MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853 chromosome

Total Repeats: 16792

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_011205	TGCG	2	8	1785173	1785180	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6002	NC_011205	AAC	2	6	1786073	1786078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6003	NC_011205	AC	3	6	1786120	1786125	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6004	NC_011205	ATAA	2	8	1786845	1786852	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_011205	GCC	2	6	1789581	1789586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6006	NC_011205	ATT	2	6	1789615	1789620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_011205	ATA	2	6	1791695	1791700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_011205	ACA	2	6	1791761	1791766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6009	NC_011205	A	6	6	1791770	1791775	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_011205	TG	3	6	1793035	1793040	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_011205	AT	3	6	1794054	1794059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_011205	ACC	2	6	1795535	1795540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6013	NC_011205	TAT	2	6	1795638	1795643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_011205	TCAC	2	8	1795703	1795710	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6015	NC_011205	TGAA	2	8	1795764	1795771	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_011205	TGC	2	6	1796051	1796056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6017	NC_011205	GC	3	6	1796058	1796063	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6018	NC_011205	TAG	2	6	1796256	1796261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_011205	TGT	2	6	1796273	1796278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_011205	TAA	2	6	1796279	1796284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_011205	CCA	2	6	1796295	1796300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6022	NC_011205	CTG	2	6	1797886	1797891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6023	NC_011205	GCA	2	6	1797895	1797900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6024	NC_011205	A	6	6	1797905	1797910	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_011205	GA	3	6	1797955	1797960	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_011205	GAT	2	6	1798103	1798108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_011205	CTT	2	6	1798177	1798182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6028	NC_011205	CGAC	2	8	1798216	1798223	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6029	NC_011205	ATT	3	9	1798229	1798237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_011205	ATAC	2	8	1799308	1799315	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6031	NC_011205	CGG	2	6	1799339	1799344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6032	NC_011205	GAA	2	6	1799350	1799355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_011205	CAA	2	6	1799404	1799409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6034	NC_011205	GCC	2	6	1799456	1799461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6035	NC_011205	TGA	2	6	1802430	1802435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_011205	CAG	2	6	1802495	1802500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6037	NC_011205	CT	3	6	1802518	1802523	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6038	NC_011205	A	6	6	1802560	1802565	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_011205	T	6	6	1802571	1802576	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_011205	AGC	2	6	1802612	1802617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6041	NC_011205	CAT	2	6	1802677	1802682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6042	NC_011205	ATTAA	2	10	1802712	1802721	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_011205	TTA	2	6	1802723	1802728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_011205	TTAGC	2	10	1802744	1802753	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6045	NC_011205	T	7	7	1802767	1802773	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_011205	ATC	2	6	1802793	1802798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6047	NC_011205	AAT	2	6	1802861	1802866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_011205	ATT	2	6	1802922	1802927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_011205	GC	3	6	1803877	1803882	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6050	NC_011205	GGC	2	6	1803909	1803914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6051	NC_011205	CCA	2	6	1803965	1803970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6052	NC_011205	T	6	6	1804032	1804037	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_011205	TC	3	6	1804076	1804081	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6054	NC_011205	ATA	2	6	1804131	1804136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_011205	ATT	2	6	1804137	1804142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_011205	A	8	8	1804178	1804185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_011205	GC	3	6	1804196	1804201	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6058	NC_011205	GCC	2	6	1804264	1804269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6059	NC_011205	GTT	2	6	1804287	1804292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_011205	CGG	2	6	1804378	1804383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6061	NC_011205	TTAC	2	8	1804389	1804396	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6062	NC_011205	T	6	6	1804491	1804496	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_011205	CTGCG	2	10	1804524	1804533	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6064	NC_011205	GCG	2	6	1804614	1804619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6065	NC_011205	CAGC	2	8	1804629	1804636	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6066	NC_011205	ATG	2	6	1804700	1804705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_011205	TTA	2	6	1804788	1804793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_011205	TATT	2	8	1804803	1804810	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_011205	CGT	3	9	1804825	1804833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6070	NC_011205	GCG	2	6	1804892	1804897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6071	NC_011205	AT	3	6	1804904	1804909	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_011205	GCT	2	6	1804921	1804926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6073	NC_011205	ATG	2	6	1805000	1805005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_011205	ATT	3	9	1805021	1805029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6075	NC_011205	TGTC	2	8	1805046	1805053	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6076	NC_011205	GGC	2	6	1805083	1805088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6078	