MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus MGCS10565 chromosome

Total Repeats: 7817

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_011134	CAT	2	6	319879	319884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_011134	TTG	2	6	319964	319969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_011134	ATTC	2	8	320047	320054	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1504	NC_011134	TTC	2	6	320072	320077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_011134	GAA	2	6	320137	320142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_011134	TAA	2	6	320616	320621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_011134	ATC	2	6	320622	320627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_011134	TCC	3	9	320666	320674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1509	NC_011134	TATTTT	2	12	320675	320686	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_011134	GATA	2	8	320706	320713	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_011134	T	6	6	320792	320797	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_011134	T	7	7	320827	320833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_011134	CAAA	2	8	320856	320863	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1514	NC_011134	TAA	2	6	320864	320869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_011134	TCT	2	6	322201	322206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_011134	T	6	6	322227	322232	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_011134	A	7	7	322257	322263	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_011134	ATG	2	6	323176	323181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_011134	GATA	2	8	323210	323217	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_011134	ATA	3	9	323215	323223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_011134	TAAAA	2	10	323246	323255	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_011134	A	6	6	323267	323272	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_011134	AT	3	6	323321	323326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_011134	TAA	2	6	323327	323332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_011134	ATTAG	2	10	323355	323364	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_011134	T	7	7	323411	323417	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_011134	ATA	2	6	323440	323445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_011134	TAA	2	6	323446	323451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_011134	AGA	3	9	323483	323491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_011134	TAT	2	6	323569	323574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_011134	TAT	2	6	323595	323600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_011134	AT	3	6	324510	324515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_011134	TGA	2	6	325724	325729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_011134	TA	3	6	325735	325740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_011134	AAT	2	6	326771	326776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_011134	AT	3	6	326780	326785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_011134	AGA	2	6	326852	326857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_011134	T	6	6	326873	326878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_011134	A	6	6	326968	326973	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_011134	TCA	2	6	326996	327001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_011134	TAT	2	6	327036	327041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_011134	CTA	2	6	327096	327101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_011134	TTG	2	6	327165	327170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_011134	TAA	2	6	327362	327367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_011134	AAAG	2	8	327372	327379	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_011134	GAT	2	6	327843	327848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_011134	CGA	2	6	327862	327867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1548	NC_011134	TGAT	2	8	327874	327881	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_011134	ATT	2	6	327899	327904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_011134	GA	3	6	327934	327939	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_011134	T	6	6	327952	327957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_011134	AGG	2	6	327963	327968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_011134	ACAT	2	8	328673	328680	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1554	NC_011134	AGCA	2	8	329773	329780	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1555	NC_011134	CAG	2	6	329782	329787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_011134	T	6	6	329803	329808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_011134	ACG	2	6	329833	329838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_011134	AAAG	2	8	329894	329901	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_011134	TGCT	2	8	329908	329915	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1560	NC_011134	CT	3	6	329914	329919	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1561	NC_011134	TAT	2	6	329922	329927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_011134	A	8	8	329935	329942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_011134	CGCC	2	8	330031	330038	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1564	NC_011134	ATGAG	2	10	331861	331870	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_011134	TAA	2	6	331932	331937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_011134	AT	3	6	331959	331964	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_011134	T	12	12	331982	331993	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_011134	TGT	2	6	332002	332007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_011134	AGG	2	6	332034	332039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_011134	AAG	2	6	333566	333571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_011134	TTTG	2	8	333597	333604	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_011134	AAGAC	2	10	333645	333654	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1573	NC_011134	GCTT	2	8	333676	333683	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1574	NC_011134	GCTG	2	8	333686	333693	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1575	NC_011134	CTA	2	6	333777	333782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1576	NC_011134	CTG	2	6	333802	333807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1577	NC_011134	G	8	8	333872	333879	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_011134	TCA	2	6	333903	333908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1579	NC_011134	GCT	2	6	333911	333916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1580	NC_011134	TGG	2	6	333918	333923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_011134	T	6	6	333937	333942	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_011134	T	7	7	333948	333954	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_011134	TG	3	6	334028	334033	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_011134	TGA	2	6	334074	334079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_011134	CAT	2	6	334103	