MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. AKU_12601 chromosome

Total Repeats: 16372

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_011147	TTA	2	6	1487622	1487627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_011147	T	6	6	1487703	1487708	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_011147	AAT	2	6	1492423	1492428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_011147	CTC	2	6	1492700	1492705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5505	NC_011147	CTA	2	6	1492780	1492785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5506	NC_011147	TTA	2	6	1493415	1493420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_011147	GAC	2	6	1493424	1493429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5508	NC_011147	CGC	2	6	1494576	1494581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5509	NC_011147	CCG	2	6	1495033	1495038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5510	NC_011147	GTT	2	6	1495058	1495063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_011147	T	6	6	1495106	1495111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_011147	ACG	2	6	1495785	1495790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5513	NC_011147	A	6	6	1495814	1495819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_011147	ACT	2	6	1496218	1496223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5515	NC_011147	TCA	2	6	1496281	1496286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5516	NC_011147	TTA	2	6	1496291	1496296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_011147	TCG	2	6	1496361	1496366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5518	NC_011147	T	8	8	1496398	1496405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_011147	CTT	3	9	1497390	1497398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5520	NC_011147	TGCG	2	8	1497451	1497458	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5521	NC_011147	TAA	3	9	1497465	1497473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_011147	GA	3	6	1497475	1497480	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_011147	AG	3	6	1498102	1498107	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_011147	ATAGA	2	10	1498110	1498119	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_011147	AGA	2	6	1498136	1498141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_011147	GTA	2	6	1498204	1498209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_011147	TCA	2	6	1498235	1498240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5528	NC_011147	CA	3	6	1498261	1498266	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5529	NC_011147	TC	3	6	1498308	1498313	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5530	NC_011147	GT	4	8	1498468	1498475	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_011147	TGTC	2	8	1500572	1500579	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5532	NC_011147	AAGA	2	8	1500584	1500591	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_011147	ATC	2	6	1501854	1501859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5534	NC_011147	GTT	2	6	1501887	1501892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_011147	ATT	2	6	1501905	1501910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_011147	ATGG	2	8	1501947	1501954	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_011147	CTC	2	6	1501970	1501975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5538	NC_011147	A	6	6	1502040	1502045	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_011147	ATC	2	6	1502071	1502076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5540	NC_011147	AAAT	2	8	1503942	1503949	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_011147	AAC	2	6	1504011	1504016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5542	NC_011147	T	6	6	1504019	1504024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_011147	CGG	2	6	1504096	1504101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5544	NC_011147	AAC	2	6	1504120	1504125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5545	NC_011147	CGA	2	6	1505520	1505525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5546	NC_011147	GGC	2	6	1505538	1505543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5547	NC_011147	GAA	2	6	1505592	1505597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_011147	CAC	2	6	1505694	1505699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5549	NC_011147	TGG	2	6	1505707	1505712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_011147	CAT	2	6	1505744	1505749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5551	NC_011147	CAC	2	6	1505781	1505786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5552	NC_011147	TGG	2	6	1505794	1505799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_011147	ATT	2	6	1505893	1505898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_011147	TC	3	6	1505904	1505909	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5555	NC_011147	GAA	2	6	1505969	1505974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_011147	TC	3	6	1508742	1508747	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5557	NC_011147	TAT	2	6	1508767	1508772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_011147	ATT	2	6	1508784	1508789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_011147	GCC	2	6	1514180	1514185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5560	NC_011147	ATG	2	6	1514188	1514193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_011147	CAG	2	6	1517693	1517698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5562	NC_011147	TCG	2	6	1517712	1517717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5563	NC_011147	TAA	2	6	1517719	1517724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_011147	AAAT	2	8	1517957	1517964	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_011147	TA	3	6	1518019	1518024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_011147	ATTG	2	8	1519959	1519966	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_011147	GATA	2	8	1523895	1523902	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_011147	CTAA	2	8	1523912	1523919	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5569	NC_011147	CGC	2	6	1523998	1524003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5570	NC_011147	GCG	2	6	1524006	1524011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5571	NC_011147	GC	3	6	1524070	1524075	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5572	NC_011147	GGCT	2	8	1524088	1524095	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5573	NC_011147	TGG	2	6	1524111	1524116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_011147	ATTT	2	8	1527537	1527544	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5575	NC_011147	CTT	2	6	1527555	1527560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5576	NC_011147	A	6	6	1527659	1527664	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5577	NC_011147	ATT	2	6	1527679	1527684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_011147	TAAA	2	8	1527688	1527695	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_011147	TTA	2	6	1527723	1527728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_011147	TA	3	6	1527756	1527761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_011147	GAA	2	6	1527763	1527768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_011147	TCT	2	6	1527802	1527807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5583	NC_011147	GGA	2	6	1527867	1527872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5584	NC_011147	GCA	2	6	1530665	1530670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5585	NC_011147	TGA	2	6	1531350	1531355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5586	NC_011147	TCA	2	6	1531378	1531383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5587	NC_011147	TAG	2	6	1531458	1531463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5588	NC_011147	TTC	2	6	1532233	1532238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5589	NC_011147	A	7	7	1532273	1532279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5590	NC_011147	A	7	7	1532299	1532305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5591	NC_011147	GTC	2	6	1532362	1532367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5592	NC_011147	CGG	2	6	1533369	1533374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5593	NC_011147	TCG	2	6	1533667	1533672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5594	NC_011147	TCT	2	6	1533700	1533705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5595	NC_011147	TAT	2	6	1533749	1533754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5596	NC_011147	TGT	2	6	1536149	1536154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5597	NC_011147	CAA	3	9	1536162	1536170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5598	NC_011147	ATC	2	6	1536228	1536233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5599	NC_011147	T	6	6	1536238	1536243	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_011147	TTG	2	6	1536283	1536288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_011147	CAG	2	6	1536315	1536320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5602	NC_011147	CAG	2	6	1536337	1536342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5603	NC_011147	GCTG	2	8	1536378	1536385	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5604	NC_011147	GCG	2	6	1536459	1536464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5605	NC_011147	CGC	2	6	1536515	1536520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5606	NC_011147	ACG	2	6	1536535	1536540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5607	NC_011147	C	10	10	1536622	1536631	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5608	NC_011147	TG	3	6	1536632	1536637	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5609	NC_011147	TGG	3	9	1536684	1536692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5610	NC_011147	ACG	2	6	1536741	1536746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5611	NC_011147	ATCA	2	8	1536755	1536762	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5612	NC_011147	CGG	2	6	1536847	1536852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5613	NC_011147	CG	3	6	1536853	1536858	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5614	NC_011147	TAT	2	6	1536859	1536864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5615	NC_011147	CCA	2	6	1536897	1536902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5616	NC_011147	TCA	2	6	1536907	1536912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5617	NC_011147	T	6	6	1536966	1536971	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_011147	GAC	2	6	1536983	1536988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5619	NC_011147	AGG	2	6	1537035	1537040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_011147	TCG	2	6	1541155	1541160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5621	NC_011147	AT	3	6	1541260	1541265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5622	NC_011147	ACA	2	6	1541267	1541272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5623	NC_011147	ATT	2	6	1541335	1541340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5624	NC_011147	CATT	2	8	1541343	1541350	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5625	NC_011147	ACA	2	6	1541401	1541406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5626	NC_011147	AGA	2	6	1541454	1541459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5627	NC_011147	CAT	2	6	1541472	1541477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5628	NC_011147	ATA	2	6	1541495	1541500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5629	NC_011147	CGCCA	2	10	1541679	1541688	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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