MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853 plasmid pCT02021853_74

Total Repeats: 62

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011204	GCAA	2	8	45	52	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_011204	GCTG	2	8	580	587	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_011204	GCAG	2	8	827	834	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_011204	CTGA	2	8	1080	1087	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_011204	GCCA	2	8	1185	1192	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_011204	CCGG	2	8	1345	1352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_011204	GCCA	2	8	1589	1596	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_011204	CCTG	2	8	1644	1651	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_011204	CTGA	2	8	2299	2306	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_011204	TCTG	2	8	2587	2594	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_011204	CAGC	2	8	2624	2631	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_011204	GGCT	2	8	2694	2701	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_011204	CAAA	2	8	3947	3954	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_011204	ACTA	2	8	3966	3973	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_011204	ACAA	2	8	3974	3981	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_011204	CGGG	2	8	4065	4072	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17	NC_011204	AGAC	2	8	4157	4164	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_011204	CAGG	2	8	4440	4447	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_011204	ACAG	2	8	4628	4635	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_011204	AAAT	2	8	4710	4717	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011204	TTCG	2	8	10799	10806	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_011204	GAAT	2	8	12392	12399	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011204	ATAA	2	8	12545	12552	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011204	AGTC	2	8	13689	13696	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_011204	CGGA	2	8	13900	13907	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_011204	TGGG	2	8	14052	14059	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011204	CGCC	2	8	14468	14475	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
28	NC_011204	GCGG	2	8	17387	17394	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
29	NC_011204	GTCA	2	8	18404	18411	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_011204	GCTG	2	8	18466	18473	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_011204	TGGC	2	8	18965	18972	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_011204	CAGC	2	8	19152	19159	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_011204	CTGC	2	8	19337	19344	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_011204	TAAT	2	8	29694	29701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011204	CTGA	2	8	29765	29772	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_011204	CTGC	2	8	29887	29894	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_011204	CCAC	2	8	30721	30728	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
38	NC_011204	TGAT	2	8	31486	31493	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011204	CTGG	2	8	33795	33802	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_011204	AGAA	2	8	34042	34049	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011204	CGAG	2	8	34270	34277	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_011204	GTCA	2	8	34347	34354	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_011204	TTTC	2	8	34384	34391	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_011204	CTGC	2	8	36030	36037	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_011204	GCCA	2	8	36259	36266	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_011204	ACTT	2	8	36657	36664	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_011204	GCCA	2	8	37068	37075	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_011204	ACGG	2	8	37186	37193	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_011204	CCAG	2	8	44707	44714	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_011204	ACTG	2	8	44780	44787	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_011204	CTAT	2	8	45299	45306	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_011204	AGAA	2	8	46836	46843	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011204	TATT	2	8	46848	46855	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011204	AATC	2	8	48173	48180	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_011204	TAAT	2	8	48266	48273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011204	AAAG	2	8	54925	54932	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011204	GGAT	2	8	64513	64520	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011204	AAAT	2	8	65043	65050	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011204	CGAA	2	8	70133	70140	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_011204	ATCA	2	8	70187	70194	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_011204	ACGA	2	8	72834	72841	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_011204	CTGT	2	8	73404	73411	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.