MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483 chromosome

Total Repeats: 14042

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_011149	AAG	2	6	2039958	2039963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_011149	T	6	6	2040001	2040006	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_011149	CCG	2	6	2040069	2040074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6004	NC_011149	ATA	2	6	2040384	2040389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_011149	CT	3	6	2040401	2040406	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6006	NC_011149	ACC	2	6	2040410	2040415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6007	NC_011149	CAC	2	6	2040429	2040434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6008	NC_011149	CAG	2	6	2040444	2040449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6009	NC_011149	AAG	2	6	2040547	2040552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_011149	TGGA	2	8	2040572	2040579	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_011149	CCA	2	6	2040602	2040607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6012	NC_011149	CAG	2	6	2040669	2040674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6013	NC_011149	GCC	2	6	2040748	2040753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6014	NC_011149	GAT	2	6	2040890	2040895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_011149	AGC	3	9	2040909	2040917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6016	NC_011149	CAA	2	6	2040919	2040924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6017	NC_011149	ATG	2	6	2040945	2040950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_011149	GCG	2	6	2041038	2041043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6019	NC_011149	CAG	2	6	2041046	2041051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6020	NC_011149	AAC	2	6	2041119	2041124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6021	NC_011149	CAAG	2	8	2041129	2041136	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6022	NC_011149	CCAG	2	8	2041156	2041163	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6023	NC_011149	TGACC	2	10	2041204	2041213	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6024	NC_011149	GCA	3	9	2041234	2041242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6025	NC_011149	AAT	2	6	2041247	2041252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_011149	ACCG	2	8	2041271	2041278	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6027	NC_011149	CCG	2	6	2041305	2041310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6028	NC_011149	ACC	2	6	2041332	2041337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6029	NC_011149	A	6	6	2043217	2043222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_011149	TAAAT	2	10	2043231	2043240	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_011149	ATT	2	6	2043637	2043642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_011149	GGC	2	6	2044511	2044516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6033	NC_011149	ATT	2	6	2044541	2044546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_011149	AAT	2	6	2044548	2044553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_011149	AATT	2	8	2044556	2044563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_011149	TAA	2	6	2044575	2044580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_011149	G	6	6	2044603	2044608	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_011149	AAT	2	6	2044610	2044615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_011149	CAT	2	6	2044654	2044659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6040	NC_011149	AAAT	2	8	2044701	2044708	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_011149	TAT	2	6	2044713	2044718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_011149	A	6	6	2044729	2044734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_011149	AG	3	6	2044804	2044809	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_011149	TC	3	6	2044846	2044851	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6045	NC_011149	TGG	2	6	2044867	2044872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_011149	CTA	2	6	2044945	2044950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6047	NC_011149	CGA	2	6	2045164	2045169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6048	NC_011149	A	6	6	2045234	2045239	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_011149	CGG	2	6	2045244	2045249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6050	NC_011149	GCC	2	6	2045255	2045260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6051	NC_011149	AAC	2	6	2045279	2045284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6052	NC_011149	CAC	2	6	2045314	2045319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6053	NC_011149	GAT	2	6	2045363	2045368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_011149	GCA	2	6	2045401	2045406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6055	NC_011149	CAT	2	6	2045416	2045421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6056	NC_011149	GCA	2	6	2045434	2045439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6057	NC_011149	CTGA	2	8	2045444	2045451	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6058	NC_011149	CAC	2	6	2045482	2045487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6059	NC_011149	TCC	2	6	2045488	2045493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6060	NC_011149	CAG	2	6	2045564	2045569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6061	NC_011149	ATCTGG	2	12	2045817	2045828	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6062	NC_011149	TGG	2	6	2045961	2045966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_011149	CG	3	6	2045982	2045987	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6064	NC_011149	CCA	2	6	2046010	2046015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6065	NC_011149	AGC	2	6	2046023	2046028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6066	NC_011149	GGC	2	6	2046034	2046039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6067	