MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. AKU_12601 chromosome

Total Repeats: 16372

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_011147	GCA	2	6	2527066	2527071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9002	NC_011147	CCT	2	6	2528787	2528792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9003	NC_011147	GCT	2	6	2528859	2528864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9004	NC_011147	TAC	2	6	2529458	2529463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9005	NC_011147	TTA	2	6	2529508	2529513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9006	NC_011147	ACC	2	6	2529552	2529557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9007	NC_011147	AT	3	6	2532947	2532952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9008	NC_011147	A	6	6	2532958	2532963	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9009	NC_011147	ATG	2	6	2533049	2533054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9010	NC_011147	CCT	2	6	2533057	2533062	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9011	NC_011147	TGAGAA	2	12	2533073	2533084	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9012	NC_011147	GC	3	6	2534255	2534260	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9013	NC_011147	GAC	2	6	2534303	2534308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9014	NC_011147	GCG	2	6	2534313	2534318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9015	NC_011147	AC	3	6	2534335	2534340	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9016	NC_011147	GTG	2	6	2534362	2534367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9017	NC_011147	GT	3	6	2534428	2534433	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9018	NC_011147	ACCT	2	8	2535944	2535951	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9019	NC_011147	CAA	2	6	2536802	2536807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9020	NC_011147	TGT	2	6	2536817	2536822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9021	NC_011147	ATT	2	6	2536824	2536829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9022	NC_011147	ATC	2	6	2536873	2536878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9023	NC_011147	CCT	2	6	2536892	2536897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9024	NC_011147	CAAG	2	8	2536899	2536906	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9025	NC_011147	T	6	6	2539415	2539420	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9026	NC_011147	ATT	2	6	2539421	2539426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9027	NC_011147	GAG	2	6	2539459	2539464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9028	NC_011147	CGG	2	6	2540259	2540264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9029	NC_011147	GGCA	2	8	2540316	2540323	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9030	NC_011147	CCA	2	6	2540348	2540353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9031	NC_011147	GC	3	6	2540388	2540393	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9032	NC_011147	GTA	2	6	2540412	2540417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9033	NC_011147	GCC	2	6	2540451	2540456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9034	NC_011147	GCG	2	6	2540461	2540466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9035	NC_011147	TAA	2	6	2540571	2540576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9036	NC_011147	TTCATC	2	12	2541072	2541083	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9037	NC_011147	GAG	2	6	2541162	2541167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9038	NC_011147	CGA	2	6	2541182	2541187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9039	NC_011147	T	6	6	2541220	2541225	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9040	NC_011147	T	6	6	2541262	2541267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9041	NC_011147	TGT	2	6	2542250	2542255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9042	NC_011147	GC	3	6	2542342	2542347	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9043	NC_011147	AAATA	2	10	2542589	2542598	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9044	NC_011147	ATA	3	9	2542596	2542604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9045	NC_011147	AAC	2	6	2542606	2542611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9046	NC_011147	A	6	6	2542621	2542626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9047	NC_011147	CT	3	6	2542630	2542635	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9048	NC_011147	ATTTAA	2	12	2542665	2542676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9049	NC_011147	CATG	2	8	2542690	2542697	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9050	NC_011147	TAA	2	6	2542723	2542728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9051	NC_011147	CAT	2	6	2542791	2542796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9052	NC_011147	AT	3	6	2542818	2542823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9053	NC_011147	ATA	2	6	2542833	2542838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9054	NC_011147	AT	3	6	2542849	2542854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9055	NC_011147	TGG	2	6	2542867	2542872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9056	NC_011147	TAA	2	6	2542876	2542881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9057	NC_011147	TTG	2	6	2542884	2542889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9058	NC_011147	ATG	2	6	2542936	2542941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9059	NC_011147	TAA	2	6	2542959	2542964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9060	NC_011147	AAAAC	2	10	2542965	2542974	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