NC_011205	CG	3	6	1805137	1805142	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6079	NC_011205	GC	3	6	1805157	1805162	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6080	NC_011205	TG	3	6	1805192	1805197	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6081	NC_011205	TCTG	2	8	1805202	1805209	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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6085	NC_011205	GTT	2	6	1805371	1805376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6087	NC_011205	CGT	2	6	1805410	1805415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6088	NC_011205	CGG	2	6	1805523	1805528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6089	NC_011205	TGG	2	6	1805547	1805552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6092	NC_011205	C	6	6	1805664	1805669	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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6095	NC_011205	TGG	2	6	1805781	1805786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_011205	CGCT	2	8	1805807	1805814	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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6099	NC_011205	CAAT	2	8	1805904	1805911	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6100	NC_011205	ACG	2	6	1805912	1805917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6101	NC_011205	TAA	2	6	1805974	1805979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_011205	TCA	2	6	1806862	1806867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6103	NC_011205	A	6	6	1806880	1806885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_011205	CGC	2	6	1807045	1807050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6105	NC_011205	T	6	6	1807063	1807068	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_011205	ATA	2	6	1807108	1807113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_011205	AT	3	6	1807118	1807123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_011205	AT	3	6	1807133	1807138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_011205	ATTA	2	8	1807162	1807169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_011205	ATA	2	6	1807202	1807207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_011205	TAAGT	2	10	1807267	1807276	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_011205	TTC	2	6	1808456	1808461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6114	NC_011205	CGG	2	6	1808477	1808482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6115	NC_011205	CTTTT	2	10	1808484	1808493	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
6116	NC_011205	T	7	7	1808490	1808496	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6118	NC_011205	CT	3	6	1808561	1808566	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6119	NC_011205	GCG	2	6	1810344	1810349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6120	NC_011205	GC	3	6	1810373	1810378	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6121	NC_011205	GCG	2	6	1811737	1811742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6122	NC_011205	TA	3	6	1811753	1811758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_011205	TGT	2	6	1811766	1811771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6127	NC_011205	GCG	2	6	1814279	1814284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6128	NC_011205	T	6	6	1816022	1816027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6129	NC_011205	T	6	6	1817322	1817327	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6130	NC_011205	AAC	2	6	1817328	1817333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6132	NC_011205	ACG	2	6	1818964	1818969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6133	NC_011205	TCG	2	6	1819030	1819035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6134	NC_011205	GGC	2	6	1819045	1819050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6136	NC_011205	TGA	2	6	1819237	1819242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6137	NC_011205	AAG	2	6	1819259	1819264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6139	NC_011205	G	6	6	1819423	1819428	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6140	NC_011205	GTA	2	6	1819583	1819588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6143	NC_011205	ACAGA	2	10	1821843	1821852	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
6144	NC_011205	TCCC	2	8	1821866	1821873	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6145	NC_011205	GTC	2	6	1821940	1821945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6150	NC_011205	G	10	10	1822126	1822135	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6151	NC_011205	A	8	8	1822158	1822165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6152	NC_011205	TGT	2	6	1822202	1822207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6161	NC_011205	ATCA	2	8	1829548	1829555	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6162	NC_011205	T	7	7	1829620	1829626	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6163	NC_011205	TCTA	2	8	1829640	1829647	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6164	NC_011205	T	6	6	1829761	1829766	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6165	NC_011205	AGA	2	6	1829807	1829812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6222	NC_011205	T	7	7	1846968	1846974	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6228	NC_011205	AG	3	6	1848671	1848676	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6229	NC_011205	ATAGA	2	10	1848679	1848688	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6230	NC_011205	AGA	2	6	1848705	1848710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6231	NC_011205	GTA	2	6	1848773	1848778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6232	NC_011205	TCA	2	6	1848804	1848809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6234	NC_011205	TC	3	6	1848877	1848882	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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6257	NC_011205	ATT	2	6	1856462	1856467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6259	NC_011205	GAA	2	6	1856538	1856543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6260	NC_011205	CCA	2	6	1858579	1858584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6261	NC_011205	TC	3	6	1859311	1859316	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6262	NC_011205	TAT	2	6	1859336	1859341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6266	NC_011205	ATG	2	6	1866112	1866117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6391	NC_011205	A	7	7	1898164	1898170	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6392	NC_011205	AAG	2	6	1898207	1898212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6393	NC_011205	T	6	6	1898244	1898249	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6394	NC_011205	CTT	2	6	1898273	1898278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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