MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus MGCS10565 chromosome

Total Repeats: 1056

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011134	TTTA	2	8	183	190	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011134	ATAA	2	8	2917	2924	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011134	TGAG	2	8	2938	2945	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011134	AGGA	2	8	11330	11337	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011134	GTGA	2	8	18676	18683	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011134	TAAC	2	8	18759	18766	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_011134	AGCG	2	8	18847	18854	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_011134	TGGT	2	8	19512	19519	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011134	AGCC	2	8	19729	19736	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_011134	GTAA	2	8	20321	20328	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011134	GAAG	2	8	20403	20410	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011134	ATTC	2	8	21341	21348	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_011134	CTAA	2	8	21696	21703	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_011134	CTGA	2	8	21969	21976	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_011134	TAGG	2	8	22351	22358	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011134	TTGG	2	8	22534	22541	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011134	AATC	2	8	22543	22550	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_011134	GCGT	2	8	24339	24346	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_011134	ATTG	2	8	27535	27542	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011134	ATAG	2	8	28635	28642	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011134	TAAA	2	8	31119	31126	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011134	AAAG	2	8	31173	31180	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011134	AAAT	2	8	31963	31970	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011134	ATCA	2	8	40977	40984	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_011134	AAGA	2	8	42286	42293	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011134	CTTT	2	8	42532	42539	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_011134	TTAT	2	8	42549	42556	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011134	CGAC	2	8	46628	46635	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_011134	CAAG	2	8	46665	46672	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_011134	TGCT	2	8	47022	47029	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_011134	ATTA	2	8	47887	47894	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011134	GAAA	2	8	47911	47918	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011134	AAAC	2	8	51383	51390	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_011134	ATTC	2	8	51589	51596	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_011134	TGGC	2	8	51938	51945	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_011134	ATTT	2	8	52135	52142	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011134	CTGG	2	8	52188	52195	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_011134	ATTG	2	8	52300	52307	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011134	GCTT	2	8	52335	52342	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_011134	AGCT	2	8	52811	52818	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_011134	GAGC	2	8	52969	52976	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_011134	ATTG	2	8	53302	53309	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011134	ATCA	2	8	56063	56070	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_011134	AGCT	2	8	58862	58869	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_011134	ATTT	2	8	59519	59526	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011134	TAAC	2	8	65050	65057	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_011134	TTTA	2	8	65463	65470	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011134	TGAG	2	8	69118	69125	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011134	AAAC	2	8	74566	74573	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_011134	ACAA	2	8	76501	76508	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_011134	GCTT	2	8	77324	77331	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_011134	TGAT	2	8	84321	84328	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011134	TAGC	2	8	84648	84655	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_011134	TCTT	2	8	85035	85042	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_011134	TAAA	2	8	88079	88086	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011134	GTGA	2	8	88794	88801	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011134	TAAC	2	8	88877	88884	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_011134	AGCG	2	8	88965	88972	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_011134	TGGT	2	8	89630	89637	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011134	AGCC	2	8	89847	89854	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_011134	GTAA	2	8	90439	90446	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011134	GAAG	2	8	90521	90528	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011134	ATTC	2	8	91459	91466	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_011134	CTAA	2	8	91814	91821	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_011134	CTGA	2	8	92087	92094	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_011134	TAGG	2	8	92469	92476	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011134	TTGG	2	8	92652	92659	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011134	AATC	2	8	92661	92668	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_011134	GCGT	2	8	93871	93878	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_011134	TAGT	2	8	95982	95989	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011134	ATGT	2	8	97595	97602	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011134	ATTA	2	8	99207	99214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011134	TAAA	2	8	99640	99647	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011134	TAAA	2	8	99727	99734	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011134	AGCA	2	8	100317	100324	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_011134	GTGA	2	8	102107	102114	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011134	TGAT	2	8	106359	106366	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011134	TCTG	2	8	106728	106735	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_011134	TGCT	2	8	107366	107373	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_011134	TATT	2	8	107489	107496	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011134	CTGT	2	8	110619	110626	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_011134	AGAA	2	8	114366	114373	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011134	TAGA	2	8	122130	122137	