MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. AKU_12601 chromosome

Total Repeats: 2053

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011147	AGAC	2	8	192	199	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_011147	CTGT	2	8	8705	8712	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_011147	ATTT	2	8	11409	11416	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011147	TCTG	2	8	11430	11437	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_011147	GTAT	2	8	14798	14805	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011147	AATA	2	8	18029	18036	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011147	GGGC	2	8	18615	18622	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8	NC_011147	CGTG	2	8	19315	19322	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_011147	TTAT	2	8	23298	23305	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011147	TGAT	2	8	35062	35069	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011147	ATTA	2	8	38795	38802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011147	AATT	2	8	40075	40082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011147	GCGG	2	8	40566	40573	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14	NC_011147	CTGG	2	8	40784	40791	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_011147	CCGA	2	8	41301	41308	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_011147	ATCG	2	8	41437	41444	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_011147	TCAA	2	8	41498	41505	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_011147	TGAC	2	8	46048	46055	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_011147	TACC	2	8	48327	48334	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_011147	AGTA	2	8	51943	51950	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011147	ATCA	2	8	51983	51990	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_011147	GAAA	2	8	52103	52110	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011147	GAGG	2	8	52135	52142	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011147	TACT	2	8	63482	63489	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_011147	TTTC	2	8	63490	63497	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_011147	TAAT	2	8	68464	68471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011147	TTAA	2	8	68495	68502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011147	ATAA	2	8	74914	74921	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011147	CAGT	2	8	75408	75415	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_011147	ACTT	2	8	75490	75497	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_011147	ACTG	2	8	75614	75621	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_011147	AGTG	2	8	75643	75650	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011147	ATTT	2	8	88023	88030	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011147	GTTT	2	8	88050	88057	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011147	TTTC	2	8	88319	88326	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_011147	CAGG	2	8	93727	93734	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_011147	CTGC	2	8	94385	94392	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_011147	TGCC	2	8	94413	94420	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_011147	CCAT	2	8	94966	94973	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_011147	TTTC	2	8	95418	95425	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_011147	TTAT	2	8	95603	95610	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011147	CAGG	2	8	98256	98263	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_011147	ATGG	2	8	98418	98425	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011147	ATCA	2	8	105736	105743	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_011147	TATT	2	8	108107	108114	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011147	AATG	2	8	109209	109216	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011147	CTGA	2	8	117747	117754	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_011147	ATGA	2	8	117844	117851	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011147	GTTC	2	8	117852	117859	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_011147	TTTA	2	8	118001	118008	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011147	GTTT	2	8	118134	118141	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011147	TAAT	2	8	118142	118149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011147	TAAA	2	8	118225	118232	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011147	TCCA	2	8	122855	122862	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_011147	CAGG	2	8	122909	122916	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_011147	CTGG	2	8	130190	130197	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_011147	TTTG	2	8	135349	135356	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011147	TTTG	2	8	135660	135667	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011147	TTGC	2	8	135895	135902	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_011147	AGCG	2	8	137321	137328	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_011147	CAGG	2	8	139683	139690	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_011147	CAAA	2	8	140923	140930	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_011147	CTTT	2	8	141005	141012	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_011147	CTTG	2	8	141405	141412	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_011147	CTGG	2	8	168371	168378	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_011147	ATTT	2	8	178120	178127	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011147	AAAG	2	8	178237	178244	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011147	TCAA	2	8	178476	178483	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_011147	TAGA	2	8	179488	179495	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011147	CGGC	2	8	184096	184103	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_011147	TGTC	2	8	185875	185882	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_011147	TGCC	2	8	188786	188793	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_011147	TTGA	2	8	192457	192464	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011147	GAAT	2	8	203031	203038	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011147	AAGT	2	8	204482	204489	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011147	CCCT	2	8	214333	214340	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
77	NC_011147	CCAT	2	8	215138	215145	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_011147	ATAA	2	8	215203	215210	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011147	TTAT	2	8	215220	215227	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011147	AACG	2	8	220653	220660	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_011147	ACGC	2	8	221254	221261	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_011147	ATAA	2	8	227826	227833	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011147	CCTT	2	8	227856	227863	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_011147	TGTC	2	8	228084	228091	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_011147	GAAA	2	8	228570	228577	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011147	GGCT	2	8	228820	228827	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_011147	AGCA	2	8	229063	229070	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_011147	TCTT	2	8	229753	229760	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_011147	CTTT	2	8	229949	229956	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_011147	AAAT	2	8	234506	234513	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011147	AAAT	2	8	234584	234591	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011147	CTTG	2	8	234680	234687	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_011147	TTTG	2	8	234689	234696	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011147	TATT	2	8	234716	234723	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011147	TAAA	2	8	234744	234751	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011147	TTAT	2	8	234806	234813	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011147	GGCG	2	8	236345	236352	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
98	NC_011147	GCGG	2	8	236540	236547	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
99	NC_011147	ATAA	2	8	254442	254449	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011147	TCAG	2	8	258095	258102	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_011147	GAAA	2	8	260455	260462	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011147	TTAG	2	8	266542	266549	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011147	GCAG	2	8	278334	278341	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_011147	AATG	2	8	289596	289603	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011147	ATCA	2	8	292336	292343	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_011147	CGGT	2	8	293114	293121	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_011147	CCGG	2	8	294496	294503	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_011147	GTAG	2	8	294795	294802	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011147	CTGA	2	8	295851	295858	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_011147	GTAC	2	8	295935	295942	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_011147	CGTC	2	8	296378	296385	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_011147	AAAG	2	8	296501	296508	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011147	AGTC	2	8	297164	297171	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_011147	GCTG	2	8	297182	297189	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_011147	CGCC	2	8	298680	298687	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
116	NC_011147	GACG	2	8	298728	298735	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_011147	ACCC	2	8	298893	298900	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
118	NC_011147	TTTA	2	8	299439	299446	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011147	CCGA	2	8	308865	308872	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_011147	ACAA	2	8	315056	315063	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_011147	TTGC	2	8	315111	315118	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_011147	CATT	2	8	321174	321181	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_011147	CGGG	2	8	325039	325046	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
124	NC_011147	TGGA	2	8	331533	331540	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011147	CAGA	2	8	338750	338757	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_011147	TGCC	2	8	338925	338932	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_011147	GATT	2	8	348312	348319	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011147	TGGA	2	8	349154	349161	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011147	GGCG	2	8	349633	349640	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
130	NC_011147	TGGT	2	8	349871	349878	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011147	AAAG	2	8	350148	350155	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011147	GGGA	2	8	353202	353209	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011147	AAAT	2	8	360293	360300	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011147	TAAG	2	8	363281	363288	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011147	TCTG	2	8	371381	371388	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_011147	TGGC	2	8	373696	373703	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_011147	GAAT	2	8	382928	382935	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011147	CATT	2	8	387848	387855	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_011147	TAAC	2	8	388032	388039	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_011147	GGGC	2	8	388057	388064	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
141	NC_011147	GTTC	2	8	390326	390333	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_011147	ATAA	2	8	395555	395562	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011147	TCTT	2	8	395565	395572	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_011147	TTTA	2	8	395573	395580	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011147	GTTA	2	8	395644	395651	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011147	TTTA	2	8	395698	395705	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011147	CCTG	2	8	395829	395836	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
148	NC_011147	GCTG	2	8	396428	396435	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
149	NC_011147	CCTG	2	8	396996	397003	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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151	NC_011147	GAAT	2	8	405485	405492	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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