MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476 chromosome

Total Repeats: 13670

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011083	AGG	2	6	1340546	1340551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_011083	TAT	2	6	1341132	1341137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_011083	TCG	2	6	1341153	1341158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3504	NC_011083	CGG	2	6	1341167	1341172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3505	NC_011083	ACT	2	6	1341308	1341313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_011083	A	6	6	1341323	1341328	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_011083	AAT	3	9	1342438	1342446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_011083	CT	3	6	1342462	1342467	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3509	NC_011083	AAC	2	6	1343037	1343042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3510	NC_011083	ACAG	2	8	1343104	1343111	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3511	NC_011083	CGG	2	6	1343143	1343148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_011083	GTG	2	6	1343550	1343555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_011083	CTG	2	6	1343789	1343794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3514	NC_011083	GGTTTA	2	12	1343829	1343840	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_011083	CTT	2	6	1343867	1343872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3516	NC_011083	ATG	2	6	1344065	1344070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_011083	TTCTG	2	10	1344092	1344101	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3518	NC_011083	T	6	6	1344108	1344113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_011083	AGG	2	6	1344145	1344150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_011083	CTC	2	6	1350330	1350335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3521	NC_011083	TAA	2	6	1350337	1350342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_011083	CAA	2	6	1350361	1350366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3523	NC_011083	GCG	3	9	1350403	1350411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_011083	CTT	2	6	1350428	1350433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3525	NC_011083	ATG	2	6	1350457	1350462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_011083	GGC	2	6	1350510	1350515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3527	NC_011083	A	6	6	1350779	1350784	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_011083	AAAT	2	8	1350819	1350826	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_011083	TATAA	2	10	1350834	1350843	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_011083	ATC	2	6	1350846	1350851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3531	NC_011083	AAGA	2	8	1350857	1350864	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_011083	T	7	7	1351568	1351574	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_011083	CAAT	2	8	1351598	1351605	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3534	NC_011083	A	6	6	1351608	1351613	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_011083	ACT	3	9	1352469	1352477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3536	NC_011083	GAT	2	6	1352506	1352511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_011083	TTG	2	6	1352555	1352560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_011083	CAT	3	9	1353208	1353216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3539	NC_011083	ATT	2	6	1354089	1354094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_011083	GAG	2	6	1354106	1354111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_011083	CCCT	2	8	1354117	1354124	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3542	NC_011083	CCAT	2	8	1354180	1354187	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3543	NC_011083	ACTC	2	8	1354285	1354292	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3544	NC_011083	GCC	2	6	1354297	1354302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3545	NC_011083	ATT	2	6	1354317	1354322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_011083	TA	3	6	1354328	1354333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_011083	GA	3	6	1354630	1354635	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_011083	TAA	2	6	1354830	1354835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_011083	TAA	2	6	1354852	1354857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_011083	AGG	2	6	1354886	1354891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_011083	GAG	2	6	1355453	1355458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_011083	GA	3	6	1355551	1355556	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_011083	CGT	2	6	1356291	1356296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3554	NC_011083	CGG	2	6	1356300	1356305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3555	NC_011083	GTA	2	6	1357007	1357012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_011083	T	6	6	1357032	1357037	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_011083	CG	3	6	1357054	1357059	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3558	NC_011083	TTTA	2	8	1357100	1357107	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_011083	AGA	2	6	1357212	1357217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_011083	GATA	2	8	1357903	1357910	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_011083	A	7	7	1357920	1357926	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_011083	ATA	2	6	1357951	1357956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_011083	ATA	2	6	1358450	1358455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_011083	TAT	2	6	1358477	1358482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_011083	ACC	2	6	1358496	1358501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3566	NC_011083	CGC	3	9	1358518	1358526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3567	NC_011083	GTT	2	6	1358555	1358560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_011083	CGGCG	2	10	1358580	1358589	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3569	NC_011083	A	6	6	1358601	1358606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_011083	ATA	2	6	1358618	1358623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_011083	GAC	2	6	1358640	1358645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3572	NC_011083	GGTT	2	8	1358728	1358735	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_011083	GCG	2	6	1359170	1359175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3574	NC_011083	CCT	2	6	1359835	1359840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3575	NC_011083	TCA	2	6	1359916	1359921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3576	NC_011083	AGGCG	2	10	1361150	1361159	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3577	NC_011083	CGC	2	6	1362604	1362609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3578	NC_011083	TAA	2	6	1364943	1364948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_011083	AAT	2	6	1364953	1364958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_011083	AT	3	6	1364957	1364962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_011083	TTAA	2	8	1365009	1365016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_011083	AAAAT	2	10	1365039	1365048	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_011083	TAT	2	6	1365055	1365060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_011083	ATA	2	6	1365089	1365094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_011083	CAA	2	6	1365140	1365145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3586	NC_011083	GCTG	2	8	1365162	1365169	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3587	NC_011083	CGT	2	6	1365179	1365184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3588	NC_011083	GATTTT	2	12	1365220	1365231	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_011083	T	6	6	1365245	1365250	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_011083	CCT	2	6	1365289	1365294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3591	NC_011083	TAA	2	6	1365313	1365318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_011083	TAT	2	6	1365390	1365395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_011083	GTA	2	6	1365400	1365405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_011083	T	6	6	1368826	1368831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_011083	TAG	2	6	1368860	1368865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_011083	A	7	7	1368908	1368914	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_011083	AGA	2	6	1368941	1368946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_011083	CTT	2	6	1368968	1368973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3599	NC_011083	TCA	2	6	1369046	1369051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3600	NC_011083	TGG	2	6	1369064	1369069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_011083	ATC	2	6	1369102	1369107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3602	NC_011083	ATC	2	6	1369113	1369118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3603	NC_011083	GGT	3	9	1369130	1369138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_011083	TAG	2	6	1369166	1369171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_011083	GGC	2	6	1370055	1370060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3606	NC_011083	A	6	6	1370129	1370134	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_011083	TAA	2	6	1370188	1370193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_011083	TTG	2	6	1370194	1370199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_011083	GCTG	2	8	1370204	1370211	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3610	NC_011083	TTC	2	6	1370248	1370253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3611	NC_011083	ATG	2	6	1371492	1371497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_011083	GAAAT	2	10	1371560	1371569	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_011083	GCC	2	6	1372442	1372447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3614	NC_011083	GGC	2	6	1372469	1372474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3615	NC_011083	AAT	2	6	1373425	1373430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_011083	AAC	2	6	1373548	1373553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3617	NC_011083	AC	3	6	1373646	1373651	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3618	NC_011083	A	8	8	1373687	1373694	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_011083	CCA	2	6	1374739	1374744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3620	NC_011083	AATC	2	8	1374831	1374838	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3621	NC_011083	GCC	2	6	1374905	1374910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3622	NC_011083	ATA	2	6	1374934	1374939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_011083	GCC	2	6	1374965	1374970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3624	NC_011083	ATT	2	6	1375505	1375510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_011083	GGT	2	6	1375840	1375845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_011083	TGC	2	6	1375884	1375889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3627	NC_011083	ATT	2	6	1375963	1375968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_011083	GCCA	2	8	1375999	1376006	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3629	NC_011083	GCG	2	6	1376071	1376076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3631	NC_011083	GATAC	2	10	1376142	1376151	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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