MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853 chromosome

Total Repeats: 16792

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_011205	ATG	2	6	1391689	1391694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_011205	CTGG	2	8	1391721	1391728	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4503	NC_011205	T	7	7	1391789	1391795	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_011205	A	8	8	1391838	1391845	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_011205	GGA	2	6	1391856	1391861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_011205	CAA	2	6	1391878	1391883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4507	NC_011205	TGG	2	6	1392029	1392034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_011205	CGG	2	6	1392035	1392040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4509	NC_011205	ATGA	2	8	1392115	1392122	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_011205	GC	3	6	1392143	1392148	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4511	NC_011205	TCC	2	6	1392171	1392176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4512	NC_011205	AG	3	6	1392313	1392318	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_011205	CGA	2	6	1392371	1392376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4514	NC_011205	ACG	2	6	1392377	1392382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4515	NC_011205	GCA	2	6	1392386	1392391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4516	NC_011205	CGG	2	6	1392521	1392526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4517	NC_011205	CGT	2	6	1392570	1392575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4518	NC_011205	TC	3	6	1392617	1392622	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4519	NC_011205	TGAA	2	8	1392994	1393001	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_011205	GCGG	2	8	1393016	1393023	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4521	NC_011205	T	6	6	1393026	1393031	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_011205	GTA	2	6	1396048	1396053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_011205	TGC	2	6	1396059	1396064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4524	NC_011205	TA	3	6	1396072	1396077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_011205	GCA	2	6	1396078	1396083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4526	NC_011205	TAT	2	6	1396089	1396094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_011205	AGTT	2	8	1396148	1396155	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_011205	T	6	6	1396212	1396217	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_011205	TA	4	8	1396987	1396994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_011205	T	6	6	1397014	1397019	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_011205	TGAT	2	8	1397041	1397048	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_011205	A	6	6	1397056	1397061	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_011205	GATTA	2	10	1397068	1397077	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_011205	TATTTT	2	12	1397093	1397104	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_011205	A	6	6	1397117	1397122	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_011205	AGG	2	6	1397137	1397142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_011205	ATT	2	6	1397321	1397326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_011205	ATG	2	6	1397328	1397333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_011205	GACT	2	8	1398292	1398299	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4540	NC_011205	ATT	2	6	1398324	1398329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_011205	TGA	2	6	1398338	1398343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_011205	CTC	2	6	1398384	1398389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4543	NC_011205	ACTTA	2	10	1398401	1398410	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4544	NC_011205	GCA	2	6	1398469	1398474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4545	NC_011205	AGG	2	6	1398478	1398483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_011205	GAC	2	6	1398564	1398569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4547	NC_011205	CGT	2	6	1398597	1398602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4548	NC_011205	CGG	2	6	1398670	1398675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4549	NC_011205	TTG	2	6	1398752	1398757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_011205	CCA	2	6	1398805	1398810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4551	NC_011205	AT	3	6	1398828	1398833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_011205	TTAA	2	8	1398968	1398975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_011205	TTG	2	6	1399010	1399015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_011205	AAATT	2	10	1399146	1399155	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_011205	ATTT	2	8	1399160	1399167	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_011205	TCA	2	6	1401266	1401271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4557	NC_011205	TGC	2	6	1401328	1401333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4558	NC_011205	GTT	2	6	1401347	1401352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_011205	TCTG	2	8	1402343	1402350	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4560	NC_011205	AAC	2	6	1402375	1402380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4561	NC_011205	TTC	2	6	1402391	1402396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4562	NC_011205	CCT	2	6	1402428	1402433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4563	NC_011205	TG	3	6	1402652	1402657	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_011205	AAAT	2	8	1402693	1402700	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_011205	GC	3	6	1402922	1402927	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4566	NC_011205	CGG	2	6	1403243	1403248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4567	NC_011205	GGT	2	6	1403301	1403306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_011205	