MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633 plasmid pCVM19633_110

Total Repeats: 222

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011092	GCC	2	6	1755	1760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_011092	GAG	2	6	2074	2079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011092	GCT	2	6	2505	2510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_011092	TGT	2	6	2523	2528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011092	GCT	2	6	2586	2591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011092	CTG	2	6	2807	2812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_011092	CGA	2	6	2906	2911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_011092	CGA	2	6	3035	3040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_011092	CGA	2	6	3336	3341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_011092	GCG	2	6	3378	3383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_011092	ATC	2	6	5649	5654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_011092	ATT	2	6	5662	5667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011092	TTA	2	6	5668	5673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011092	CAA	2	6	5696	5701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_011092	CGC	2	6	5812	5817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_011092	GCG	2	6	5844	5849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_011092	ATG	2	6	5966	5971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011092	GAC	2	6	5992	5997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_011092	TTG	2	6	6023	6028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011092	AAT	2	6	6140	6145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011092	TAC	2	6	6337	6342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_011092	TTC	2	6	7853	7858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_011092	ATT	2	6	7977	7982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011092	AAT	2	6	8165	8170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011092	CGG	2	6	8566	8571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_011092	GTA	2	6	8597	8602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011092	TGT	2	6	9933	9938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011092	AGA	2	6	9952	9957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011092	GGA	2	6	9961	9966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011092	GAC	2	6	10991	10996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_011092	GTC	2	6	11006	11011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_011092	GAT	2	6	12958	12963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011092	CAC	2	6	12972	12977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_011092	GGT	2	6	13035	13040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011092	GAG	2	6	13149	13154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011092	AAG	2	6	13172	13177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011092	GCT	2	6	14302	14307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_011092	CAT	2	6	14604	14609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_011092	ACT	2	6	14717	14722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_011092	TGT	2	6	14754	14759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011092	CAA	2	6	15439	15444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_011092	TCA	2	6	15461	15466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_011092	CAA	2	6	15571	15576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_011092	CCA	3	9	15602	15610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_011092	GCT	2	6	17626	17631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_011092	GCA	2	6	17716	17721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_011092	GTA	2	6	17811	17816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011092	AAG	2	6	18143	18148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011092	ATT	2	6	23373	23378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011092	GTG	2	6	23417	23422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011092	ACA	2	6	23443	23448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_011092	TCT	2	6	24656	24661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_011092	CGC	2	6	24705	24710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_011092	GCG	2	6	24845	24850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_011092	TAA	2	6	26070	26075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011092	TGC	2	6	26118	26123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_011092	ATG	2	6	26143	26148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011092	CCT	2	6	26193	26198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_011092	GTG	2	6	26216	26221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011092	TAA	2	6	26580	26585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011092	TCA	2	6	26761	26766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_011092	CAC	2	6	26805	26810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_011092	GCC	3	9	26819	26827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_011092	AGT	2	6	26845	26850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011092	ATG	2	6	26861	26866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011092	ACT	2	6	26876	26881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_011092	CTT	2	6	26882	26887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_011092	CAC	2	6	29045	29050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_011092	GTT	2	6	29055	29060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011092	ACG	2	6	29095	29100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_011092	CTG	2	6	29117	29122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_011092	CGG	2	6	29171	29176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_011092	TGG	2	6	31514	31519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011092	CTC	2	6	33470	33475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_011092	GTC	2	6	33519	33524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_011092	AGA	2	6	37195	37200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011092	AGC	2	6	37236	37241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_011092	GAT	2	6	38651	38656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011092	CAC	2	6	38665	38670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_011092	CCT	2	6	41323	41328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_011092	ATT	2	6	44070	44075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011092	ATT	2	6	44198	44203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011092	TGA	2	6	44293	44298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011092	TGA	2	6	44326	44331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011092	ACG	2	6	44341	44346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_011092	GGT	2	6	44402	44407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011092	ATC	2	6	44417	44422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_011092	GGT	3	9	45343	45351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011092	AAT	2	6	45353	45358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011092	TTC	2	6	45386	45391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_011092	TAA	2	6	45414	45419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011092	GTT	2	6	45992	45997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011092	TAA	2	6	46185	46190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011092	TCA	2	6	46336	46341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_011092	TAC	2	6	46418	46423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_011092	TCA	2	6	46438	46443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_011092	TAT	2	6	46588	46593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011092	GTC	2	6	46685	46690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_011092	TGA	2	6	51586	51591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011092	GTG	2	6	51601	51606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011092	TAA	2	6	51680	51685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011092	CAC	2	6	52842	52847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_011092	TCT	2	6	52913	52918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_011092	TAG	2	6	54361	54366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011092	AGC	2	6	55088	55093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_011092	CGT	2	6	55132	55137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_011092	GCA	2	6	55185	55190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_011092	GCG	2	6	55264	55269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_011092	GTG	2	6	55669	55674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011092	GCG	2	6	55775	55780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_011092	TTG	2	6	56661	56666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011092	GGC	2	6	57976	57981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_011092	CGC	2	6	58012	58017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_011092	AAC	2	6	58018	58023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_011092	TGC	2	6	58038	58043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_011092	CTG	2	6	58077	58082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_011092	AAC	2	6	58110	58115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_011092	GCC	2	6	58167	58172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_011092	GCG	2	6	59036	59041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_011092	GCA	2	6	59732	59737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_011092	TTG	2	6	59740	59745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011092	GCT	2	6	61931	61936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_011092	TCT	2	6	61972	61977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_011092	GGT	2	6	61993	61998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011092	CGG	3	9	62091	62099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_011092	TCG	2	6	62103	62108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_011092	GGA	2	6	62124	62129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011092	ACC	2	6	62132	62137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_011092	TGC	2	6	62165	62170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_011092	TGC	2	6	62174	62179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_011092	GCC	2	6	62198	62203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_011092	TGG	2	6	65287	65292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011092	GAT	2	6	67302	67307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011092	CAC	2	6	67316	67321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_011092	ATG	2	6	67344	67349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011092	TAA	2	6	67653	67658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011092	CAG	2	6	67736	67741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_011092	GGA	2	6	67864	67869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011092	AAG	2	6	67889	67894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011092	TGA	2	6	67978	67983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.