9061	NC_011147	AAT	2	6	2542975	2542980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9062	NC_011147	A	6	6	2542986	2542991	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9063	NC_011147	TA	3	6	2543032	2543037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9064	NC_011147	T	8	8	2543050	2543057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9065	NC_011147	GAAA	2	8	2543066	2543073	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9066	NC_011147	A	6	6	2543071	2543076	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9067	NC_011147	CAT	2	6	2543150	2543155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9068	NC_011147	ATGATA	2	12	2543187	2543198	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9069	NC_011147	ACT	2	6	2543202	2543207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9070	NC_011147	A	7	7	2543243	2543249	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9071	NC_011147	CAAAC	2	10	2543300	2543309	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
9072	NC_011147	CCATA	2	10	2543312	2543321	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
9073	NC_011147	GTT	2	6	2543361	2543366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9074	NC_011147	ATTTA	2	10	2543403	2543412	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9075	NC_011147	TA	3	6	2543460	2543465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9076	NC_011147	TTTA	2	8	2543466	2543473	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9077	NC_011147	TAAAT	2	10	2543493	2543502	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9078	NC_011147	A	6	6	2543520	2543525	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9079	NC_011147	CTT	2	6	2543555	2543560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9080	NC_011147	AAAT	2	8	2543578	2543585	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9081	NC_011147	CAT	2	6	2543594	2543599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9082	NC_011147	T	6	6	2543614	2543619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9083	NC_011147	CAC	2	6	2543686	2543691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9084	NC_011147	GTT	3	9	2543730	2543738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9087	NC_011147	AGTA	2	8	2543768	2543775	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9088	NC_011147	TAAA	2	8	2544297	2544304	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9089	NC_011147	TA	3	6	2544310	2544315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9090	NC_011147	A	6	6	2544332	2544337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9091	NC_011147	AAGA	2	8	2544344	2544351	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9092	NC_011147	AATAA	2	10	2544356	2544365	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9093	NC_011147	AAT	2	6	2548189	2548194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9094	NC_011147	TAA	2	6	2548261	2548266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9095	NC_011147	GT	3	6	2548892	2548897	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9096	NC_011147	AAG	2	6	2549678	2549683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9097	NC_011147	TG	3	6	2549712	2549717	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9098	NC_011147	CAT	2	6	2549723	2549728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9100	NC_011147	GAAA	2	8	2549770	2549777	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9101	NC_011147	A	6	6	2549775	2549780	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9102	NC_011147	TAAA	2	8	2549785	2549792	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9103	NC_011147	TTCA	2	8	2549804	2549811	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9104	NC_011147	TAA	2	6	2549852	2549857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9105	NC_011147	CGC	2	6	2549858	2549863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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9107	NC_011147	GTT	2	6	2549895	2549900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9108	NC_011147	C	8	8	2549940	2549947	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9109	NC_011147	CAA	2	6	2549955	2549960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9110	NC_011147	TAACA	2	10	2549966	2549975	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
9111	NC_011147	AAAG	2	8	2549996	2550003	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9112	NC_011147	AGG	2	6	2550010	2550015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9113	NC_011147	ATC	2	6	2550074	2550079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9114	NC_011147	A	8	8	2550102	2550109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9115	NC_011147	TAAT	2	8	2550120	2550127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9116	NC_011147	CAAA	2	8	2550195	2550202	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9117	NC_011147	TA	3	6	2550207	2550212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9118	NC_011147	CAT	2	6	2550213	2550218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9120	NC_011147	ACA	2	6	2550310	2550315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9121	NC_011147	A	7	7	2550375	2550381	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9122	NC_011147	TGT	2	6	2550418	2550423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9125	NC_011147	CCAG	2	8	2550635	2550642	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9126	NC_011147	ATCG	2	8	2550645	2550652	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9127	NC_011147	GTC	2	6	2550657	2550662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9133	NC_011147	CTG	2	6	2550951	2550956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9387	NC_011147	ACGG	2	8	2600226	2600233	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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9396	NC_011147	T	6	6	2606333	2606338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9397	NC_011147	TTC	2	6	2606393	2606398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9398	NC_011147	CACT	2	8	2606416	2606423	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9399	NC_011147	GTTT	2	8	2606441	2606448	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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