198414	198419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_011205	ATT	2	6	199781	199786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_011205	AT	3	6	199793	199798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_011205	AAGT	2	8	199815	199822	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
513	NC_011205	TGA	2	6	205989	205994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
514	NC_011205	CCA	2	6	206027	206032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
515	NC_011205	GAT	2	6	206680	206685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_011205	GAA	2	6	206697	206702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
517	NC_011205	AT	4	8	206736	206743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_011205	ATT	2	6	206751	206756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_011205	GTTT	2	8	206766	206773	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
520	NC_011205	CAT	2	6	206909	206914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_011205	GGA	2	6	206933	206938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
522	NC_011205	GAC	2	6	207397	207402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_011205	T	6	6	207424	207429	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_011205	AT	3	6	207443	207448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_011205	CTT	2	6	209066	209071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_011205	TGA	2	6	210034	210039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_011205	GCGCT	2	10	210052	210061	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
528	NC_011205	CGCGT	2	10	210104	210113	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
529	NC_011205	G	6	6	210984	210989	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
530	NC_011205	CTC	2	6	212873	212878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
531	NC_011205	TAA	2	6	212949	212954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_011205	AG	3	6	212999	213004	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
533	NC_011205	CAT	2	6	213026	213031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_011205	CGC	2	6	213035	213040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
535	NC_011205	AACG	2	8	214039	214046	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
536	NC_011205	ACGC	2	8	214640	214647	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
537	NC_011205	TAA	2	6	214660	214665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_011205	GA	3	6	218499	218504	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
539	NC_011205	TCT	3	9	218507	218515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_011205	GTC	2	6	218516	218521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_011205	GAA	2	6	218527	218532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_011205	TCC	2	6	221206	221211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
543	NC_011205	ATAA	2	8	221212	221219	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_011205	GTA	2	6	221445	221450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_011205	CAATAT	2	12	227433	227444	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
546	NC_011205	CTGTC	2	10	227500	227509	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
547	NC_011205	AAG	2	6	227546	227551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
548	NC_011205	AAT	2	6	227681	227686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_011205	T	8	8	227906	227913	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_011205	AAAT	2	8	227931	227938	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_011205	TA	3	6	227954	227959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_011205	T	7	7	227981	227987	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_011205	T	6	6	228011	228016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_011205	CTTG	2	8	228028	228035	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
555	NC_011205	TTTG	2	8	228037	228044	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
556	NC_011205	T	6	6	228045	228050	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_011205	TAT	2	6	228067	228072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_011205	TAAA	2	8	228091	228098	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_011205	A	6	6	228096	228101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_011205	TTAT	2	8	228153	228160	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_011205	GTT	2	6	228167	228172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
562	NC_011205	CTT	2	6	228175	228180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_011205	ATATA	2	10	228214	228223	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_011205	CTA	2	6	228227	228232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_011205	TAA	2	6	228295	228300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_011205	ATC	2	6	228878	228883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_011205	A	7	7	228918	228924	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_011205	TA	3	6	228930	228935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_011205	A	8	8	234803	234810	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_011205	GGC	2	6	234818	234823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_011205	GTT	2	6	234843	234848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_011205	TCT	2	6	236307	236312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_011205	TTG	2	6	238162	238167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
574	NC_011205	CCA	2	6	243590	243595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
575	NC_011205	CTT	2	6	243641	243646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_011205	TGCTC	2	10	243702	243711	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
577	NC_011205	AGG	2	6	243714	243719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
578	NC_011205	CGG	2	6	244886	244891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_011205	GGA	2	6	247989	247994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
580	NC_011205	TTTTTA	2	12	248005	248016	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_011205	TAA	2	6	248018	248023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_011205	CAG	2	6	248027	248032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_011205	TGA	2	6	248073	248078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_011205	TGG	2	6	248083	248088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
585	NC_011205	AGC	2	6	248112	248117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_011205	TCA	2	6	248555	248560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_011205	AAT	2	6	248575	248580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_011205	CCA	2	6	248602	248607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
589	NC_011205	A	7	7	248616	248622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_011205	AGA	2	6	248637	248642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
591	NC_011205	GCG	2	6	248670	248675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_011205	ATAA	2	8	250968	250975	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_011205	CT	3	6	253796	253801	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
594	NC_011205	GCC	2	6	253803	253808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
595	NC_011205	GAT	2	6	254706	254711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
596	NC_011205	AAT	2	6	254718	254723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_011205	TCAG	2	8	254746	254753	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
598	NC_011205	T	6	6	254822	254827	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_011205	GCC	2	6	254875	254880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
600	NC_011205	CAA	2	6	254924	254929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_011205	GC	3	6	254963	254968	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
602	NC_011205	AC	3	6	254994	254999	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
603	NC_011205	AAC	2	6	255032	255037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_011205	AC	4	8	255036	255043	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
605	NC_011205	GGC	2	6	255903	255908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_011205	GTA	2	6	256016	256021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
607	NC_011205	GAG	2	6	256978	256983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
608	NC_011205	CTT	2	6	256998	257003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_011205	CT	3	6	257011	257016	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
610	NC_011205	GAAA	2	8	257106	257113	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
611	NC_011205	TTA	2	6	257889	257894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_011205	TG	3	6	257939	257944	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
613	NC_011205	GTCTG	2	10	257948	257957	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
614	NC_011205	AGA	2	6	259897	259902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_011205	T	6	6	259969	259974	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_011205	T	6	6	260004	260009	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_011205	A	6	6	260182	260187	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_011205	TTAG	2	8	263192	263199	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
619	NC_011205	GAA	2	6	263200	263205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
620	NC_011205	ATA	2	6	263209	263214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_011205	TTA	2	6	267335	267340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_011205	AGG	2	6	274862	274867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
623	NC_011205	T	8	8	274885	274892	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_011205	GCAG	2	8	274988	274995	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
625	NC_011205	T	6	6	276843	276848	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_011205	GCGCT	2	10	280804	280813	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
627	NC_011205	CAC	2	6	280861	280866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
628	NC_011205	CAA	2	6	280874	280879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_011205	CCT	2	6	281337	281342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
630	NC_011205	CAA	2	6	283287	283292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_011205	A	7	7	285072	285078	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_011205	AATG	2	8	286250	286257	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
633	NC_011205	AAT	2	6	286323	286328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_011205	TGTGT	2	10	287195	287204	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
635	NC_011205	TAT	2	6	288897	288902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_011205	AATGA	2	10	288906	288915	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
637	NC_011205	ATCA	2	8	288990	288997	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
638	NC_011205	CTG	2	6	289025	289030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_011205	CGG	2	6	289737	289742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_011205	CA	3	6	289756	289761	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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760	NC_011205	AAG	2	6	305267	305272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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916	NC_011205	GCA	2	6	334211	334216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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