MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. AKU_12601 chromosome

Total Repeats: 16372

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_011147	GCCT	2	8	4348850	4348857	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15502	NC_011147	TTA	2	6	4350222	4350227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15503	NC_011147	GA	3	6	4351558	4351563	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15504	NC_011147	A	6	6	4351597	4351602	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15505	NC_011147	GCC	2	6	4351603	4351608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15506	NC_011147	GAT	2	6	4351629	4351634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15507	NC_011147	CGG	2	6	4351643	4351648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15508	NC_011147	ACC	2	6	4354032	4354037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15509	NC_011147	GGT	2	6	4354054	4354059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15510	NC_011147	CAA	2	6	4354088	4354093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15511	NC_011147	A	7	7	4354162	4354168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15512	NC_011147	CGT	2	6	4354207	4354212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15513	NC_011147	GGC	2	6	4354216	4354221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15514	NC_011147	CTA	2	6	4354248	4354253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15515	NC_011147	TTGC	2	8	4355703	4355710	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15516	NC_011147	T	6	6	4355783	4355788	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15517	NC_011147	AAAT	2	8	4355803	4355810	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15518	NC_011147	ATC	2	6	4355836	4355841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15519	NC_011147	GGA	2	6	4356337	4356342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15520	NC_011147	AGA	2	6	4358806	4358811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15521	NC_011147	T	6	6	4359621	4359626	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15522	NC_011147	A	6	6	4359630	4359635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15523	NC_011147	CCAT	2	8	4359636	4359643	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15524	NC_011147	T	9	9	4359654	4359662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15525	NC_011147	CTGG	2	8	4359667	4359674	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15526	NC_011147	TTTA	2	8	4359709	4359716	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15527	NC_011147	GAGATA	2	12	4359724	4359735	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15528	NC_011147	GGC	2	6	4360150	4360155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15529	NC_011147	TCG	2	6	4360993	4360998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15530	NC_011147	AGG	2	6	4364066	4364071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15531	NC_011147	GC	3	6	4364153	4364158	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15532	NC_011147	TG	3	6	4364159	4364164	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15533	NC_011147	GGGAT	2	10	4364187	4364196	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
15534	NC_011147	TCT	2	6	4364202	4364207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15535	NC_011147	CAA	2	6	4364221	4364226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15536	NC_011147	CGG	2	6	4364234	4364239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15537	NC_011147	GTC	2	6	4364255	4364260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15538	NC_011147	TCC	2	6	4364274	4364279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15539	NC_011147	TGC	2	6	4364285	4364290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15540	NC_011147	CCTGG	2	10	4364385	4364394	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
15541	NC_011147	GTC	2	6	4364422	4364427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15542	NC_011147	GCG	2	6	4364431	4364436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15543	NC_011147	CTGTC	2	10	4364475	4364484	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
15544	NC_011147	CAC	2	6	4364529	4364534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15545	NC_011147	CTGG	2	8	4364544	4364551	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15546	NC_011147	CGC	2	6	4364552	4364557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15547	NC_011147	TGC	2	6	4364585	4364590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15548	NC_011147	CGGG	2	8	4364591	4364598	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15549	NC_011147	GGC	2	6	4364688	4364693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15550	NC_011147	GC	3	6	4364757	4364762	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15551	NC_011147	GCG	2	6	4364782	4364787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15552	NC_011147	TCA	2	6	4364815	4364820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15553	NC_011147	GATC	2	8	4364845	4364852	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15554	NC_011147	GC	4	8	4364927	4364934	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15555	NC_011147	ATT	2	6	4364977	4364982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15556	NC_011147	GCG	2	6	4364990	4364995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15557	NC_011147	CGG	2	6	4365052	4365057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15558	NC_011147	AG	3	6	4365073	4365078	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15559	NC_011147	ACA	2	6	4365175	4365180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15560	NC_011147	TGAG	2	8	4365198	4365205	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15561	NC_011147	CG	3	6	4365245	4365250	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15562	NC_011147	AG	3	6	4365299	4365304	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15563	NC_011147	GCA	2	6	4365310	4365315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15564	NC_011147	GCGGA	2	10	4365333	4365342	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
15565	NC_011147	TGC	2	6	4365345	4365350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15566	NC_011147	CGC	3	9	4365360	4365368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15567	NC_011147	GTG	2	6	4365379	4365384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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15569	NC_011147	GCG	2	6	4365405	4365410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15570	NC_011147	CTGC	2	8	4365419	4365426	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15571	NC_011147	GTA	2	6	4365486	4365491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15572	NC_011147	TGTT	2	8	4365871	4365878	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15573	NC_011147	AATC	2	8	4365932	4365939	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15574	NC_011147	ATT	2	6	4366389	4366394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15575	NC_011147	GA	3	6	4366449	4366454	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15576	NC_011147	GAT	2	6	4367990	4367995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15578	NC_011147	TGTT	2	8	4369143	4369150	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15579	NC_011147	AAG	2	6	4369203	4369208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15581	NC_011147	GA	3	6	4369239	4369244	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15582	NC_011147	A	6	6	4369322	4369327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15583	NC_011147	ATT	2	6	4369366	4369371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15584	NC_011147	GC	3	6	4369373	4369378	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15585	NC_011147	A	6	6	4373966	4373971	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15589	NC_011147	A	6	6	4374421	4374426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15590	NC_011147	T	6	6	4374441	4374446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15591	NC_011147	AAC	2	6	4374455	4374460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15592	NC_011147	GCC	2	6	4374473	4374478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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15595	NC_011147	CAA	2	6	4376235	4376240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15596	NC_011147	T	6	6	4376268	4376273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15597	NC_011147	ATT	2	6	4376334	4376339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15598	NC_011147	CCT	2	6	4377977	4377982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15599	NC_011147	TCC	2	6	4378106	4378111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15600	NC_011147	AGA	2	6	4378130	4378135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15601	NC_011147	GAT	2	6	4378828	4378833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15602	NC_011147	CAG	2	6	4378866	4378871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15603	NC_011147	ATTTT	2	10	4378880	4378889	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15604	NC_011147	CGT	2	6	4378898	4378903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15609	NC_011147	CCG	2	6	4380557	4380562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15610	NC_011147	TTC	2	6	4380570	4380575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15611	NC_011147	TTC	2	6	4380706	4380711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15612	NC_011147	GCC	2	6	4380749	4380754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15613	NC_011147	TGA	2	6	4380756	4380761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15615	NC_011147	ATA	2	6	4380788	4380793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15617	NC_011147	GAA	2	6	4382133	4382138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15618	NC_011147	GATTAT	2	12	4382139	4382150	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15619	NC_011147	CGC	2	6	4382273	4382278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15620	NC_011147	TAA	2	6	4382290	4382295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15621	NC_011147	A	6	6	4382294	4382299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15624	NC_011147	A	6	6	4382482	4382487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15625	NC_011147	GCA	2	6	4382507	4382512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15627	NC_011147	GCTG	2	8	4382587	4382594	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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