334108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1586	NC_011134	TGTT	2	8	334126	334133	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_011134	CTAG	2	8	334967	334974	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1588	NC_011134	GTTG	2	8	334977	334984	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_011134	AGGT	2	8	335000	335007	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_011134	TATCA	2	10	335061	335070	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1591	NC_011134	TGATA	2	10	335086	335095	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_011134	TG	3	6	335133	335138	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_011134	TGG	2	6	335167	335172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_011134	A	6	6	335545	335550	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_011134	TTTTC	2	10	335553	335562	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1596	NC_011134	TA	3	6	335588	335593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_011134	AAG	2	6	335637	335642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_011134	GACTT	2	10	335662	335671	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1599	NC_011134	TAA	2	6	335690	335695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_011134	ATC	2	6	335700	335705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1601	NC_011134	GGT	2	6	335971	335976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_011134	T	6	6	336059	336064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_011134	A	6	6	336552	336557	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_011134	T	6	6	336636	336641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_011134	TA	3	6	339651	339656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_011134	TGC	2	6	339663	339668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_011134	TAT	2	6	339713	339718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_011134	T	7	7	339744	339750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_011134	AG	3	6	339769	339774	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_011134	GGA	2	6	341544	341549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_011134	CTT	2	6	342426	342431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_011134	T	6	6	342430	342435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_011134	TGG	2	6	342486	342491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_011134	CCT	2	6	342492	342497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1615	NC_011134	GAG	2	6	342578	342583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_011134	ATT	2	6	342590	342595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_011134	TGC	2	6	342611	342616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1618	NC_011134	A	6	6	342627	342632	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_011134	GCT	2	6	342736	342741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_011134	GAAG	2	8	342757	342764	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_011134	AGG	2	6	342890	342895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_011134	CTA	2	6	344709	344714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_011134	ATA	2	6	344771	344776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_011134	A	7	7	344776	344782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_011134	CTGT	2	8	344787	344794	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1626	NC_011134	TAGC	2	8	344806	344813	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1627	NC_011134	AGG	2	6	347342	347347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_011134	A	7	7	348462	348468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_011134	T	6	6	348499	348504	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_011134	A	6	6	348512	348517	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_011134	TAT	2	6	349109	349114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_011134	ATA	2	6	349127	349132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_011134	T	6	6	349172	349177	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_011134	GATA	2	8	351707	351714	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_011134	ATAG	2	8	351722	351729	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_011134	TGC	2	6	351737	351742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1638	NC_011134	TAGCTT	2	12	351795	351806	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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1912	NC_011134	GTA	2	6	427979	427984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1913	NC_011134	CT	3	6	427990	427995	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1914	NC_011134	CTT	2	6	428000	428005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1915	NC_011134	A	7	7	428061	428067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1916	NC_011134	T	6	6	428077	428082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1917	NC_011134	T	7	7	428086	428092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1918	NC_011134	ATA	2	6	428117	428122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1919	NC_011134	ATG	2	6	429836	429841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1922	NC_011134	CTT	2	6	429895	429900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1931	NC_011134	ATAGC	2	10	432143	432152	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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1933	NC_011134	AC	3	6	433377	433382	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1934	NC_011134	GAACT	2	10	433520	433529	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1935	NC_011134	TA	3	6	433542	433547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1936	NC_011134	T	6	6	433559	433564	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1943	NC_011134	TAT	2	6	436388	436393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1944	NC_011134	ATT	2	6	436411	436416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1945	NC_011134	GGA	2	6	441275	441280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1946	NC_011134	A	6	6	441280	441285	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1947	NC_011134	GTG	2	6	441321	441326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1948	NC_011134	ATT	2	6	441341	441346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1972	NC_011134	CAAG	2	8	442581	442588	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1991	NC_011134	TGA	2	6	446296	446301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1993	NC_011134	AAATC	2	10	446348	446357	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1994	NC_011134	TTAGAT	2	12	447471	447482	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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1996	NC_011134	A	7	7	447535	447541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1997	NC_011134	TAT	2	6	447578	447583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1998	NC_011134	AGGC	2	8	447615	447622	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1999	NC_011134	TAT	2	6	448034	448039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2000	NC_011134	ATG	2	6	449940	449945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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