MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus MGCS10565 chromosome

Total Repeats: 7817

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011134	TTGG	2	8	92652	92659	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
502	NC_011134	AATC	2	8	92661	92668	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
503	NC_011134	GGT	2	6	92747	92752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
504	NC_011134	TCG	2	6	92862	92867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_011134	CGT	2	6	92942	92947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_011134	AGGGA	2	10	93080	93089	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
507	NC_011134	CTC	2	6	93120	93125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
508	NC_011134	GA	3	6	93166	93171	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
509	NC_011134	GTG	2	6	93202	93207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
510	NC_011134	ACTAAT	2	12	93221	93232	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
511	NC_011134	TAAGT	2	10	93332	93341	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
512	NC_011134	AGT	2	6	93383	93388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_011134	AGT	2	6	93408	93413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
514	NC_011134	GCTTA	2	10	93445	93454	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
515	NC_011134	TGT	2	6	93583	93588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_011134	GGT	2	6	93658	93663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
517	NC_011134	GGT	2	6	93693	93698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
518	NC_011134	ATG	2	6	93725	93730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_011134	CGG	2	6	93767	93772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_011134	GGA	2	6	93812	93817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
521	NC_011134	GCGT	2	8	93871	93878	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
522	NC_011134	TCC	2	6	93895	93900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
523	NC_011134	TCG	2	6	93937	93942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_011134	AT	3	6	93998	94003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_011134	CGG	2	6	94058	94063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_011134	AT	3	6	94094	94099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_011134	CGG	2	6	94128	94133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_011134	TTCGGG	2	12	94150	94161	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
529	NC_011134	CT	3	6	94173	94178	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
530	NC_011134	GTG	2	6	94278	94283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
531	NC_011134	AGTTT	2	10	94423	94432	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
532	NC_011134	GCC	2	6	94517	94522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
533	NC_011134	TCTTT	2	10	94567	94576	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
534	NC_011134	CTTTC	2	10	95959	95968	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
535	NC_011134	TAGT	2	8	95982	95989	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
536	NC_011134	ATT	2	6	96919	96924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_011134	TCT	2	6	96935	96940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_011134	GGA	2	6	96977	96982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
539	NC_011134	AAT	2	6	97005	97010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_011134	ATA	2	6	97452	97457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_011134	CAA	2	6	97549	97554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_011134	ATGT	2	8	97595	97602	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
543	NC_011134	CCT	2	6	97639	97644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
544	NC_011134	CGCTC	2	10	97687	97696	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
545	NC_011134	AAT	2	6	99144	99149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_011134	AAT	2	6	99181	99186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_011134	ATTA	2	8	99207	99214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_011134	ATC	2	6	99225	99230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_011134	AT	3	6	99249	99254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_011134	ATA	2	6	99307	99312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_011134	GA	4	8	99334	99341	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
552	NC_011134	TC	3	6	99347	99352	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
553	NC_011134	A	6	6	99361	99366	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_011134	ATA	2	6	99449	99454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_011134	AAG	2	6	99542	99547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NC_011134	CAG	2	6	99568	99573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_011134	TAAA	2	8	99640	99647	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_011134	CT	3	6	99696	99701	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
559	NC_011134	AAT	3	9	99704	99712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_011134	TAAA	2	8	99727	99734	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_011134	A	6	6	99732	99737	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_011134	TCC	2	6	99764	99769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
563	NC_011134	AAATTA	2	12	99823	99834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_011134	CCT	2	6	100245	100250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
565	NC_011134	AGCA	2	8	100317	100324	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
566	NC_011134	A	7	7	100332	100338	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_011134	A	6	6	100348	100353	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_011134	GCC	2	6	100479	100484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
569	NC_011134	AGT	2	6	100497	100502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_011134	T	6	6	100529	100534	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_011134	GAC	2	6	101190	101195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_011134	GTT	2	6	101248	101253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_011134	TAT	2	6	101261	101266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_011134	GTT	2	6	101831	101836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_011134	T	6	6	101868	101873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_011134	TTA	2	6	102007	102012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_011134	TG	3	6	102062	102067	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
578	NC_011134	T	6	6	102101	102106	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_011134	GTGA	2	8	102107	102114	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
580	NC_011134	AAG	2	6	103423	103428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_011134	AGG	2	6	103524	103529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
