MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853 chromosome

Total Repeats: 16792

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_011205	A	7	7	1489826	1489832	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_011205	CGC	2	6	1489835	1489840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5003	NC_011205	GAA	2	6	1490815	1490820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_011205	TGG	2	6	1490839	1490844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_011205	TGA	2	6	1492552	1492557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_011205	GCC	2	6	1492703	1492708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5007	NC_011205	ATC	2	6	1492741	1492746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_011205	AGCG	2	8	1492752	1492759	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5009	NC_011205	CT	4	8	1492783	1492790	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5010	NC_011205	ATG	2	6	1492814	1492819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_011205	TAC	2	6	1492847	1492852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_011205	AC	3	6	1494124	1494129	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5013	NC_011205	T	6	6	1494135	1494140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_011205	T	6	6	1498211	1498216	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_011205	AAG	2	6	1499363	1499368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_011205	T	8	8	1499391	1499398	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_011205	T	6	6	1499404	1499409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_011205	T	7	7	1499433	1499439	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_011205	AAC	2	6	1499456	1499461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_011205	TCC	2	6	1499519	1499524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5021	NC_011205	TAA	2	6	1499535	1499540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_011205	A	6	6	1500355	1500360	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_011205	CTT	2	6	1504298	1504303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5024	NC_011205	A	6	6	1504324	1504329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_011205	A	6	6	1504336	1504341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_011205	GCC	2	6	1504423	1504428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5027	NC_011205	AG	3	6	1504431	1504436	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_011205	AGAC	2	8	1504458	1504465	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5029	NC_011205	T	6	6	1504489	1504494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_011205	TAA	2	6	1504520	1504525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_011205	TGA	2	6	1504543	1504548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_011205	ATCAA	2	10	1504608	1504617	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5033	NC_011205	GCG	2	6	1506049	1506054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5034	NC_011205	T	8	8	1506066	1506073	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_011205	ACA	2	6	1506088	1506093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5036	NC_011205	AAG	2	6	1506105	1506110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_011205	AG	3	6	1506109	1506114	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_011205	TTG	2	6	1506179	1506184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_011205	AATTT	2	10	1506211	1506220	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_011205	AT	4	8	1506239	1506246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_011205	CTC	3	9	1506255	1506263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5042	NC_011205	AGG	2	6	1506278	1506283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_011205	GC	3	6	1506287	1506292	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5044	NC_011205	AG	3	6	1506384	1506389	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_011205	CA	3	6	1506401	1506406	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5046	NC_011205	TC	3	6	1513084	1513089	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5047	NC_011205	CGG	2	6	1513109	1513114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5048	NC_011205	TGAT	2	8	1514921	1514928	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_011205	TGG	3	9	1514954	1514962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_011205	TCGAA	2	10	1515035	1515044	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5051	NC_011205	AG	3	6	1515076	1515081	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_011205	TGG	3	9	1515129	1515137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_011205	GC	3	6	1515158	1515163	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5054	NC_011205	TCGAA	2	10	1515209	1515218	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5055	NC_011205	GA	3	6	1515251	1515256	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_011205	TGG	3	9	1515303	1515311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_011205	GC	3	6	1515332	1515337	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5058	NC_011205	TCGAA	2	10	1515384	1515393	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5059	NC_011205	AG	3	6	1515425	1515430	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_011205	TGG	3	9	1515478	1515486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_011205	CCA	2	6	1515558	1515563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5062	NC_011205	TGG	3	9	1515597	1515605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_011205	ATT	2	6	1515613	1515618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_011205	TCGCT	2	10	1515621	1515630	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5065	NC_011205	TC	3	6	1515664	1515669	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5066	NC_011205	AAT	2	6	1515768	1515773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_011205	GGT	2	6	1515774	1515779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_011205	CAC	2	6	1515854	1515859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5069	NC_011205	TGC	2	6	1515875	1515880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5070	NC_011205	ATT	2	6	1515902	1515907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_011205	CTC	2	6	1515919	1515924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5072	NC_011205	TC	3	6	1515954	1515959	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5073	NC_011205	CAC	2	6	1516036	1516041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5074	NC_011205	CAT	2	6	1516088	1516093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5076	NC_011205	GA	3	6	1518648	1518653	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_011205	CGA	2	6	1519712	1519717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5078	NC_011205	T	6	6	1520795	1520800	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_011205	T	7	7	1520827	1520833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_011205	GTC	2	6	1520843	1520848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5081	NC_011205	A	8	8	1520865	1520872	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_011205	GCG	2	6	1520881	1520886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5083	NC_011205	GTA	2	6	1521327	1521332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_011205	GGT	2	6	1521351	1521356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_011205	TTG	2	6	1521357	1521362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5087	NC_011205	TTA	2	6	1521430	1521435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_011205	A	6	6	1521485	1521490	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_011205	G	6	6	1521504	1521509	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_011205	ATG	2	6	1521559	1521564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_011205	TGA	2	6	1521688	1521693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_011205	TTG	2	6	1521700	1521705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_011205	TA	3	6	1521741	1521746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_011205	CGCT	2	8	1521781	1521788	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5095	NC_011205	ACTC	2	8	1521823	1521830	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5096	NC_011205	GCC	2	6	1521835	1521840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5097	NC_011205	ATT	2	6	1521855	1521860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_011205	CGTCG	2	10	1521920	1521929	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5099	NC_011205	ATT	2	6	1522657	1522662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_011205	CCT	2	6	1522667	1522672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5101	NC_011205	GAT	2	6	1522704	1522709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_011205	A	7	7	1522749	1522755	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_011205	T	6	6	1525505	1525510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_011205	ATC	2	6	1525516	1525521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5106	NC_011205	GGT	2	6	1525580	1525585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_011205	TG	3	6	1525702	1525707	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_011205	CAG	2	6	1525742	1525747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5110	NC_011205	TCT	2	6	1525893	1525898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5111	NC_011205	CTG	2	6	1526613	1526618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5112	NC_011205	GGC	2	6	1526626	1526631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5113	NC_011205	GCC	2	6	1526642	1526647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5114	NC_011205	CTT	2	6	1526669	1526674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5115	NC_011205	TATT	2	8	1526729	1526736	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_011205	TTA	2	6	1526738	1526743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_011205	TAT	2	6	1526751	1526756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_011205	TTATT	2	10	1526792	1526801	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_011205	TGA	2	6	1526821	1526826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_011205	ATT	2	6	1526830	1526835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_011205	TTA	2	6	1526842	1526847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_011205	GTT	2	6	1526848	1526853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_011205	AAT	2	6	1526881	1526886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_011205	TG	4	8	1526903	1526910	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_011205	AG	3	6	1526943	1526948	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_011205	TTTC	2	8	1526954	1526961	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5127	NC_011205	T	7	7	1527013	1527019	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_011205	AGA	2	6	1527120	1527125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_011205	TTG	2	6	1527133	1527138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_011205	CGT	2	6	1527193	1527198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5131	NC_011205	CGA	2	6	1527208	1527213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5133	NC_011205	AATA	2	8	1527237	1527244	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5134	NC_011205	ACC	2	6	1527285	1527290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5143	NC_011205	TCAG	2	8	1534214	1534221	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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5260	NC_011205	GCG	2	6	1574471	1574476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5261	NC_011205	GTC	3	9	1574551	1574559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5262	NC_011205	TGA	2	6	1574574	1574579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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