NC_011149	TGA	2	6	2046078	2046083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_011149	TGG	2	6	2046089	2046094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_011149	ACA	2	6	2046151	2046156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6070	NC_011149	ATA	2	6	2046169	2046174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_011149	T	6	6	2046244	2046249	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_011149	ATT	2	6	2046448	2046453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_011149	ATT	2	6	2046484	2046489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_011149	TATC	2	8	2046513	2046520	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6075	NC_011149	T	7	7	2046528	2046534	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_011149	AG	3	6	2046557	2046562	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_011149	TCT	2	6	2046587	2046592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6078	NC_011149	TAAA	2	8	2046602	2046609	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_011149	ATTT	2	8	2046618	2046625	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_011149	TA	3	6	2046645	2046650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6081	NC_011149	AT	3	6	2046668	2046673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_011149	CGA	2	6	2046677	2046682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6083	NC_011149	T	6	6	2046743	2046748	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_011149	TA	3	6	2046765	2046770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6085	NC_011149	ATAA	2	8	2046798	2046805	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6086	NC_011149	TAA	2	6	2046827	2046832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6087	NC_011149	GGA	2	6	2046863	2046868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6088	NC_011149	AGT	2	6	2047812	2047817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_011149	ATTAT	2	10	2047837	2047846	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6090	NC_011149	GGC	2	6	2047859	2047864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6091	NC_011149	ATC	2	6	2048928	2048933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6092	NC_011149	A	7	7	2048962	2048968	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_011149	C	8	8	2049887	2049894	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6094	NC_011149	TAA	2	6	2049908	2049913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_011149	TGT	2	6	2049983	2049988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_011149	TA	3	6	2050041	2050046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_011149	TA	3	6	2051592	2051597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6098	NC_011149	T	6	6	2053051	2053056	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_011149	AT	4	8	2053107	2053114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_011149	A	6	6	2053383	2053388	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_011149	GCCT	2	8	2053625	2053632	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6102	NC_011149	AGC	2	6	2053673	2053678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6103	NC_011149	ATG	2	6	2053684	2053689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_011149	TC	3	6	2053719	2053724	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6105	NC_011149	CTG	2	6	2053839	2053844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6106	NC_011149	AG	3	6	2053964	2053969	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_011149	ACT	2	6	2054085	2054090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6108	NC_011149	CCTT	2	8	2055073	2055080	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6109	NC_011149	T	6	6	2055110	2055115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_011149	TAA	2	6	2056230	2056235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_011149	GTC	2	6	2069300	2069305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6112	NC_011149	GGT	2	6	2071661	2071666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_011149	GTT	2	6	2071737	2071742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_011149	CAGG	2	8	2071755	2071762	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6115	NC_011149	TCT	2	6	2071763	2071768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6116	NC_011149	TCC	2	6	2071778	2071783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6117	NC_011149	GTC	2	6	2071826	2071831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6118	NC_011149	CAG	2	6	2071839	2071844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6119	NC_011149	TAA	2	6	2071941	2071946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_011149	TAA	2	6	2072055	2072060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_011149	TCA	2	6	2072086	2072091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6122	NC_011149	TAT	2	6	2072129	2072134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_011149	TTG	2	6	2072136	2072141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_011149	TTTC	2	8	2072175	2072182	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6125	NC_011149	AAACA	2	10	2073182	2073191	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
6126	NC_011149	ATT	2	6	2073193	2073198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6127	NC_011149	TTA	2	6	2073211	2073216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6128	NC_011149	CAT	2	6	2073337	2073342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6129	NC_011149	GCC	2	6	2074248	2074253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6130	NC_011149	TTG	2	6	2074260	2074265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6131	NC_011149	GCCT	2	8	2074277	2074284	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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6395	NC_011149	TCA	2	6	2196144	2196149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6399	NC_011149	T	6	6	2197690	2197695	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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