MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476 chromosome

Total Repeats: 13670

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_011083	CCAT	2	8	1188864	1188871	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3002	NC_011083	GCA	2	6	1188881	1188886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3003	NC_011083	AAT	2	6	1188897	1188902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_011083	AAT	2	6	1188908	1188913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_011083	TCAA	2	8	1189024	1189031	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3006	NC_011083	CAA	2	6	1189087	1189092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_011083	AT	3	6	1189141	1189146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_011083	CGC	2	6	1189672	1189677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3009	NC_011083	GCG	2	6	1189680	1189685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3010	NC_011083	TAC	2	6	1189721	1189726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_011083	GC	3	6	1189745	1189750	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3012	NC_011083	TGG	2	6	1189785	1189790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_011083	CGC	2	6	1189815	1189820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3014	NC_011083	CGG	2	6	1189843	1189848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_011083	GGT	2	6	1189889	1189894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_011083	CCT	2	6	1190440	1190445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3017	NC_011083	TAA	2	6	1192049	1192054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_011083	TGT	2	6	1192068	1192073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_011083	CGG	2	6	1192122	1192127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3020	NC_011083	GAA	3	9	1192148	1192156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_011083	CGG	2	6	1192208	1192213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3022	NC_011083	ATT	2	6	1192693	1192698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_011083	AAT	2	6	1192707	1192712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_011083	TTTA	2	8	1192776	1192783	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_011083	ATGT	2	8	1192794	1192801	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_011083	TAA	3	9	1192805	1192813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_011083	ATCAC	2	10	1192833	1192842	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
3028	NC_011083	TACTT	2	10	1192846	1192855	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3029	NC_011083	AT	3	6	1192898	1192903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_011083	GAG	2	6	1192934	1192939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_011083	GCGCT	2	10	1196962	1196971	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3032	NC_011083	A	7	7	1196984	1196990	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_011083	GCA	3	9	1197052	1197060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3034	NC_011083	A	6	6	1197892	1197897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_011083	GTA	2	6	1198727	1198732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_011083	ATG	2	6	1202030	1202035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_011083	ATT	2	6	1202091	1202096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_011083	T	6	6	1202095	1202100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_011083	ACT	2	6	1202107	1202112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3040	NC_011083	GAT	2	6	1202141	1202146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_011083	CTC	2	6	1202256	1202261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3042	NC_011083	A	6	6	1202294	1202299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_011083	AGT	2	6	1202376	1202381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_011083	TTA	2	6	1202415	1202420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_011083	TTA	2	6	1202605	1202610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_011083	TTA	2	6	1202619	1202624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_011083	GAT	2	6	1202630	1202635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_011083	T	6	6	1202691	1202696	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_011083	TATG	2	8	1202701	1202708	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_011083	TTCCA	2	10	1202757	1202766	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3051	NC_011083	T	6	6	1202874	1202879	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_011083	T	6	6	1202903	1202908	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_011083	TTAT	2	8	1202915	1202922	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_011083	GTG	2	6	1202972	1202977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_011083	ATT	2	6	1203013	1203018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_011083	TGT	2	6	1203033	1203038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_011083	TTAT	2	8	1203044	1203051	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_011083	AG	3	6	1203122	1203127	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_011083	AT	3	6	1203145	1203150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_011083	A	6	6	1203200	1203205	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_011083	CAT	2	6	1204649	1204654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3062	NC_011083	ATAC	2	8	1204667	1204674	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3063	NC_011083	GTT	2	6	1204771	1204776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_011083	GC	3	6	1204798	1204803	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3065	NC_011083	A	6	6	1205286	1205291	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_011083	AAC	2	6	1208408	1208413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3067	NC_011083	TCC	2	6	1209936	1209941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3068	NC_011083	TAC	2	6	1210551	1210556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3069	NC_011083	GT	3	6	1210573	1210578	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_011083	AAT	2	6	1210658	1210663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_011083	TTG	2	6	1210678	1210683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_011083	TTAT	2	8	1210734	1210741	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_011083	TTA	2	6	1210751	1210756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_011083	ACG	2	6	1210809	1210814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3075	NC_011083	TGA	2	6	1210848	1210853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_011083	GAG	2	6	1210873	1210878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_011083	CTC	2	6	1210882	1210887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3078	NC_011083	ATG	2	6	1210902	1210907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_011083	CCG	3	9	1211156	