MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. AKU_12601 chromosome

Total Repeats: 16372

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_011147	GGA	2	6	896156	896161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_011147	CGTC	2	8	896221	896228	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3003	NC_011147	G	6	6	896290	896295	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_011147	CAT	2	6	896326	896331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3005	NC_011147	GGC	2	6	896366	896371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_011147	CTG	2	6	896378	896383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_011147	GAT	2	6	896414	896419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_011147	ATCA	2	8	896420	896427	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3009	NC_011147	CTG	2	6	896453	896458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3010	NC_011147	GCG	2	6	896466	896471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_011147	GA	3	6	896509	896514	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_011147	TC	3	6	896533	896538	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3013	NC_011147	GCA	2	6	896545	896550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3014	NC_011147	CAT	2	6	896618	896623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_011147	AGC	2	6	896649	896654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3016	NC_011147	GGC	2	6	896861	896866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_011147	GTT	2	6	896867	896872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_011147	GCT	2	6	896908	896913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3019	NC_011147	ATA	2	6	896915	896920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_011147	TGG	2	6	896964	896969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_011147	A	7	7	896972	896978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_011147	G	8	8	897029	897036	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_011147	ATT	2	6	897191	897196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_011147	ATCC	2	8	897214	897221	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3025	NC_011147	TGA	2	6	897308	897313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3030	NC_011147	GTA	2	6	897411	897416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3032	NC_011147	AT	3	6	897531	897536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_011147	TTTGAA	2	12	897551	897562	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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3035	NC_011147	TGA	2	6	897739	897744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_011147	GAGG	2	8	897769	897776	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_011147	TGG	2	6	897784	897789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_011147	TGAT	2	8	897886	897893	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_011147	TGC	2	6	897916	897921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3041	NC_011147	TAT	2	6	897966	897971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_011147	T	6	6	898019	898024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_011147	T	6	6	898049	898054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_011147	ATGC	2	8	898112	898119	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3045	NC_011147	TTAA	2	8	898180	898187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_011147	T	6	6	898188	898193	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_011147	TAG	2	6	898208	898213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3049	NC_011147	TGA	2	6	898230	898235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_011147	CAT	2	6	898261	898266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3052	NC_011147	TCA	2	6	898387	898392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_011147	CGGGT	2	10	898449	898458	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3054	NC_011147	TCG	2	6	898533	898538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3055	NC_011147	AAT	2	6	898600	898605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_011147	ATT	2	6	898621	898626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_011147	GTT	2	6	898668	898673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3059	NC_011147	ATT	2	6	898688	898693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_011147	TAAAA	2	10	898737	898746	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_011147	AAC	2	6	898775	898780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3062	NC_011147	ATA	2	6	898812	898817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_011147	TAA	2	6	898846	898851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_011147	AGG	2	6	898853	898858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_011147	GTC	2	6	898873	898878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3066	NC_011147	T	6	6	898883	898888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_011147	GCT	2	6	898906	898911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3070	NC_011147	GC	3	6	898950	898955	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3071	NC_011147	GCA	2	6	899090	899095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3073	NC_011147	AATG	2	8	899249	899256	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_011147	GCA	2	6	899267	899272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3079	NC_011147	G	7	7	899616	899622	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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3089	NC_011147	GCG	2	6	899882	899887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3090	NC_011147	A	7	7	899949	899955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3092	NC_011147	AT	3	6	900076	900081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3099	NC_011147	CTG	2	6	900287	900292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3100	NC_011147	GCT	2	6	900559	900564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3101	NC_011147	ACA	2	6	900633	900638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3102	NC_011147	GCTTC	2	10	900652	900661	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3103	NC_011147	GGA	2	6	900703	900708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_011147	CG	3	6	900732	900737	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3105	NC_011147	A	6	6	900755	900760	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_011147	TTCA	2	8	900776	900783	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3107	NC_011147	GTAC	2	8	900820	900827	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3108	NC_011147	GAGAT	2	10	900906	900915	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_011147	CTGG	2	8	900916	900923	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3110	NC_011147	TCCG	2	8	900972	900979	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3111	NC_011147	CGG	2	6	901029	901034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3112	NC_011147	CGA	2	6	901035	901040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3113	NC_011147	CGGTA	2	10	901093	901102	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3114	NC_011147	GAGG	2	8	901137	901144	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_011147	ATAAA	2	10	902501	902510	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_011147	TGTT	2	8	902559	902566	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_011147	GTTT	2	8	902632	902639	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_011147	CTT	2	6	902647	902652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3119	NC_011147	GCCA	2	8	902714	902721	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3120	NC_011147	CCG	2	6	902773	902778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3121	NC_011147	GTC	2	6	902835	902840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3122	NC_011147	CTC	2	6	902933	902938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3123	NC_011147	AAG	2	6	902953	902958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_011147	TG	3	6	903021	903026	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_011147	CGGG	2	8	903046	903053	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3126	NC_011147	GAT	2	6	903071	903076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_011147	A	6	6	903090	903095	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3129	NC_011147	ATT	2	6	903192	903197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_011147	CA	3	6	903257	903262	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3131	NC_011147	TTG	2	6	903279	903284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_011147	AC	3	6	903323	903328	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3133	NC_011147	CGG	2	6	903358	903363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3134	NC_011147	CGT	2	6	903389	903394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3136	NC_011147	AGCG	2	8	903506	903513	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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