MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. AKU_12601 chromosome

Total Repeats: 16372

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011147	CGC	2	6	332100	332105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1002	NC_011147	GCA	2	6	332116	332121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_011147	ACC	2	6	332749	332754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1004	NC_011147	AGA	2	6	334542	334547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_011147	GA	3	6	334549	334554	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_011147	T	6	6	338484	338489	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_011147	A	6	6	338744	338749	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_011147	CAGA	2	8	338750	338757	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1009	NC_011147	CTT	2	6	338866	338871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_011147	CAA	2	6	338917	338922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_011147	TGCC	2	8	338925	338932	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1012	NC_011147	ATA	2	6	338945	338950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_011147	TGT	2	6	339032	339037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_011147	T	6	6	339064	339069	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_011147	TTC	2	6	339071	339076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_011147	CCT	2	6	343063	343068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1017	NC_011147	ACC	2	6	343081	343086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1018	NC_011147	TGC	2	6	344560	344565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_011147	A	6	6	344569	344574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_011147	CGCTA	2	10	346780	346789	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1021	NC_011147	AT	3	6	348210	348215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_011147	A	6	6	348300	348305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_011147	GATT	2	8	348312	348319	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_011147	T	7	7	348318	348324	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_011147	T	6	6	348441	348446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_011147	TCT	2	6	348528	348533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_011147	TAA	2	6	348804	348809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_011147	T	8	8	348844	348851	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_011147	TGT	2	6	348894	348899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_011147	TAA	2	6	348963	348968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_011147	CGC	2	6	349011	349016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1032	NC_011147	GC	3	6	349030	349035	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1033	NC_011147	GCG	2	6	349065	349070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_011147	GTT	2	6	349086	349091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_011147	ATC	2	6	349147	349152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_011147	TGGA	2	8	349154	349161	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_011147	CAC	2	6	349231	349236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1038	NC_011147	CTG	2	6	349249	349254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_011147	GCT	2	6	349306	349311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_011147	CAG	2	6	349369	349374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_011147	GCC	2	6	349387	349392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1042	NC_011147	TTA	2	6	349427	349432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_011147	GCC	2	6	349441	349446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1044	NC_011147	TAA	2	6	349480	349485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_011147	ACC	2	6	349517	349522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1046	NC_011147	ACC	2	6	349538	349543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1047	NC_011147	GCG	2	6	349586	349591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_011147	GGCG	2	8	349633	349640	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1049	NC_011147	TGC	2	6	349687	349692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_011147	CGG	4	12	349696	349707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_011147	TTC	2	6	349741	349746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_011147	ACA	2	6	349865	349870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_011147	TGGT	2	8	349871	349878	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_011147	AAT	2	6	349906	349911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_011147	GAT	2	6	349938	349943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_011147	AGA	2	6	349958	349963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_011147	GAC	2	6	350001	350006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_011147	ACA	2	6	350051	350056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_011147	TGC	2	6	350060	350065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_011147	TAA	3	9	350100	350108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_011147	T	7	7	350125	350131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_011147	T	6	6	350139	350144	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_011147	AAAG	2	8	350148	350155	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_011147	AGC	2	6	350164	350169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_011147	GGA	2	6	350189	350194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_011147	T	6	6	350226	350231	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_011147	ATG	2	6	351466	351471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_011147	TCT	2	6	351517	351522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_011147	AAC	2	6	351543	351548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_011147	GAA	2	6	351674	351679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_011147	TGTGT	2	10	353023	353032	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_011147	CGC	2	6	353087	353092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1073	NC_011147	CGG	2	6	353107	353112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_011147	GGGA	2	8	353202	353209	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_011147	AAAT	2	8	360293	360300	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_011147	A	6	6	360365	360370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_011147	TAA	2	6	360389	360394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_011147	AT	3	6	360395	360400	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_011147	AT	3	6	360420	360425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_011147	CGG	2	6	361427	361432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_011147	CCG	2	6	361447	361452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1082	NC_011147	TC	4	8	362267	362274	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1083	NC_011147	AGC	2	6	362312	362317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_011147	AAT	2	6	362357	362362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_011147	GAA	2	6	362371	362376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_011147	A	6	6	363250	363255	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_011147	TAAG	2	8	363281	363288	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_011147	TCT	2	6	363804	363809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_011147	GGC	2	6	363810	363815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_011147	GTC	2	6	363836	363841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_011147	A	6	6	363857	363862	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_011147	TGC	2	6	365977	365982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_011147	GCG	2	6	366061	366066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_011147	AAG	2	6	366073	366078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_011147	CGG	2	6	369092	369097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_011147	TAA	2	6	369107	369112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_011147	AAGCG	2	10	370430	370439	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1098	NC_011147	GCC	2	6	371304	371309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1099	NC_011147	CCT	2	6	371321	371326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1100	NC_011147	TCTG	2	8	371381	371388	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1101	NC_011147	AAG	2	6	371414	371419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_011147	CGG	2	6	371577	371582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_011147	ATA	2	6	371598	371603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_011147	TCG	2	6	371623	371628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_011147	CAA	2	6	371699	371704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_011147	CTG	2	6	371708	371713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_011147	A	7	7	371739	371745	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_011147	T	7	7	371762	371768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_011147	TGA	2	6	372591	372596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_011147	A	6	6	372631	372636	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_011147	TTA	2	6	372644	372649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_011147	AAT	2	6	372656	372661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_011147	AGA	2	6	373682	373687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_011147	TGGC	2	8	373696	373703	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1115	NC_011147	CAT	2	6	373732	373737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_011147	ATA	2	6	373776	373781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_011147	TCA	2	6	373784	373789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_011147	ATTTA	2	10	381106	381115	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_011147	ATT	2	6	381128	381133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_011147	T	6	6	381136	381141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_011147	CGC	2	6	381282	381287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1122	NC_011147	GC	4	8	381354	381361	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1123	NC_011147	GCA	2	6	381409	381414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_011147	ATC	2	6	381565	381570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1126	NC_011147	CGG	2	6	381737	381742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_011147	CTG	2	6	381774	381779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_011147	CGG	2	6	381788	381793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_011147	CGG	2	6	381832	381837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_011147	GCC	2	6	381864	381869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1131	NC_011147	AGA	2	6	381969	381974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_011147	TCG	2	6	382031	382036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_011147	GCT	2	6	382057	382062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1135	NC_011147	GAT	2	6	382093	382098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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