1211164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3080	NC_011083	CGG	2	6	1211171	1211176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3081	NC_011083	T	7	7	1211177	1211183	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_011083	TTAA	2	8	1212309	1212316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_011083	A	7	7	1216416	1216422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_011083	AAG	2	6	1216425	1216430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3086	NC_011083	A	6	6	1216502	1216507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_011083	GA	3	6	1216511	1216516	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_011083	GT	3	6	1216569	1216574	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_011083	ACC	2	6	1216592	1216597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3090	NC_011083	AATA	2	8	1216685	1216692	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_011083	ATT	2	6	1218235	1218240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_011083	GGC	2	6	1218262	1218267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3093	NC_011083	GCCT	2	8	1218275	1218282	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3094	NC_011083	CT	3	6	1218339	1218344	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3095	NC_011083	AT	3	6	1218414	1218419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_011083	ATAA	2	8	1218524	1218531	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_011083	GA	3	6	1218549	1218554	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_011083	GGT	2	6	1218612	1218617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_011083	T	6	6	1218653	1218658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_011083	AAT	2	6	1218675	1218680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_011083	AAT	2	6	1218716	1218721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_011083	AT	3	6	1218742	1218747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_011083	ATT	2	6	1218754	1218759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_011083	TGT	2	6	1218769	1218774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_011083	TAG	2	6	1218778	1218783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_011083	TCAC	2	8	1218813	1218820	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3107	NC_011083	AGT	2	6	1218868	1218873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_011083	ACA	2	6	1218875	1218880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3109	NC_011083	TC	4	8	1218895	1218902	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3110	NC_011083	GGT	3	9	1218904	1218912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_011083	TCA	2	6	1218932	1218937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3112	NC_011083	GTG	2	6	1218971	1218976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_011083	GT	3	6	1218986	1218991	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_011083	CGT	2	6	1218994	1218999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3115	NC_011083	AAGC	2	8	1219006	1219013	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3116	NC_011083	TG	4	8	1219043	1219050	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_011083	TGT	2	6	1219936	1219941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3119	NC_011083	A	6	6	1219970	1219975	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_011083	CAGAG	2	10	1220937	1220946	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3121	NC_011083	A	7	7	1220967	1220973	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_011083	GTAA	2	8	1220981	1220988	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_011083	AGG	2	6	1220989	1220994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_011083	GC	3	6	1221073	1221078	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3125	NC_011083	CAT	2	6	1222731	1222736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3126	NC_011083	ACGAT	2	10	1222741	1222750	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3127	NC_011083	AGC	2	6	1222865	1222870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3128	NC_011083	ATT	2	6	1222927	1222932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_011083	ATT	2	6	1222941	1222946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_011083	TTTTC	2	10	1222982	1222991	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3131	NC_011083	TA	3	6	1223689	1223694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_011083	TAT	2	6	1223718	1223723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_011083	TGC	2	6	1223736	1223741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3134	NC_011083	TGTT	2	8	1223785	1223792	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_011083	GCA	2	6	1223864	1223869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3136	NC_011083	TTA	2	6	1223879	1223884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3137	NC_011083	TTG	2	6	1223967	1223972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3138	NC_011083	TATT	2	8	1223973	1223980	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3139	NC_011083	ATT	2	6	1224081	1224086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3140	NC_011083	TTG	2	6	1224118	1224123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3143	NC_011083	T	6	6	1225337	1225342	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3144	NC_011083	TGA	2	6	1225364	1225369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3147	NC_011083	TGG	2	6	1228769	1228774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3148	NC_011083	TTA	2	6	1228777	1228782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3151	NC_011083	G	7	7	1228914	1228920	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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3155	NC_011083	G	7	7	1229099	1229105	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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3166	NC_011083	CTG	2	6	1234811	1234816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3250	NC_011083	TA	3	6	1259152	1259157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3251	NC_011083	ATA	2	6	1259170	1259175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3252	NC_011083	AAT	2	6	1259191	1259196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3257	NC_011083	GGA	2	6	1262584	1262589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3260	NC_011083	GCC	2	6	1266941	1266946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3262	NC_011083	T	7	7	1272516	1272522	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3263	NC_011083	GTC	2	6	1272524	1272529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3264	NC_011083	CGTA	2	8	1272573	1272580	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3265	NC_011083	CCCG	2	8	1272585	1272592	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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3267	NC_011083	ATT	2	6	1275916	1275921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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