MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. AKU_12601 chromosome

Total Repeats: 16372

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_011147	AGT	2	6	1636601	1636606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_011147	TCGCC	2	10	1637929	1637938	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
6003	NC_011147	TGA	2	6	1639168	1639173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_011147	AGG	2	6	1639249	1639254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_011147	TAA	2	6	1640329	1640334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_011147	GTC	2	6	1640444	1640449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6007	NC_011147	ATT	2	6	1640467	1640472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_011147	T	6	6	1640483	1640488	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_011147	CGC	2	6	1640500	1640505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6010	NC_011147	AAC	2	6	1640529	1640534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6011	NC_011147	TGG	2	6	1640587	1640592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_011147	AAT	2	6	1640606	1640611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_011147	TAT	2	6	1640634	1640639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_011147	TAT	2	6	1641133	1641138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_011147	T	7	7	1641163	1641169	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_011147	CTAT	2	8	1641178	1641185	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6017	NC_011147	TAAA	2	8	1641982	1641989	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_011147	CG	3	6	1642030	1642035	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6019	NC_011147	A	6	6	1642052	1642057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_011147	TAC	2	6	1642077	1642082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6021	NC_011147	GAC	2	6	1642792	1642797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6022	NC_011147	TC	3	6	1643534	1643539	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6023	NC_011147	CCT	2	6	1644199	1644204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6024	NC_011147	TTA	2	6	1644233	1644238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_011147	ATT	2	6	1644254	1644259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_011147	TC	3	6	1644455	1644460	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6027	NC_011147	AAT	2	6	1644768	1644773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_011147	GGC	2	6	1644788	1644793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6029	NC_011147	GAGT	2	8	1644798	1644805	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_011147	ATGG	2	8	1644903	1644910	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_011147	AGGG	2	8	1644966	1644973	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_011147	CTC	2	6	1644979	1644984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6033	NC_011147	TAA	2	6	1644995	1645000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_011147	ATG	3	9	1645874	1645882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_011147	CAA	2	6	1646530	1646535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6036	NC_011147	ATC	2	6	1646579	1646584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6037	NC_011147	AGT	3	9	1646613	1646621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_011147	T	6	6	1647477	1647482	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_011147	ATTG	2	8	1647485	1647492	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_011147	A	7	7	1647516	1647522	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_011147	TCTT	2	8	1648227	1648234	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6042	NC_011147	GAT	2	6	1648240	1648245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_011147	TTATA	2	10	1648248	1648257	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_011147	ATTT	2	8	1648265	1648272	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_011147	T	6	6	1648307	1648312	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_011147	GAA	2	6	1648398	1648403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_011147	TTATT	2	10	1648744	1648753	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_011147	CCT	2	6	1654941	1654946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6049	NC_011147	A	6	6	1654978	1654983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_011147	CAGAA	2	10	1654990	1654999	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
6051	NC_011147	CAT	2	6	1655021	1655026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6052	NC_011147	TTAA	2	8	1655115	1655122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_011147	TTA	2	6	1655197	1655202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_011147	AAG	2	6	1655219	1655224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_011147	TAAACC	2	12	1655251	1655262	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6056	NC_011147	CAG	2	6	1655297	1655302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6057	NC_011147	CGC	2	6	1655366	1655371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6058	NC_011147	TGA	2	6	1655381	1655386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_011147	T	7	7	1655387	1655393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_011147	AT	3	6	1655452	1655457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_011147	AGG	2	6	1655499	1655504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_011147	GCC	2	6	1655942	1655947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6063	NC_011147	TCTG	2	8	1655979	1655986	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6064	NC_011147	GTT	2	6	1656049	1656054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_011147	ATA	3	9	1656063	1656071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_011147	GA	3	6	1656624	1656629	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_011147	ATT	3	9	1656646	1656654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_011147	TCAG	2	8	1657639	1657646	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6069	NC_011147	GAT	2	6	1657655	1657660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_011147	TGG	2	6	1657759	1657764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_011147	TGA	2	6	1657769	1657774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_011147	CTAA	2	8	1657804	1657811	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6073	NC_011147	TCA	2	6	1657833	1657838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6074	NC_011147	GTT	2	6	1657974	1657979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6075	NC_011147	TTA	2	6	1658000	1658005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_011147	ATT	2	6	1658053	1658058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_011147	ATC	2	6	1658064	1658069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6078	NC_011147	CGC	2	6	1658329	1658334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6079	NC_011147	TAA	2	6	1658377	1658382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_011147	T	6	6	1658405	1658410	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6081	NC_011147	TAA	2	6	1658432	1658437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_011147	ATT	2	6	1658443	1658448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_011147	CAT	2	6	1658512	1658517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6084	NC_011147	TAA	2	6	1658534	1658539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6090	NC_011147	TGA	2	6	1658751	1658756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6091	NC_011147	TCCT	2	8	1658828	1658835	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6092	NC_011147	ACCT	2	8	1658843	1658850	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6093	NC_011147	TAT	2	6	1658904	1658909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6095	NC_011147	CAGG	2	8	1658942	1658949	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6096	NC_011147	AAG	2	6	1658965	1658970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6098	NC_011147	TAC	2	6	1659597	1659602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6099	NC_011147	TTA	2	6	1659603	1659608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_011147	GT	3	6	1659615	1659620	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_011147	AAT	2	6	1659685	1659690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_011147	TAC	2	6	1659736	1659741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6103	NC_011147	TA	3	6	1659796	1659801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_011147	AT	4	8	1659826	1659833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6107	NC_011147	A	7	7	1659949	1659955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_011147	ACA	2	6	1660135	1660140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6109	NC_011147	AGAAT	2	10	1660153	1660162	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_011147	AGG	2	6	1660378	1660383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_011147	TTAT	2	8	1660654	1660661	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_011147	ACT	2	6	1660680	1660685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6115	NC_011147	ATTT	2	8	1661096	1661103	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_011147	AT	3	6	1661133	1661138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_011147	C	7	7	1661146	1661152	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6118	NC_011147	T	7	7	1661160	1661166	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_011147	GAA	2	6	1661172	1661177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_011147	TA	3	6	1661233	1661238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_011147	TGGC	2	8	1661255	1661262	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6122	NC_011147	GC	3	6	1661264	1661269	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6123	NC_011147	CAT	2	6	1661329	1661334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6125	NC_011147	TAA	2	6	1661387	1661392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6126	NC_011147	AG	4	8	1661935	1661942	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6127	NC_011147	ACA	3	9	1661959	1661967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6128	NC_011147	CGG	2	6	1662024	1662029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6129	NC_011147	TA	3	6	1662048	1662053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6130	NC_011147	CCT	2	6	1662344	1662349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6132	NC_011147	CCA	2	6	1662417	1662422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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