MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. AKU_12601 chromosome

Total Repeats: 16372

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011147	TGA	2	6	178219	178224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
502	NC_011147	AAAG	2	8	178237	178244	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
503	NC_011147	CCT	2	6	178257	178262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
504	NC_011147	ATT	2	6	178300	178305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_011147	CTG	2	6	178328	178333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_011147	T	6	6	178354	178359	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_011147	CCT	2	6	178461	178466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
508	NC_011147	TCAA	2	8	178476	178483	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
509	NC_011147	T	6	6	179351	179356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_011147	AGA	2	6	179374	179379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_011147	TGT	2	6	179380	179385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_011147	TTA	2	6	179432	179437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_011147	TAGA	2	8	179488	179495	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
514	NC_011147	CGGC	2	8	184096	184103	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
515	NC_011147	T	8	8	184104	184111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_011147	TTA	2	6	184136	184141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_011147	TGT	2	6	184168	184173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_011147	GAT	2	6	184226	184231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_011147	CCG	2	6	184252	184257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
520	NC_011147	TCT	2	6	185704	185709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_011147	T	7	7	185758	185764	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_011147	ATG	2	6	185790	185795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_011147	GCA	2	6	185832	185837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_011147	TGTC	2	8	185875	185882	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
525	NC_011147	ATA	2	6	185961	185966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_011147	ATT	2	6	185975	185980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_011147	TC	3	6	188751	188756	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
528	NC_011147	TGCC	2	8	188786	188793	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
529	NC_011147	T	6	6	188963	188968	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_011147	T	6	6	188976	188981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_011147	CTA	2	6	189046	189051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_011147	ACT	2	6	189052	189057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_011147	CAA	2	6	189089	189094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_011147	GAG	2	6	189121	189126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
535	NC_011147	GGC	2	6	191783	191788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_011147	CTG	2	6	191849	191854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_011147	T	7	7	191862	191868	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_011147	GCT	2	6	191876	191881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_011147	CT	3	6	192285	192290	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
540	NC_011147	CAC	2	6	192350	192355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
541	NC_011147	T	6	6	192381	192386	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_011147	T	6	6	192399	192404	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_011147	TTA	2	6	192410	192415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_011147	TTGA	2	8	192457	192464	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
545	NC_011147	CAA	2	6	192493	192498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_011147	TGA	2	6	196511	196516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_011147	CCT	2	6	197322	197327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
548	NC_011147	A	7	7	198223	198229	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_011147	CAT	2	6	198238	198243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_011147	ATT	2	6	198272	198277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_011147	GGA	2	6	198294	198299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
552	NC_011147	CGA	2	6	198700	198705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_011147	TAT	2	6	198710	198715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_011147	TTG	2	6	198742	198747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_011147	T	6	6	202954	202959	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_011147	TG	3	6	202987	202992	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
557	NC_011147	TCA	2	6	202997	203002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_011147	GAAT	2	8	203031	203038	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
559	NC_011147	GCG	2	6	203075	203080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_011147	TTA	2	6	203081	203086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_011147	ATT	2	6	204448	204453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_011147	AT	3	6	204460	204465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_011147	AAGT	2	8	204482	204489	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
564	NC_011147	TCA	2	6	206240	206245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_011147	ACT	2	6	206269	206274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_011147	AGG	2	6	206284	206289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
567	NC_011147	GAC	2	6	206748	206753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_011147	T	6	6	206775	206780	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_011147	AT	3	6	206794	206799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_011147	TTG	2	6	209693	209698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_011147	AAT	2	6	213519	213524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_011147	CCCT	2	8	214333	214340	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
573	NC_011147	TAAAAT	2	12	214353	214364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_011147	ATAAAT	2	12	215043	215054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_011147	AT	3	6	215058	215063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_011147	TA	3	6	215065	215070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_011147	TTG	2	6	215077	215082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
578	NC_011147	AG	3	6	215111	215116	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
579	NC_011147	CCAT	2	8	215138	215145	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
580	NC_011147	T	7	7	215161	215167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_011147	TAT	2	6	215185	215190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_011147	ATAA	2	8	215203	215210	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_011147	ATA	2	6	215214	215219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_011147	TTAT	2	8	215220	215227	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_011147	A	7	7	215237	215243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_011147	TAT	2	6	215285	215290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_011147	CTT	2	6	215680	215685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_011147	TGA	2	6	216648	216653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_011147	GCGCT	2	10	216666	216675	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
590	NC_011147	CGCGT	2	10	216718	216727	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
591	NC_011147	G	6	6	217598	217603	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
592	NC_011147	TAA	2	6	219563	219568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_011147	AG	3	6	219613	219618	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
594	NC_011147	CAT	2	6	219640	219645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_011147	CGC	2	6	219649	219654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
596	NC_011147	AACG	2	8	220653	220660	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
597	NC_011147	ACGC	2	8	221254	221261	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
598	NC_011147	TAA	2	6	221274	221279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_011147	GA	3	6	225113	225118	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
600	NC_011147	TCT	3	9	225121	225129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_011147	GTC	2	6	225130	225135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_011147	GAA	2	6	225141	225146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
603	NC_011147	TCC	2	6	227820	227825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
604	NC_011147	ATAA	2	8	227826	227833	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_011147	TTA	2	6	227848	227853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_011147	CCTT	2	8	227856	227863	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
607	NC_011147	CGA	2	6	227923	227928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_011147	TGC	2	6	227943	227948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_011147	AAT	3	9	227955	227963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_011147	TCA	2	6	227988	227993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_011147	CTC	2	6	228034	228039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
612	NC_011147	GTA	2	6	228059	228064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
613	NC_011147	TGTC	2	8	228084	228091	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
614	NC_011147	GGC	2	6	228100	228105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_011147	AGA	2	6	228118	228123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
616	NC_011147	CGC	2	6	228150	228155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
617	NC_011147	CGG	2	6	228174	228179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_011147	GTT	2	6	228257	228262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_011147	CCG	2	6	228264	228269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
620	NC_011147	AAG	2	6	228303	228308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
621	NC_011147	CGC	2	6	228372	228377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
622	NC_011147	AAT	2	6	228394	228399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_011147	ATG	2	6	228437	228442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_011147	CG	3	6	228469	228474	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
625	NC_011147	CGA	2	6	228554	228559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_011147	GAAA	2	8	228570	228577	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
627	NC_011147	GCA	2	6	228696	228701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_011147	AGC	2	6	228716	228721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_011147	TC	3	6	228780	228785	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
630	NC_011147	TAC	2	6	228814	228819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_011147	GGCT	2	8	228820	228827	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
632	NC_011147	AGCA	2	8	229063	229070	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
633	NC_011147	GCG	2	6	229075	229080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_011147	TGT	2	6	229122	229127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
635	NC_011147	GAC	2	6	229129	229134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_011147	GCT	2	6	229206	229211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_011147	TATGCG	2	12	229227	229238	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
638	NC_011147	ACG	2	6	229265	229270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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652	NC_011147	CGG	2	6	229989	229994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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