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011134	ATTT	2	8	122237	122244	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011134	TTGT	2	8	122372	122379	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011134	AATT	2	8	122997	123004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011134	CAGG	2	8	123120	123127	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_011134	GAAA	2	8	123257	123264	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011134	TCTT	2	8	124597	124604	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_011134	ACAA	2	8	135980	135987	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_011134	AGAT	2	8	135993	136000	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011134	AAGC	2	8	136022	136029	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_011134	GCTG	2	8	141049	141056	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_011134	CAGA	2	8	141240	141247	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_011134	TGCT	2	8	141726	141733	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_011134	CCAA	2	8	141830	141837	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_011134	TGGT	2	8	141953	141960	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011134	AATG	2	8	142116	142123	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011134	TGAT	2	8	142433	142440	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011134	GCTG	2	8	142482	142489	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_011134	CTAT	2	8	143097	143104	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_011134	CTTA	2	8	146466	146473	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_011134	ATGC	2	8	147522	147529	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_011134	TTTG	2	8	147859	147866	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011134	TAGC	2	8	148464	148471	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_011134	TAGA	2	8	148725	148732	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011134	TTGC	2	8	153820	153827	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_011134	CAGA	2	8	153925	153932	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_011134	TTGT	2	8	154467	154474	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011134	TCAA	2	8	156983	156990	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_011134	TACC	2	8	156991	156998	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_011134	CAGG	2	8	160314	160321	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_011134	ATTG	2	8	162020	162027	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011134	CTAT	2	8	164017	164024	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_011134	CTTT	2	8	164119	164126	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_011134	GATT	2	8	164230	164237	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011134	AAGG	2	8	164509	164516	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011134	TGTC	2	8	167515	167522	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_011134	ATGA	2	8	167585	167592	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011134	GAAA	2	8	169439	169446	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011134	GACA	2	8	172783	172790	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_011134	AGTA	2	8	172799	172806	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011134	ATTG	2	8	173787	173794	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011134	ACGA	2	8	173908	173915	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_011134	CAAC	2	8	175070	175077	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_011134	TGGC	2	8	175340	175347	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_011134	AAAC	2	8	177476	177483	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_011134	TGCA	2	8	179120	179127	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_011134	TTGC	2	8	179180	179187	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_011134	CCTT	2	8	181774	181781	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_011134	TATT	2	8	182353	182360	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011134	TTCA	2	8	184002	184009	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_011134	TCGT	2	8	187551	187558	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_011134	GACT	2	8	187574	187581	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_011134	GAAA	2	8	190691	190698	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011134	TAAG	2	8	199337	199344	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011134	TAAT	2	8	202714	202721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011134	TGGT	2	8	202766	202773	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011134	GCCT	2	8	209270	209277	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
140	NC_011134	TGCT	2	8	211450	211457	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_011134	TAGC	2	8	211684	211691	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_011134	AGGT	2	8	211838	211845	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011134	TGCT	2	8	211921	211928	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_011134	CTTA	2	8	211940	211947	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_011134	TGTC	2	8	214711	214718	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_011134	TAAT	2	8	217327	217334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011134	ATCT	2	8	218247	218254	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_011134	TGCT	2	8	218285	218292	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_011134	AGCT	2	8	225114	225121	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_011134	GTCT	2	8	225625	225632	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_011134	GATT	2	8	228860	228867	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_011134	CTTA	2	8	228946	228953	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
153	NC_011134	CTAT	2	8	236494	236501	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
154	NC_011134	TGAT	2	8	236565	236572	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
155	NC_011134	TGCT	2	8	236652	236659	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
156	NC_011134	CTTG	2	8	238295	238302	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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160	NC_011134	TTTG	2	8	248260	248267	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
161	NC_011134	AGAC	2	8	248351	248358	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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169	NC_011134	AGTG	2	8	256052	256059	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_011134	GAAA	2	8	297120	297127	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
182	NC_011134	GATT	2	8	297133	297140	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_011134	AGCT	2	8	304989	304996	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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