MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. AKU_12601 chromosome

Total Repeats: 16372

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_011147	AAC	2	6	1127065	1127070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4002	NC_011147	A	8	8	1127080	1127087	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_011147	GT	3	6	1127103	1127108	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_011147	CAATT	2	10	1127682	1127691	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4005	NC_011147	GAAAT	2	10	1127708	1127717	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_011147	AG	3	6	1129378	1129383	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_011147	AGCG	2	8	1129385	1129392	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4008	NC_011147	CGA	2	6	1129393	1129398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_011147	GCAA	2	8	1129401	1129408	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4010	NC_011147	TTC	2	6	1129461	1129466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_011147	ATG	2	6	1129502	1129507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_011147	GCA	2	6	1130300	1130305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_011147	TTG	2	6	1131858	1131863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_011147	CT	3	6	1131870	1131875	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4015	NC_011147	CCT	2	6	1131886	1131891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4016	NC_011147	A	6	6	1131914	1131919	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_011147	TCC	2	6	1131952	1131957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4018	NC_011147	A	7	7	1131970	1131976	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_011147	CAT	2	6	1131987	1131992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4020	NC_011147	A	6	6	1132081	1132086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_011147	AAT	2	6	1132098	1132103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_011147	AGA	2	6	1132133	1132138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_011147	TAT	2	6	1136377	1136382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_011147	TTAACA	2	12	1136383	1136394	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4025	NC_011147	TAA	2	6	1136395	1136400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_011147	AT	3	6	1137402	1137407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_011147	ATT	2	6	1138151	1138156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_011147	A	6	6	1138199	1138204	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_011147	CCG	2	6	1138229	1138234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4031	NC_011147	ATCA	2	8	1138293	1138300	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4032	NC_011147	CGCT	2	8	1138306	1138313	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4033	NC_011147	GAA	2	6	1138340	1138345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_011147	GTTCA	2	10	1138362	1138371	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4035	NC_011147	GC	3	6	1138427	1138432	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4036	NC_011147	ACGTA	2	10	1138467	1138476	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4037	NC_011147	GTG	2	6	1138492	1138497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_011147	TAA	2	6	1138504	1138509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_011147	GCG	2	6	1138520	1138525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4040	NC_011147	TGA	2	6	1138566	1138571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_011147	TTTA	2	8	1138812	1138819	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_011147	T	7	7	1138852	1138858	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_011147	AGAA	2	8	1138935	1138942	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_011147	ATAA	2	8	1138953	1138960	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_011147	CTA	2	6	1139355	1139360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4047	NC_011147	AACA	2	8	1141185	1141192	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4048	NC_011147	GC	4	8	1141220	1141227	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4049	NC_011147	A	6	6	1141250	1141255	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_011147	T	6	6	1142657	1142662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_011147	GGCA	2	8	1142687	1142694	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4052	NC_011147	GTC	2	6	1142876	1142881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_011147	CGG	2	6	1142886	1142891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4054	NC_011147	CGCTCC	2	12	1143056	1143067	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
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4057	NC_011147	TGT	2	6	1150256	1150261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_011147	GTTG	2	8	1150275	1150282	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_011147	CGCC	2	8	1150311	1150318	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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4062	NC_011147	GGA	2	6	1150495	1150500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_011147	GGT	2	6	1150513	1150518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4065	NC_011147	TCA	2	6	1150568	1150573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4066	NC_011147	GCGG	2	8	1150816	1150823	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4067	NC_011147	AGG	2	6	1150839	1150844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_011147	ATA	2	6	1150862	1150867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_011147	CGG	2	6	1150881	1150886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4071	NC_011147	CGG	2	6	1150940	1150945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4084	NC_011147	GT	3	6	1151518	1151523	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4089	NC_011147	ATG	2	6	1151751	1151756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4091	NC_011147	A	7	7	1153080	1153086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_011147	TAT	2	6	1153136	1153141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_011147	A	6	6	1153147	1153152	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_011147	ACA	2	6	1153219	1153224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4096	NC_011147	TAT	2	6	1154400	1154405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_011147	CTGT	2	8	1155067	1155074	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4098	NC_011147	TAAAT	2	10	1155110	1155119	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_011147	ATT	2	6	1155134	1155139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_011147	AAC	2	6	1155273	1155278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4101	NC_011147	AAT	2	6	1157310	1157315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_011147	CAT	2	6	1157332	