MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483 chromosome

Total Repeats: 14042

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_011149	ATT	2	6	536383	536388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_011149	GAAG	2	8	536419	536426	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_011149	TAT	2	6	536452	536457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_011149	GA	3	6	536498	536503	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_011149	GC	3	6	538188	538193	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1506	NC_011149	TA	3	6	538213	538218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_011149	CTT	2	6	538763	538768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_011149	A	6	6	538813	538818	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_011149	ATA	3	9	538900	538908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_011149	TCGG	2	8	539828	539835	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1511	NC_011149	A	7	7	540687	540693	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_011149	ATTTTT	2	12	540709	540720	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_011149	TA	3	6	540745	540750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_011149	TAA	2	6	540776	540781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_011149	TGC	2	6	540798	540803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_011149	TCA	2	6	543343	543348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_011149	CCT	2	6	545220	545225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1518	NC_011149	C	6	6	545295	545300	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1519	NC_011149	TTA	2	6	545301	545306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_011149	AAC	2	6	545340	545345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_011149	GAT	2	6	546812	546817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_011149	GAC	2	6	546844	546849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_011149	GC	3	6	546865	546870	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1524	NC_011149	AG	3	6	546880	546885	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_011149	GC	3	6	547790	547795	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1526	NC_011149	CGTT	2	8	548648	548655	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1527	NC_011149	GCC	2	6	548702	548707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1528	NC_011149	ATG	2	6	552413	552418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_011149	AAT	2	6	552421	552426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_011149	T	6	6	552456	552461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_011149	TAG	2	6	552492	552497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_011149	A	6	6	552509	552514	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_011149	ACA	2	6	552518	552523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_011149	TTA	2	6	552542	552547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_011149	CTAT	2	8	552574	552581	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1536	NC_011149	GCCT	2	8	553815	553822	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1537	NC_011149	AC	3	6	553836	553841	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1538	NC_011149	CAT	2	6	553849	553854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_011149	AAT	2	6	553857	553862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_011149	CAG	2	6	553871	553876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_011149	TTTG	2	8	553909	553916	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_011149	ATC	2	6	557664	557669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_011149	CCT	2	6	558649	558654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1544	NC_011149	AGT	2	6	558697	558702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_011149	ATA	2	6	558708	558713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_011149	CTT	2	6	559359	559364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1547	NC_011149	CGCT	2	8	560255	560262	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1548	NC_011149	T	6	6	560273	560278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_011149	AAT	2	6	562908	562913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_011149	T	8	8	562925	562932	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_011149	GAA	2	6	563938	563943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_011149	AAT	2	6	565194	565199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_011149	CTA	2	6	565205	565210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_011149	TTTAT	2	10	565215	565224	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_011149	ATTT	2	8	565225	565232	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_011149	AAC	2	6	565254	565259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_011149	CGT	2	6	568202	568207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_011149	ACG	2	6	568209	568214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1559	NC_011149	A	7	7	570715	570721	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_011149	AGG	2	6	570773	570778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_011149	CCG	2	6	570784	570789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1562	NC_011149	ACG	2	6	573908	573913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_011149	AAAAT	2	10	573946	573955	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_011149	A	7	7	573977	573983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_011149	ATTT	2	8	573994	574001	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_011149	TAAA	2	8	574031	574038	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_011149	T	6	6	574043	574048	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_011149	GTT	2	6	574075	574080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_011149	TAA	2	6	574094	574099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_011149	AT	3	6	574138	574143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_011149	TGCAAT	2	12	574172	574183	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1572	NC_011149	ATT	2	6	574191	574196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_011149	GTT	2	6	574202	574207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_011149	GCG	2	6	578869	578874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1575	NC_011149	GCC	2	6	578886	578891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1576	NC_011149	GCT	2	6	580504	580509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1577	NC_011149	CGA	2	6	580581	580586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1578	NC_011149	AG	3	6	581828	581833	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_011149	TGC	2	6	581912	581917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1580	NC_011149	AAT	2	6	581928	581933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_011149	ATT	2	6	581949	581954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_011149	CA	3	6	581958	581963	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1583	NC_011149	GAT	2	6	585266	585271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_011149	AAAG	2	8	585279	585286	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_011149	AG	3	6	586418	586423	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_011149	CCGT	2	8	586531	586538	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1587	NC_011149	GC	3	6	586565	586570	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1588	NC_011149	TCA	2	6	586595	586600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_011149	TCG	2	6	586626	586631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1590	NC_011149	GGC	2	6	586644	586649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_011149	CTT	2	6	586685	586690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1592	NC_011149	T	6	6	586738	586743	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_011149	TTA	2	6	586763	586768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_011149	ATTA	2	8	586796	586803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_011149	TAAT	2	8	586837	586844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_011149	ATCT	2	8	586852	586859	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1597	NC_011149	ATA	2	6	586900	586905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_011149	GT	4	8	586939	586946	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_011149	AGGGA	2	10	587538	587547	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_011149	CAG	2	6	587589	587594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1601	NC_011149	GGCGC	2	10	587607	587616	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1602	NC_011149	T	6	6	588163	588168	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_011149	AG	3	6	588867	588872	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_011149	TCG	2	6	593088	593093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1605	NC_011149	AC	3	6	593818	593823	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1606	NC_011149	CA	3	6	593824	593829	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1607	NC_011149	AAT	2	6	593837	593842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_011149	TAA	2	6	593886	593891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_011149	CAA	2	6	593916	593921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_011149	A	6	6	593920	593925	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_011149	GTG	2	6	594049	594054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_011149	AGT	2	6	594082	594087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_011149	TGT	2	6	594094	594099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_011149	ATA	2	6	594114	594119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_011149	TAA	2	6	594150	594155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_011149	A	6	6	594183	594188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_011149	GAG	2	6	594190	594195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_011149	A	7	7	594215	594221	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_011149	A	6	6	594308	594313	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_011149	CTG	2	6	595194	595199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1621	NC_011149	A	8	8	595200	595207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_011149	GA	3	6	595270	595275	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_011149	ATGA	2	8	595316	595323	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_011149	TCCTT	2	10	595358	595367	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1625	NC_011149	TAA	2	6	595368	595373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_011149	CCA	2	6	595385	595390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1627	NC_011149	CTC	2	6	595395	595400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1628	NC_011149	ATG	2	6	595410	595415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_011149	AT	3	6	595421	595426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_011149	CAT	2	6	595460	595465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1631	NC_011149	A	7	7	595478	595484	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_011149	ATT	2	6	595507	595512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_011149	CTTCA	2	10	596390	596399	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1634	NC_011149	GC	3	6	596473	596478	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1635	NC_011149	CTT	2	6	596502	596507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1636	NC_011149	TCC	2	6	596512	596517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1637	NC_011149	CAT	2	6	596546	596551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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