GGA	2	6	1403352	1403357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_011205	CGT	2	6	1403393	1403398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4570	NC_011205	CGG	2	6	1403444	1403449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4571	NC_011205	TGC	2	6	1403456	1403461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4572	NC_011205	ATC	2	6	1403511	1403516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4573	NC_011205	CGA	2	6	1403602	1403607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4574	NC_011205	ATT	2	6	1403622	1403627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_011205	CCT	2	6	1403803	1403808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4576	NC_011205	AGG	2	6	1403867	1403872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4578	NC_011205	GGT	2	6	1403971	1403976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_011205	A	6	6	1403983	1403988	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_011205	ATGA	2	8	1404013	1404020	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_011205	A	6	6	1404095	1404100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_011205	CTTCT	2	10	1404155	1404164	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
4583	NC_011205	ACAGG	2	10	1404186	1404195	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4584	NC_011205	CCAG	2	8	1404237	1404244	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4585	NC_011205	TTAT	2	8	1404276	1404283	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4586	NC_011205	GAA	2	6	1404293	1404298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4587	NC_011205	CTGT	2	8	1404302	1404309	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4588	NC_011205	CAG	2	6	1404398	1404403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4589	NC_011205	TCT	2	6	1404445	1404450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4590	NC_011205	T	6	6	1404450	1404455	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_011205	ATA	2	6	1404550	1404555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_011205	TAAA	2	8	1404645	1404652	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_011205	TAAA	2	8	1404676	1404683	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_011205	TAT	2	6	1404696	1404701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4595	NC_011205	ATTTT	2	10	1404702	1404711	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4596	NC_011205	AATT	2	8	1404719	1404726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_011205	TGGC	2	8	1404761	1404768	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4598	NC_011205	C	6	6	1404772	1404777	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4599	NC_011205	GGA	2	6	1404778	1404783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_011205	ATCA	2	8	1404819	1404826	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4601	NC_011205	ACTTC	2	10	1404827	1404836	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4602	NC_011205	AGCC	2	8	1404846	1404853	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4603	NC_011205	CGC	2	6	1404938	1404943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4604	NC_011205	GGC	2	6	1405280	1405285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4605	NC_011205	ATAA	2	8	1405326	1405333	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_011205	T	6	6	1405351	1405356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_011205	AT	3	6	1405412	1405417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_011205	TAA	2	6	1405450	1405455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_011205	TTA	2	6	1405467	1405472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_011205	AAC	2	6	1405495	1405500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4611	NC_011205	TCT	2	6	1405501	1405506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4612	NC_011205	TGT	2	6	1405509	1405514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_011205	CTG	2	6	1405518	1405523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4614	NC_011205	CAGC	2	8	1405526	1405533	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4615	NC_011205	GGT	2	6	1405559	1405564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_011205	GGC	2	6	1405597	1405602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4617	NC_011205	CAT	2	6	1405699	1405704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4618	NC_011205	TGG	2	6	1405921	1405926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_011205	GCAG	2	8	1405960	1405967	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4620	NC_011205	TTA	2	6	1405974	1405979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_011205	CAG	2	6	1405997	1406002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4622	NC_011205	ATT	2	6	1406009	1406014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_011205	ATG	2	6	1406016	1406021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_011205	GTGC	2	8	1406081	1406088	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4625	NC_011205	CAT	2	6	1406152	1406157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4626	NC_011205	CAT	2	6	1406169	1406174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4627	NC_011205	TTGAG	2	10	1406181	1406190	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4628	NC_011205	AGTT	2	8	1406222	1406229	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4629	NC_011205	CTA	2	6	1406240	1406245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4630	NC_011205	TGCT	2	8	1406351	1406358	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4631	NC_011205	AT	3	6	1406359	1406364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4632	NC_011205	AC	3	6	1407007	1407012	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4786	NC_011205	GC	3	6	1428768	1428773	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4805	NC_011205	ATT	2	6	1430229	1430234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4892	NC_011205	T	6	6	1457826	1457831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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