MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. AKU_12601 chromosome

Total Repeats: 16372

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_011147	GCA	2	6	744925	744930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2502	NC_011147	AAG	2	6	744946	744951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_011147	AAG	2	6	744970	744975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2504	NC_011147	CCA	2	6	745066	745071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2505	NC_011147	TGA	2	6	745124	745129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_011147	CG	6	12	745150	745161	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2507	NC_011147	GAT	2	6	745190	745195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_011147	TTA	2	6	745234	745239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2509	NC_011147	ATC	2	6	745279	745284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2510	NC_011147	ATT	2	6	745293	745298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2511	NC_011147	AGA	2	6	745349	745354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2512	NC_011147	TGGATA	2	12	745429	745440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2513	NC_011147	GAT	2	6	745451	745456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2514	NC_011147	TCG	2	6	745636	745641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2515	NC_011147	GTC	2	6	745667	745672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2516	NC_011147	TAA	2	6	745703	745708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_011147	CGAA	2	8	745717	745724	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2518	NC_011147	CGT	2	6	745761	745766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2519	NC_011147	CGCA	2	8	745923	745930	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2520	NC_011147	CGG	2	6	745946	745951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2521	NC_011147	A	6	6	746082	746087	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2522	NC_011147	ATC	2	6	746097	746102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2523	NC_011147	TCT	2	6	746109	746114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2524	NC_011147	TGA	2	6	746155	746160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_011147	ACA	2	6	746196	746201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2526	NC_011147	CTT	2	6	746227	746232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2527	NC_011147	GC	3	6	747320	747325	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2528	NC_011147	AAG	2	6	749904	749909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2529	NC_011147	A	7	7	749932	749938	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2530	NC_011147	ATA	3	9	749977	749985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2531	NC_011147	ATA	2	6	750007	750012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2532	NC_011147	CCG	2	6	751048	751053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2533	NC_011147	GAGAG	2	10	751102	751111	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
2534	NC_011147	TGA	2	6	753298	753303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2535	NC_011147	TCA	2	6	753311	753316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2536	NC_011147	CAT	2	6	753349	753354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2537	NC_011147	CAG	2	6	753380	753385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2538	NC_011147	CGG	2	6	753409	753414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2539	NC_011147	ACA	2	6	754417	754422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2540	NC_011147	GA	4	8	756864	756871	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2541	NC_011147	CGTAG	2	10	759450	759459	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2542	NC_011147	GCC	2	6	759467	759472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2543	NC_011147	AG	3	6	759499	759504	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2544	NC_011147	T	7	7	759523	759529	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2547	NC_011147	A	7	7	760794	760800	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2548	NC_011147	ATT	2	6	760814	760819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2549	NC_011147	TGT	2	6	760852	760857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2550	NC_011147	TGA	2	6	760859	760864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2551	NC_011147	A	6	6	760884	760889	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2552	NC_011147	CT	3	6	760909	760914	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2553	NC_011147	T	7	7	760922	760928	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2554	NC_011147	GAT	2	6	762388	762393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2557	NC_011147	GCA	2	6	764603	764608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2558	NC_011147	TTC	2	6	764620	764625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2559	NC_011147	ATG	2	6	764652	764657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2560	NC_011147	ACG	2	6	764702	764707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2561	NC_011147	CG	3	6	764706	764711	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2562	NC_011147	TCA	2	6	764731	764736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2563	NC_011147	CGC	2	6	765686	765691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2564	NC_011147	GGCA	2	8	765698	765705	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2565	NC_011147	CGC	2	6	765709	765714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2566	NC_011147	TGG	2	6	767486	767491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2567	NC_011147	TGG	2	6	767562	767567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2568	NC_011147	GCC	2	6	767577	767582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2569	NC_011147	GGC	2	6	767598	767603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2570	NC_011147	TCT	2	6	767648	767653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2571	NC_011147	TCG	2	6	767708	767713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2574	NC_011147	TGCC	2	8	770114	770121	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2575	NC_011147	T	6	6	770177	770182	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2577	NC_011147	GCT	2	6	774111	774116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2579	NC_011147	GCG	2	6	774955	774960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2580	NC_011147	AAAG	2	8	775011	775018	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2581	NC_011147	ATGT	2	8	775032	775039	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2582	NC_011147	ATT	2	6	778036	778041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2583	NC_011147	T	6	6	778660	778665	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2584	NC_011147	AAAGA	2	10	778676	778685	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2585	NC_011147	AGC	2	6	778695	778700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2589	NC_011147	AATT	2	8	779255	779262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2590	NC_011147	AGGG	2	8	779286	779293	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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2593	NC_011147	A	6	6	779415	779420	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2596	NC_011147	TGT	2	6	781498	781503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2597	NC_011147	A	6	6	781504	781509	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2598	NC_011147	AAT	2	6	781574	781579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2599	NC_011147	TCC	2	6	782754	782759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2600	NC_011147	AT	4	8	782798	782805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2601	NC_011147	TAA	2	6	782823	782828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2602	NC_011147	AAT	2	6	782829	782834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2603	NC_011147	ACAG	2	8	782863	782870	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2604	NC_011147	AAT	2	6	782883	782888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2605	NC_011147	ATT	2	6	782899	782904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2606	NC_011147	ATTT	2	8	782930	782937	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2607	NC_011147	T	6	6	782935	782940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2608	NC_011147	TCA	2	6	782976	782981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2609	NC_011147	TTA	2	6	783316	783321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2610	NC_011147	T	6	6	783361	783366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2611	NC_011147	TA	4	8	783379	783386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2612	NC_011147	TAA	2	6	783408	783413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2613	NC_011147	AAT	2	6	783422	783427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2614	NC_011147	ATT	2	6	783439	783444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2615	NC_011147	CAA	2	6	783483	783488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2616	NC_011147	CCT	2	6	783513	783518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2617	NC_011147	TAA	2	6	783546	783551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2618	NC_011147	T	6	6	784131	784136	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2619	NC_011147	GGC	2	6	784137	784142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2620	NC_011147	GATA	2	8	784887	784894	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2621	NC_011147	GT	3	6	788814	788819	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2622	NC_011147	CTG	2	6	788827	788832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2623	NC_011147	CGT	2	6	788899	788904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2624	NC_011147	GCA	2	6	788905	788910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2625	NC_011147	CCG	2	6	788982	788987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2626	NC_011147	CGG	2	6	789051	789056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2627	NC_011147	GAC	2	6	789062	789067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2628	NC_011147	CTT	2	6	789078	789083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2629	NC_011147	ACC	2	6	789107	789112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2630	NC_011147	CTT	2	6	789160	789165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2631	NC_011147	CGT	2	6	790789	790794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2632	NC_011147	AGGTA	2	10	794780	794789	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
2633	NC_011147	ATA	2	6	794797	794802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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