MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476 chromosome

Total Repeats: 13670

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011083	AATG	2	8	383545	383552	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_011083	TCC	2	6	383599	383604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1003	NC_011083	GCC	2	6	383618	383623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1004	NC_011083	GAT	2	6	383650	383655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_011083	TGG	2	6	383752	383757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_011083	TGC	2	6	384199	384204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_011083	AGA	2	6	384209	384214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_011083	TTC	3	9	384472	384480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_011083	ATCTC	2	10	384484	384493	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1010	NC_011083	GTA	2	6	384509	384514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_011083	T	6	6	384528	384533	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_011083	GGT	2	6	384549	384554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_011083	AG	3	6	384605	384610	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_011083	AAC	2	6	384631	384636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_011083	TGG	2	6	384640	384645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_011083	TACCT	2	10	385223	385232	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1017	NC_011083	TTTG	2	8	385241	385248	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_011083	GAA	2	6	385286	385291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_011083	TCC	2	6	385299	385304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1020	NC_011083	CTTC	2	8	385310	385317	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1021	NC_011083	GAT	2	6	385419	385424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_011083	CCA	2	6	385643	385648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1023	NC_011083	CAT	2	6	385700	385705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_011083	CTG	2	6	385748	385753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_011083	CTT	2	6	385771	385776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_011083	GAA	2	6	385801	385806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_011083	TAAA	2	8	386547	386554	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_011083	TAG	2	6	386573	386578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_011083	AAGA	2	8	386620	386627	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_011083	TC	3	6	386693	386698	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1031	NC_011083	GGAA	2	8	386702	386709	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_011083	GCG	2	6	386791	386796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_011083	CCG	2	6	386825	386830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1034	NC_011083	AACT	2	8	386875	386882	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1035	NC_011083	AAC	2	6	387226	387231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_011083	TAC	2	6	387265	387270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_011083	CTG	2	6	389576	389581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_011083	A	6	6	389623	389628	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_011083	AACCA	2	10	389703	389712	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
1040	NC_011083	GTA	2	6	389716	389721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_011083	GT	4	8	389838	389845	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_011083	AGC	2	6	389861	389866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_011083	TGT	2	6	389871	389876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_011083	CAG	2	6	389922	389927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_011083	GCG	2	6	389987	389992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_011083	CGC	2	6	390048	390053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1047	NC_011083	AGG	2	6	390184	390189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_011083	CGA	2	6	390206	390211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_011083	TAAA	2	8	392779	392786	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_011083	AAC	2	6	392977	392982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_011083	GTT	2	6	393822	393827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_011083	T	6	6	394382	394387	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_011083	TG	3	6	394499	394504	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_011083	TCA	2	6	394512	394517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_011083	AAC	2	6	395345	395350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_011083	CCT	2	6	395399	395404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1057	NC_011083	A	6	6	395415	395420	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_011083	TGG	2	6	395430	395435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_011083	CAA	2	6	395504	395509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_011083	CTTT	2	8	402350	402357	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1061	NC_011083	CGG	2	6	406328	406333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_011083	CAT	2	6	409607	409612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_011083	GAA	2	6	409619	409624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_011083	TC	3	6	409656	409661	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1065	NC_011083	CTG	2	6	409853	409858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_011083	TGGT	2	8	410011	410018	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_011083	TTC	2	6	410040	410045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_011083	GTT	2	6	410092	410097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_011083	CTTG	2	8	410103	410110	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1070	NC_011083	ACTT	2	8	410117	410124	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1071	NC_011083	T	6	6	410165	410170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_011083	CAG	2	6	410292	410297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_011083	CGC	2	6	410350	410355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1074	NC_011083	TAT	2	6	410356	410361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_011083	AAG	2	6	410372	410377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_011083	GTG	2	6	410413	410418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_011083	ATG	2	6	410442	410447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_011083	CGA	2	6	410449	410454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_011083	GCT	2	6	410489	410494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_011083	CAA	2	6	410885	410890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_011083	ACC	2	6	410927	410932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1082	NC_011083	GCG	2	6	410935	410940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_011083	TAA	2	6	412975	412980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_011083	TTTTA	2	10	413001	413010	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_011083	AAT	2	6	415838	415843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_011083	TA	3	6	415866	415871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_011083	GTT	2	6	415889	415894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_011083	TGT	2	6	416026	416031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_011083	TAT	2	6	416087	416092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_011083	T	6	6	416164	416169	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_011083	CCGT	2	8	416178	416185	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1092	NC_011083	CGC	2	6	416288	416293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1093	NC_011083	GT	3	6	416424	416429	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_011083	CGA	2	6	416433	416438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_011083	TCG	2	6	416461	416466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_011083	TGA	2	6	416467	416472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_011083	GAC	2	6	416592	416597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_011083	CACT	2	8	416615	416622	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1099	NC_011083	CTG	2	6	416634	416639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_011083	ATT	2	6	416645	416650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_011083	GAA	2	6	416701	416706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_011083	AAC	3	9	416730	416738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_011083	CTGT	2	8	416816	416823	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1104	NC_011083	CGC	2	6	416852	416857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1105	NC_011083	TGA	2	6	416905	416910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_011083	TGAC	2	8	416925	416932	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1107	NC_011083	AGCC	2	8	416966	416973	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1108	NC_011083	CACC	2	8	417000	417007	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1109	NC_011083	CAG	2	6	417046	417051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_011083	CGGA	2	8	417091	417098	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1111	NC_011083	GCC	2	6	417143	417148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1112	NC_011083	TGC	2	6	417204	417209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_011083	TGG	2	6	417223	417228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_011083	TCT	2	6	417361	417366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_011083	CG	3	6	417389	417394	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1116	NC_011083	GCG	2	6	417446	417451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_011083	GGT	2	6	417530	417535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_011083	TGGCTG	2	12	417549	417560	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1119	NC_011083	ACG	2	6	417569	417574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_011083	GCC	2	6	417629	417634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1121	NC_011083	A	6	6	417747	417752	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_011083	AAAG	2	8	417798	417805	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_011083	CGG	2	6	417827	417832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_011083	TC	3	6	417857	417862	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1125	NC_011083	GGC	2	6	418234	418239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_011083	TA	3	6	418306	418311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_011083	AATA	2	8	418319	418326	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_011083	TA	3	6	418325	418330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_011083	TAC	2	6	418341	418346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_011083	GAT	2	6	418371	418376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_011083	AAAAT	2	10	418421	418430	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_011083	GT	3	6	419782	419787	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_011083	ATC	2	6	419809	419814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_011083	T	6	6	419816	419821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_011083	GAA	2	6	421951	421956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1264	NC_011083	GTT	2	6	471962	471967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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