MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. AKU_12601 chromosome

Total Repeats: 16372

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_011147	AAG	2	6	416307	416312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_011147	CT	3	6	416330	416335	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1503	NC_011147	GCG	2	6	416352	416357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_011147	CAC	2	6	416359	416364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1505	NC_011147	GTC	2	6	416384	416389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_011147	ACG	2	6	416396	416401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_011147	CAC	2	6	416482	416487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1508	NC_011147	GCG	2	6	416493	416498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_011147	CGA	2	6	416499	416504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_011147	GGC	2	6	416636	416641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_011147	GTC	2	6	416648	416653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_011147	GC	4	8	416672	416679	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1513	NC_011147	GCG	2	6	416733	416738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_011147	CAAT	2	8	416799	416806	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1515	NC_011147	GCG	2	6	417009	417014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_011147	TGGC	2	8	417059	417066	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1517	NC_011147	CAGC	2	8	417094	417101	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1518	NC_011147	CGC	2	6	417115	417120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1519	NC_011147	CGG	2	6	417133	417138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_011147	TAC	2	6	417148	417153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_011147	GGTAA	2	10	417161	417170	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_011147	GAG	2	6	417203	417208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_011147	TCC	2	6	417272	417277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1524	NC_011147	CGG	2	6	417325	417330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_011147	CGA	2	6	417358	417363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_011147	CAC	2	6	417409	417414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1527	NC_011147	GTG	2	6	417470	417475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_011147	A	6	6	417514	417519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_011147	TACC	2	8	417541	417548	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1530	NC_011147	TGA	3	9	417604	417612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_011147	GGC	2	6	417656	417661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_011147	GGC	2	6	417683	417688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_011147	CAC	2	6	417705	417710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1534	NC_011147	GC	3	6	417755	417760	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1535	NC_011147	GC	3	6	417830	417835	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1536	NC_011147	ACT	2	6	417894	417899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_011147	GGC	2	6	417914	417919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_011147	CAG	2	6	417944	417949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_011147	CAG	2	6	418036	418041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1540	NC_011147	GCG	2	6	418107	418112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_011147	ACA	3	9	418146	418154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_011147	AG	3	6	418159	418164	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_011147	ACT	2	6	418299	418304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_011147	GAT	2	6	418463	418468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_011147	TGA	2	6	418483	418488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_011147	GCAG	2	8	418543	418550	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1547	NC_011147	GCA	2	6	418599	418604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1548	NC_011147	CGGG	2	8	418667	418674	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1549	NC_011147	CAG	2	6	420189	420194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1550	NC_011147	A	7	7	420246	420252	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_011147	TTA	2	6	420297	420302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_011147	TTC	2	6	421795	421800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_011147	ATTT	2	8	421822	421829	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_011147	TTTA	2	8	423510	423517	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_011147	T	6	6	423754	423759	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_011147	CAA	2	6	423810	423815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_011147	GGTT	2	8	423825	423832	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_011147	G	7	7	423835	423841	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_011147	GCCT	2	8	423874	423881	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1560	NC_011147	CCG	2	6	423920	423925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1561	NC_011147	A	6	6	424040	424045	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_011147	AAG	3	9	424087	424095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_011147	GCT	2	6	424135	424140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_011147	TTG	2	6	424151	424156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_011147	CAA	2	6	424197	424202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_011147	CCATG	2	10	424221	424230	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1567	NC_011147	GTA	2	6	424233	424238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_011147	GAT	2	6	424269	424274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_011147	TCA	2	6	424298	424303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_011147	TTGCCT	2	12	424337	424348	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1571	NC_011147	CTT	2	6	424360	424365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_011147	TGA	2	6	424550	424555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_011147	AAC	2	6	424571	424576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1574	NC_011147	CCTG	2	8	424595	424602	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1575	NC_011147	TTAGGT	2	12	424608	424619	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_011147	TAA	2	6	425767	425772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_011147	A	7	7	425804	425810	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_011147	T	8	8	425839	425846	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_011147	A	8	8	425852	425859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_011147	ATA	2	6	425871	425876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_011147	ATA	2	6	425957	425962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_011147	GTG	2	6	426008	426013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_011147	CTT	2	6	426036	426041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1584	NC_011147	T	6	6	426040	426045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_011147	CAT	2	6	426520	426525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1586	NC_011147	CTGT	2	8	426549	426556	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1587	NC_011147	G	6	6	426575	426580	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_011147	CTG	2	6	426583	426588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_011147	CGC	2	6	428817	428822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1590	NC_011147	GCG	2	6	428826	428831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_011147	TAC	2	6	432458	432463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1592	NC_011147	TGA	2	6	432495	432500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_011147	AAGG	2	8	432568	432575	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_011147	GCC	2	6	432604	432609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1595	NC_011147	T	6	6	434338	434343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_011147	T	7	7	434430	434436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_011147	GCT	2	6	434452	434457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1598	NC_011147	A	6	6	434477	434482	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_011147	GTT	2	6	434562	434567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_011147	GTGA	2	8	434590	434597	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_011147	AG	3	6	434665	434670	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_011147	T	7	7	434693	434699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_011147	AATA	2	8	435364	435371	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_011147	T	8	8	435398	435405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_011147	AAC	2	6	435412	435417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_011147	AACA	2	8	435422	435429	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1607	NC_011147	TGC	2	6	436756	436761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1608	NC_011147	CGC	2	6	437536	437541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1609	NC_011147	CGG	2	6	437544	437549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_011147	TAA	2	6	437946	437951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_011147	TGT	2	6	439434	439439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_011147	CGT	2	6	439462	439467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_011147	TGA	2	6	439509	439514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_011147	T	6	6	439565	439570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_011147	TGG	2	6	439703	439708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_011147	GCT	2	6	439752	439757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1617	NC_011147	CTG	2	6	439780	439785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1618	NC_011147	GC	3	6	439798	439803	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1619	NC_011147	TTA	2	6	439873	439878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_011147	GCA	2	6	439908	439913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1621	NC_011147	GATG	2	8	440001	440008	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_011147	ATT	2	6	440014	440019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_011147	GGT	2	6	440070	440075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_011147	CTGGTG	2	12	440125	440136	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1625	NC_011147	TGC	2	6	440198	440203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_011147	CAG	2	6	440248	440253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1627	NC_011147	GTG	2	6	440293	440298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_011147	CTGG	2	8	440310	440317	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1629	NC_011147	TGT	2	6	440324	440329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_011147	TGG	2	6	440363	440368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_011147	GGT	2	6	440418	440423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_011147	ATT	2	6	440488	440493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_011147	ATT	2	6	440563	440568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1635	NC_011147	CGG	2	6	440586	440591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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