582	NC_011134	TGA	2	6	103540	103545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_011134	A	11	11	103612	103622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_011134	A	6	6	103696	103701	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_011134	CTAAA	2	10	103723	103732	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
586	NC_011134	GA	3	6	103735	103740	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
587	NC_011134	T	6	6	105035	105040	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_011134	CTG	2	6	105075	105080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_011134	ATA	2	6	105118	105123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_011134	GATAA	2	10	105137	105146	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
591	NC_011134	CTA	2	6	106330	106335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_011134	TGAT	2	8	106359	106366	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
593	NC_011134	AG	3	6	106392	106397	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
594	NC_011134	GCA	2	6	106423	106428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_011134	TCA	2	6	106494	106499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_011134	GAT	2	6	106526	106531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
597	NC_011134	TG	3	6	106545	106550	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
598	NC_011134	ACT	2	6	106593	106598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_011134	GTG	2	6	106610	106615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
600	NC_011134	A	7	7	106694	106700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_011134	TTG	2	6	106721	106726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
602	NC_011134	TCTG	2	8	106728	106735	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
603	NC_011134	GTT	2	6	106742	106747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
604	NC_011134	AT	3	6	106775	106780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_011134	AGG	2	6	106805	106810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
606	NC_011134	CTG	3	9	107348	107356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_011134	TGCT	2	8	107366	107373	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
608	NC_011134	TAG	2	6	107378	107383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
609	NC_011134	GCT	2	6	107396	107401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_011134	TAG	2	6	107422	107427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_011134	CAT	2	6	107470	107475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_011134	TATT	2	8	107489	107496	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_011134	GAG	2	6	108464	108469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
614	NC_011134	TGC	2	6	110565	110570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_011134	CTGT	2	8	110619	110626	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
616	NC_011134	ATA	2	6	114315	114320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_011134	GTC	2	6	114334	114339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_011134	AGAA	2	8	114366	114373	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
619	NC_011134	CAG	2	6	114374	114379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_011134	GCT	2	6	114408	114413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_011134	AAAAAG	2	12	114529	114540	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
622	NC_011134	GACTA	2	10	118146	118155	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
623	NC_011134	GCT	2	6	118171	118176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_011134	TCA	2	6	118183	118188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_011134	TAG	2	6	121919	121924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
626	NC_011134	GAG	2	6	121946	121951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
627	NC_011134	TCT	2	6	121962	121967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_011134	AGT	2	6	122092	122097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_011134	TAGA	2	8	122130	122137	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
630	NC_011134	TAT	2	6	122201	122206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_011134	A	7	7	122207	122213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_011134	ATTT	2	8	122237	122244	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_011134	T	7	7	122242	122248	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_011134	TTA	2	6	122264	122269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_011134	AT	3	6	122276	122281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_011134	GGT	2	6	122308	122313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
637	NC_011134	TAG	2	6	122341	122346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
638	NC_011134	TAT	2	6	122357	122362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_011134	TTGT	2	8	122372	122379	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
640	NC_011134	AATT	2	8	122997	123004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_011134	ATT	2	6	123009	123014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
642	NC_011134	TTG	2	6	123020	123025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
643	NC_011134	ATT	2	6	123030	123035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
644	NC_011134	ATA	2	6	123041	123046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
645	NC_011134	T	6	6	123050	123055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
646	NC_011134	T	7	7	123062	123068	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
647	NC_011134	T	7	7	123098	123104	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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649	NC_011134	ATT	2	6	123190	123195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
650	NC_011134	GAAA	2	8	123257	123264	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
651	NC_011134	TC	3	6	123353	123358	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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655	NC_011134	TCTT	2	8	124597	124604	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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670	NC_011134	GA	3	6	125499	125504	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
671	NC_011134	TAAGG	2	10	125517	125526	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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675	NC_011134	GAG	2	6	128354	128359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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678	NC_011134	C	6	6	132028	132033	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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681	NC_011134	TTTCA	2	10	133467	133476	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
682	NC_011134	TGATA	2	10	133486	133495	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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691	NC_011134	A	6	6	135896	135901	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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776	NC_011134	CAA	2	6	148093	148098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
777	NC_011134	T	6	6	148116	148121	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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