1157337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4103	NC_011147	AGG	2	6	1157360	1157365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_011147	A	7	7	1157395	1157401	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4108	NC_011147	TTCA	2	8	1158541	1158548	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4109	NC_011147	AT	3	6	1158596	1158601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_011147	TGA	2	6	1160121	1160126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_011147	AAT	2	6	1160148	1160153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_011147	CGC	2	6	1160216	1160221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4113	NC_011147	GCC	2	6	1160272	1160277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4114	NC_011147	ATC	2	6	1160310	1160315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4115	NC_011147	AGCG	2	8	1160321	1160328	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4116	NC_011147	CT	4	8	1160352	1160359	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4117	NC_011147	ATG	2	6	1160383	1160388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_011147	TAC	2	6	1160416	1160421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_011147	AC	3	6	1161693	1161698	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4120	NC_011147	T	6	6	1161704	1161709	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_011147	T	6	6	1165780	1165785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_011147	AAG	2	6	1166932	1166937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_011147	T	7	7	1166960	1166966	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_011147	GTT	2	6	1166968	1166973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_011147	T	6	6	1166972	1166977	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_011147	T	7	7	1167001	1167007	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_011147	TCC	2	6	1167087	1167092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4128	NC_011147	TAA	2	6	1167103	1167108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_011147	TTC	2	6	1167202	1167207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4130	NC_011147	AAG	2	6	1167232	1167237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4132	NC_011147	TCG	2	6	1167278	1167283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4141	NC_011147	A	6	6	1171904	1171909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4266	NC_011147	GAT	2	6	1205526	1205531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4267	NC_011147	CAT	2	6	1206096	1206101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4269	NC_011147	AGCC	2	8	1207426	1207433	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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4274	NC_011147	A	6	6	1208335	1208340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4387	NC_011147	ATC	2	6	1233067	1233072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4389	NC_011147	CATTTC	2	12	1233085	1233096	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4390	NC_011147	GTT	2	6	1233508	1233513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4391	NC_011147	TGT	2	6	1233519	1233524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4392	NC_011147	GGT	2	6	1233546	1233551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4393	NC_011147	A	7	7	1234675	1234681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4394	NC_011147	ACA	2	6	1234696	1234701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4395	NC_011147	ATG	2	6	1234708	1234713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4396	NC_011147	ACG	2	6	1234725	1234730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4397	NC_011147	CAT	2	6	1234839	1234844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4398	NC_011147	AAG	2	6	1234846	1234851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4399	NC_011147	TAT	2	6	1236007	1236012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4400	NC_011147	ATT	2	6	1236042	1236047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4401	NC_011147	CGC	2	6	1236069	1236074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4402	NC_011147	CCG	2	6	1236078	1236083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4403	NC_011147	CGC	2	6	1236084	1236089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4404	NC_011147	CCGT	2	8	1236110	1236117	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4405	NC_011147	GCC	2	6	1236127	1236132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4410	NC_011147	ACTATA	2	12	1236302	1236313	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4411	NC_011147	TAAAA	2	10	1236316	1236325	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4412	NC_011147	ACG	2	6	1236417	1236422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4413	NC_011147	ACA	2	6	1236434	1236439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4414	NC_011147	AG	4	8	1236476	1236483	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4415	NC_011147	GAT	2	6	1236484	1236489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4417	NC_011147	AG	3	6	1237313	1237318	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4418	NC_011147	AAT	2	6	1237348	1237353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4423	NC_011147	GAA	3	9	1239843	1239851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4426	NC_011147	CGAT	2	8	1243084	1243091	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4427	NC_011147	TA	3	6	1243185	1243190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4428	NC_011147	GTGA	2	8	1243203	1243210	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4429	NC_011147	GCA	2	6	1243221	1243226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4430	NC_011147	GCC	2	6	1243234	1243239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4431	NC_011147	TAA	2	6	1243243	1243248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4434	NC_011147	GT	3	6	1244161	1244166	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4435	NC_011147	CCG	2	6	1244179	1244184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4440	NC_011147	TATT	2	8	1244529	1244536	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4443	NC_011147	AG	3	6	1244732	1244737	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4444	NC_011147	T	6	6	1244742	1244747	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4453	NC_011147	GTA	2	6	1245174	1245179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4455	NC_011147	CGCC	2	8	1245236	1245243	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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4482	NC_011147	T	6	6	1246419	1246424	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4483	NC_011147	ATTG	2	8	1246442	1246449	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4495	NC_011147	TATTT	2	10	1251836	1251845	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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