MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483 chromosome

Total Repeats: 14042

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_011149	CT	3	6	1588885	1588890	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4502	NC_011149	TTTTA	2	10	1589471	1589480	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_011149	CTTTT	2	10	1590742	1590751	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4504	NC_011149	ATA	2	6	1591264	1591269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_011149	GA	3	6	1591279	1591284	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_011149	ATT	2	6	1594045	1594050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_011149	CTT	2	6	1594056	1594061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4508	NC_011149	TTAT	2	8	1594065	1594072	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_011149	AAT	2	6	1595678	1595683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_011149	AG	3	6	1595759	1595764	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_011149	GCATG	2	10	1598134	1598143	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4512	NC_011149	TAAT	2	8	1598916	1598923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_011149	CCG	2	6	1598949	1598954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4514	NC_011149	TTGT	2	8	1600110	1600117	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_011149	TGGAT	2	10	1600122	1600131	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_011149	AT	3	6	1600134	1600139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_011149	TAAT	2	8	1600172	1600179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_011149	TAA	2	6	1600200	1600205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_011149	CA	3	6	1600413	1600418	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4520	NC_011149	GTT	2	6	1600427	1600432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_011149	CTA	2	6	1600453	1600458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4522	NC_011149	ATG	2	6	1600491	1600496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_011149	ACTA	2	8	1600502	1600509	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4524	NC_011149	AC	3	6	1605465	1605470	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4525	NC_011149	A	6	6	1607778	1607783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_011149	ATA	2	6	1607805	1607810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_011149	AAT	2	6	1607826	1607831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_011149	AGG	2	6	1607863	1607868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_011149	CG	3	6	1609105	1609110	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4530	NC_011149	CTG	2	6	1609202	1609207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4531	NC_011149	TAA	2	6	1609208	1609213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_011149	CTT	2	6	1609335	1609340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4533	NC_011149	ATTT	2	8	1609369	1609376	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_011149	TAC	2	6	1609403	1609408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4535	NC_011149	CTT	2	6	1609419	1609424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4536	NC_011149	TAA	2	6	1609516	1609521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_011149	ACA	3	9	1609542	1609550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4538	NC_011149	ACAA	2	8	1609592	1609599	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4539	NC_011149	ACT	2	6	1609619	1609624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4540	NC_011149	T	6	6	1609655	1609660	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_011149	TCA	2	6	1610387	1610392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4542	NC_011149	ATT	2	6	1610449	1610454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_011149	ACC	2	6	1610558	1610563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4544	NC_011149	GAC	2	6	1610672	1610677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4545	NC_011149	GTT	2	6	1610692	1610697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_011149	AAATA	2	10	1610707	1610716	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_011149	GCG	3	9	1610734	1610742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4548	NC_011149	GCCA	2	8	1610747	1610754	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4549	NC_011149	TCA	2	6	1610930	1610935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4550	NC_011149	GTT	2	6	1610942	1610947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_011149	ATC	2	6	1610978	1610983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4552	NC_011149	ATT	2	6	1611031	1611036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_011149	GCA	2	6	1611123	1611128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4554	NC_011149	ATA	2	6	1611131	1611136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_011149	AGAA	2	8	1611145	1611152	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_011149	TGT	2	6	1611230	1611235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_011149	CAG	2	6	1611259	1611264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4558	NC_011149	A	6	6	1611267	1611272	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_011149	CCCTG	2	10	1611331	1611340	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4560	NC_011149	T	7	7	1611348	1611354	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_011149	A	8	8	1611376	1611383	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_011149	TGT	2	6	1611396	1611401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_011149	AT	3	6	1611429	1611434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_011149	GCT	2	6	1611446	1611451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4565	NC_011149	ACG	2	6	1611492	1611497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4566	NC_011149	TTCT	2	8	1614253	1614260	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4567	NC_011149	CAT	2	6	1614283	1614288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4568	NC_011149	AAT	2	6	1614316	1614321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_011149	GAC	2	6	1616565	1616570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4570	NC_011149	ATTA	2	8	1617477	1617484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_011149	A	6	6	1617940	1617945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_011149	T	7	7	1618610	1618616	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_011149	CCG	2	6	1618640	1618645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4574	NC_011149	TCT	2	6	1618682	1618687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4575	NC_011149	ATT	2	6	1619617	1619622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_011149	CTTTT	2	10	1619673	1619682	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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4578	NC_011149	AC	3	6	1619706	1619711	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4579	NC_011149	CAT	2	6	1619765	1619770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4580	NC_011149	CAGG	2	8	1619821	1619828	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4581	NC_011149	TA	3	6	1621070	1621075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_011149	CTG	2	6	1621091	1621096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4583	NC_011149	AAAT	2	8	1621165	1621172	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_011149	T	6	6	1621225	1621230	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_011149	A	6	6	1621231	1621236	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4586	NC_011149	TGC	2	6	1621398	1621403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4587	NC_011149	GGCA	2	8	1621436	1621443	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4588	NC_011149	A	8	8	1621443	1621450	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_011149	CCG	2	6	1621451	1621456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4590	NC_011149	GC	3	6	1621703	1621708	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4591	NC_011149	CT	3	6	1622104	1622109	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4592	NC_011149	TAA	2	6	1622113	1622118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_011149	AAT	2	6	1622324	1622329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_011149	T	6	6	1622338	1622343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4595	NC_011149	CGC	2	6	1622381	1622386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4596	NC_011149	ATAAA	2	10	1622415	1622424	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_011149	GAA	2	6	1622439	1622444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_011149	AAT	2	6	1623015	1623020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_011149	A	7	7	1623057	1623063	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_011149	AT	3	6	1623104	1623109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_011149	CAG	2	6	1623121	1623126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4602	NC_011149	ATG	3	9	1623327	1623335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_011149	ATATG	2	10	1623347	1623356	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_011149	TCT	2	6	1623357	1623362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4605	NC_011149	ATT	2	6	1623425	1623430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_011149	AT	3	6	1623457	1623462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_011149	T	6	6	1623462	1623467	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_011149	TAA	2	6	1623490	1623495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4610	NC_011149	TCA	2	6	1623596	1623601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4611	NC_011149	GTT	2	6	1623627	1623632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_011149	AAC	2	6	1623644	1623649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4613	NC_011149	CGC	2	6	1625791	1625796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4614	NC_011149	ACA	2	6	1625810	1625815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4615	NC_011149	TG	3	6	1625834	1625839	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_011149	ACC	2	6	1626660	1626665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4617	NC_011149	CAAAAA	2	12	1627482	1627493	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4618	NC_011149	A	8	8	1627489	1627496	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_011149	TAC	2	6	1627787	1627792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4620	NC_011149	ATT	2	6	1630886	1630891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_011149	CTA	2	6	1633191	1633196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4622	NC_011149	CG	3	6	1633250	1633255	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4623	NC_011149	ATA	2	6	1633619	1633624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_011149	GGT	2	6	1633699	1633704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4625	NC_011149	TGT	2	6	1633734	1633739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4626	NC_011149	ATC	2	6	1635457	1635462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4627	NC_011149	CCT	3	9	1635842	1635850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4628	NC_011149	TAA	2	6	1635890	1635895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4629	NC_011149	CAT	2	6	1635925	1635930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4630	NC_011149	TAA	2	6	1635939	1635944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4631	NC_011149	AT	3	6	1635962	1635967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4633	NC_011149	GAGT	2	8	1635989	1635996	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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