MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483 chromosome

Total Repeats: 14042

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011149	TTC	2	6	1286693	1286698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3502	NC_011149	CGT	2	6	1288948	1288953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3503	NC_011149	GCGCC	2	10	1288978	1288987	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3504	NC_011149	CAT	2	6	1288995	1289000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3505	NC_011149	GCC	2	6	1289686	1289691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3506	NC_011149	GCG	2	6	1289696	1289701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_011149	GGC	2	6	1290263	1290268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3508	NC_011149	TTC	2	6	1290326	1290331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3509	NC_011149	GGC	2	6	1290367	1290372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3510	NC_011149	GAG	2	6	1290412	1290417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_011149	AACC	2	8	1290431	1290438	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3512	NC_011149	A	6	6	1290496	1290501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_011149	AGT	2	6	1290519	1290524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_011149	TAA	2	6	1290540	1290545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_011149	AACC	2	8	1290719	1290726	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3516	NC_011149	T	6	6	1290754	1290759	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_011149	TCT	2	6	1290763	1290768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3518	NC_011149	T	6	6	1290811	1290816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_011149	TAG	2	6	1290828	1290833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_011149	GAC	2	6	1290843	1290848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3521	NC_011149	AGG	2	6	1290885	1290890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_011149	GTG	2	6	1291120	1291125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_011149	AAC	2	6	1291546	1291551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_011149	A	8	8	1291561	1291568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_011149	GT	3	6	1291584	1291589	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_011149	CAATT	2	10	1292163	1292172	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3527	NC_011149	GAAAT	2	10	1292189	1292198	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_011149	AG	3	6	1293859	1293864	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_011149	AGCG	2	8	1293866	1293873	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3530	NC_011149	CGA	2	6	1293874	1293879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3531	NC_011149	GCAA	2	8	1293882	1293889	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3532	NC_011149	TTC	2	6	1293942	1293947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3533	NC_011149	ATG	2	6	1293983	1293988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_011149	GCA	2	6	1294781	1294786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3535	NC_011149	TTG	2	6	1296339	1296344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_011149	CT	3	6	1296351	1296356	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3537	NC_011149	CCT	2	6	1296367	1296372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3538	NC_011149	A	6	6	1296395	1296400	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_011149	TCC	2	6	1296433	1296438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3540	NC_011149	A	6	6	1296451	1296456	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_011149	CAT	2	6	1296468	1296473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3542	NC_011149	A	6	6	1296562	1296567	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_011149	AAT	2	6	1296579	1296584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_011149	AGA	2	6	1296614	1296619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_011149	TAT	2	6	1300858	1300863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_011149	TTAACA	2	12	1300864	1300875	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3547	NC_011149	TAA	2	6	1300876	1300881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_011149	AT	3	6	1301883	1301888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_011149	T	6	6	1302028	1302033	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_011149	GTA	2	6	1302035	1302040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_011149	CTGG	2	8	1302044	1302051	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3552	NC_011149	CCG	2	6	1302080	1302085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3553	NC_011149	G	6	6	1302156	1302161	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_011149	CGG	2	6	1302202	1302207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3555	NC_011149	CGT	2	6	1302287	1302292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3556	NC_011149	TGGCG	2	10	1302299	1302308	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3557	NC_011149	ACC	2	6	1302314	1302319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3558	NC_011149	GCG	2	6	1302359	1302364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3559	NC_011149	GTC	2	6	1302434	1302439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3560	NC_011149	GAA	2	6	1302490	1302495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_011149	A	6	6	1302504	1302509	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_011149	T	6	6	1302533	1302538	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_011149	TGT	2	6	1302544	1302549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_011149	ATC	2	6	1302555	1302560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3565	NC_011149	CGC	2	6	1302564	1302569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3566	NC_011149	CAG	2	6	1302596	1302601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3567	NC_011149	AGAA	2	8	1303417	1303424	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_011149	ATAA	2	8	1303435	1303442	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_011149	CTA	2	6	1303837	1303842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3570	NC_011149	AGCCAA	2	12	1305587	1305598	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3571	NC_011149	TAG	2	6	1307104	1307109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_011149	T	6	6	1307139	1307144	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_011149	GGCA	2	8	1307169	1307176	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3574	NC_011149	AT	3	6	1307235	1307240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_011149	ATT	2	6	1307254	1307259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_011149	GGC	2	6	1307286	1307291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3577	NC_011149	CAG	2	6	1307502	1307507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3578	NC_011149	AG	3	6	1310263	1310268	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_011149	CG	3	6	1315909	1315914	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3580	NC_011149	A	7	7	1315971	1315977	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_011149	GT	3	6	1316011	1316016	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_011149	AGG	2	6	1316183	1316188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_011149	AAG	2	6	1316211	1316216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_011149	TGA	2	6	1316226	1316231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_011149	TA	3	6	1316236	1316241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_011149	ATG	2	6	1316244	1316249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_011149	A	6	6	1316271	1316276	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_011149	AAGAA	2	10	1317570	1317579	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_011149	GCT	2	6	1317735	1317740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3590	NC_011149	CGC	2	6	1317847	1317852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3591	NC_011149	GCG	2	6	1317855	1317860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3592	NC_011149	TAC	2	6	1317896	1317901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3593	NC_011149	GC	3	6	1317920	1317925	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3594	NC_011149	TGG	2	6	1317960	1317965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_011149	GT	3	6	1318041	1318046	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_011149	ATAA	2	8	1318521	1318528	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_011149	CAT	2	6	1319168	1319173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3598	NC_011149	CTA	2	6	1319209	1319214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3599	NC_011149	TTA	2	6	1319215	1319220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_011149	TGA	2	6	1319240	1319245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_011149	A	6	6	1319334	1319339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_011149	T	6	6	1319409	1319414	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_011149	ATTC	2	8	1319415	1319422	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3604	NC_011149	ATTAA	2	10	1319432	1319441	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_011149	GGT	2	6	1319528	1319533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_011149	ACA	2	6	1319669	1319674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3607	NC_011149	TTTA	2	8	1319725	1319732	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_011149	TACT	2	8	1319747	1319754	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3609	NC_011149	ACA	2	6	1319901	1319906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3610	NC_011149	TAA	2	6	1321029	1321034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_011149	TAT	2	6	1321041	1321046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_011149	TAT	2	6	1321082	1321087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_011149	T	6	6	1321709	1321714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_011149	CTGT	2	8	1321749	1321756	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3615	NC_011149	TAAAT	2	10	1321792	1321801	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_011149	ATT	2	6	1321816	1321821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_011149	AAC	2	6	1321955	1321960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3618	NC_011149	AAT	2	6	1323992	1323997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_011149	CAT	2	6	1324014	1324019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3620	NC_011149	AGG	2	6	1324042	1324047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_011149	A	7	7	1324077	1324083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_011149	CGC	2	6	1324086	1324091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3623	NC_011149	GAA	2	6	1325066	1325071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_011149	TGG	2	6	1325090	1325095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_011149	TGA	2	6	1326803	1326808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_011149	GCC	2	6	1326954	1326959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3627	NC_011149	ATC	2	6	1326992	1326997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3628	NC_011149	AGCG	2	8	1327003	1327010	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3629	NC_011149	CT	4	8	1327034	1327041	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3630	NC_011149	ATG	2	6	1327065	1327070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3631	NC_011149	TAC	2	6	1327098	1327103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3632	NC_011149	AC	3	6	1328375	1328380	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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