MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. AKU_12601 chromosome

Total Repeats: 16372

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_011147	GAT	2	6	4473151	4473156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16002	NC_011147	TG	3	6	4473188	4473193	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16003	NC_011147	GTT	2	6	4473194	4473199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16004	NC_011147	GTT	3	9	4473217	4473225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16005	NC_011147	AATT	2	8	4473237	4473244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16006	NC_011147	TGA	2	6	4473459	4473464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16007	NC_011147	AT	3	6	4473500	4473505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16008	NC_011147	TAT	2	6	4473564	4473569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16009	NC_011147	ATTT	2	8	4473590	4473597	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16010	NC_011147	CAT	2	6	4473633	4473638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16011	NC_011147	CAT	2	6	4473645	4473650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16012	NC_011147	CAT	2	6	4473654	4473659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16013	NC_011147	TGC	2	6	4473714	4473719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16014	NC_011147	CTA	2	6	4473732	4473737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16015	NC_011147	TTA	2	6	4474207	4474212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16016	NC_011147	CGT	2	6	4474225	4474230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16017	NC_011147	TG	3	6	4474253	4474258	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16018	NC_011147	CTG	3	9	4474342	4474350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16019	NC_011147	C	6	6	4475094	4475099	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16020	NC_011147	CG	3	6	4475104	4475109	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16021	NC_011147	CTG	3	9	4475119	4475127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16022	NC_011147	ATG	2	6	4475196	4475201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16023	NC_011147	CAC	3	9	4475240	4475248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16024	NC_011147	GGC	2	6	4476096	4476101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16025	NC_011147	CGC	2	6	4476122	4476127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16026	NC_011147	GAT	2	6	4476182	4476187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16027	NC_011147	AACAT	2	10	4476192	4476201	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
16028	NC_011147	T	6	6	4476212	4476217	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16029	NC_011147	ATT	2	6	4476224	4476229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16030	NC_011147	TGG	2	6	4476244	4476249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16031	NC_011147	TGA	2	6	4476259	4476264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16032	NC_011147	TCTT	2	8	4476319	4476326	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16033	NC_011147	AG	3	6	4476336	4476341	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16034	NC_011147	TCA	2	6	4477387	4477392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16035	NC_011147	ATGAC	2	10	4477397	4477406	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
16036	NC_011147	CT	3	6	4477445	4477450	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16037	NC_011147	CAC	2	6	4477510	4477515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16038	NC_011147	TTA	2	6	4487234	4487239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16039	NC_011147	A	6	6	4487258	4487263	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16040	NC_011147	AAT	2	6	4487272	4487277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16041	NC_011147	TTAA	2	8	4487290	4487297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16042	NC_011147	TAAGT	2	10	4487331	4487340	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
16043	NC_011147	TTA	2	6	4487341	4487346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16044	NC_011147	GAT	2	6	4487387	4487392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16045	NC_011147	ATC	2	6	4487421	4487426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16046	NC_011147	CCGG	2	8	4487438	4487445	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16047	NC_011147	CAT	2	6	4487738	4487743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16048	NC_011147	TTC	2	6	4487764	4487769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16049	NC_011147	A	6	6	4488690	4488695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16050	NC_011147	GC	3	6	4488754	4488759	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16051	NC_011147	TGG	2	6	4488760	4488765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16052	NC_011147	CAT	2	6	4488809	4488814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16053	NC_011147	TCG	2	6	4488914	4488919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16054	NC_011147	TA	3	6	4488948	4488953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16055	NC_011147	GA	3	6	4489009	4489014	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16056	NC_011147	TGT	2	6	4490231	4490236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16057	NC_011147	ATT	2	6	4490240	4490245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16058	NC_011147	CTTAA	2	10	4490292	4490301	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
16059	NC_011147	TCA	2	6	4490329	4490334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16060	NC_011147	TA	3	6	4490384	4490389	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16061	NC_011147	T	6	6	4490405	4490410	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16062	NC_011147	ATT	2	6	4491206	4491211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16063	NC_011147	TAA	2	6	4491228	4491233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16064	NC_011147	TAT	2	6	4491253	4491258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16065	NC_011147	ATA	2	6	4491262	4491267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16066	NC_011147	TA	3	6	4491266	4491271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16067	NC_011147	AAAT	2	8	4491288	4491295	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16068	NC_011147	TGG	2	6	4491344	4491349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16069	NC_011147	T	6	6	4491358	4491363	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16070	NC_011147	TCT	2	6	4491369	4491374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16071	NC_011147	T	7	7	4491380	4491386	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16072	NC_011147	TAA	2	6	4491392	4491397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16073	NC_011147	GCA	2	6	4491405	4491410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16074	NC_011147	G	8	8	4491426	4491433	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16075	NC_011147	CAG	2	6	4491438	4491443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16077	NC_011147	TTG	2	6	4491538	4491543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16078	NC_011147	CCT	2	6	4491582	4491587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16079	NC_011147	GAA	2	6	4493493	4493498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16081	NC_011147	AC	3	6	4493530	4493535	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16082	NC_011147	GAT	2	6	4493608	4493613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16083	NC_011147	GTTGA	2	10	4493640	4493649	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
16084	NC_011147	CGT	2	6	4493660	4493665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16085	NC_011147	GGA	2	6	4493726	4493731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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16088	NC_011147	T	7	7	4493872	4493878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16089	NC_011147	CATA	2	8	4493911	4493918	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16090	NC_011147	A	7	7	4493963	4493969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16091	NC_011147	AAG	2	6	4494646	4494651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16094	NC_011147	TAAA	2	8	4494819	4494826	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16095	NC_011147	A	6	6	4494845	4494850	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16096	NC_011147	TAA	2	6	4494851	4494856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16097	NC_011147	T	6	6	4494933	4494938	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16098	NC_011147	GGA	2	6	4494956	4494961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16099	NC_011147	TCAG	2	8	4495892	4495899	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16100	NC_011147	ATC	2	6	4495905	4495910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16101	NC_011147	T	6	6	4495939	4495944	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16102	NC_011147	T	7	7	4495958	4495964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16103	NC_011147	TGA	2	6	4495967	4495972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16104	NC_011147	AAT	2	6	4495985	4495990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16105	NC_011147	ATC	2	6	4496028	4496033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16106	NC_011147	GA	4	8	4496067	4496074	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16107	NC_011147	AG	3	6	4497240	4497245	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16108	NC_011147	GTT	2	6	4497282	4497287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16109	NC_011147	CCTTT	2	10	4497417	4497426	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
16110	NC_011147	ATT	2	6	4497456	4497461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16111	NC_011147	GTTG	2	8	4497467	4497474	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16112	NC_011147	GCC	2	6	4499412	4499417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16113	NC_011147	CGG	2	6	4499421	4499426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16114	NC_011147	GCC	2	6	4499453	4499458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16115	NC_011147	CCA	2	6	4499472	4499477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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16119	NC_011147	T	6	6	4499891	4499896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16120	NC_011147	TTG	2	6	4499992	4499997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16121	NC_011147	TAA	2	6	4500767	4500772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16122	NC_011147	T	6	6	4500780	4500785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16123	NC_011147	GT	3	6	4500806	4500811	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16124	NC_011147	GGC	2	6	4502542	4502547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16125	NC_011147	AAAT	2	8	4505187	4505194	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16126	NC_011147	GTT	2	6	4505229	4505234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16127	NC_011147	A	6	6	4505235	4505240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16129	NC_011147	T	6	6	4505266	4505271	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16255	NC_011147	G	8	8	4539892	4539899	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16256	NC_011147	G	8	8	4540006	4540013	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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