MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476 chromosome

Total Repeats: 13670

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_011083	CGA	2	6	4825532	4825537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13502	NC_011083	CGT	2	6	4825587	4825592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13503	NC_011083	ACG	2	6	4825652	4825657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13504	NC_011083	CAA	2	6	4825800	4825805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13505	NC_011083	CTG	3	9	4825807	4825815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13506	NC_011083	CGA	2	6	4825831	4825836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13507	NC_011083	TCA	2	6	4825874	4825879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13508	NC_011083	CTG	2	6	4825897	4825902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13509	NC_011083	GGCG	2	8	4825917	4825924	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13510	NC_011083	GAAA	2	8	4825939	4825946	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13511	NC_011083	CCG	2	6	4826105	4826110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13512	NC_011083	ATA	2	6	4826126	4826131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13513	NC_011083	T	6	6	4826204	4826209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13514	NC_011083	GC	3	6	4826212	4826217	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13515	NC_011083	CGC	2	6	4826232	4826237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13516	NC_011083	CT	3	6	4826241	4826246	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13517	NC_011083	GGA	2	6	4826705	4826710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13518	NC_011083	CCT	2	6	4827187	4827192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13519	NC_011083	GAT	2	6	4830988	4830993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13520	NC_011083	GCC	2	6	4831015	4831020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13521	NC_011083	AT	3	6	4831028	4831033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13522	NC_011083	A	6	6	4833375	4833380	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13523	NC_011083	TGC	2	6	4833410	4833415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13524	NC_011083	TAA	2	6	4833421	4833426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13525	NC_011083	T	6	6	4833469	4833474	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13526	NC_011083	TAA	2	6	4833503	4833508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13527	NC_011083	CGT	2	6	4834109	4834114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13528	NC_011083	AAC	3	9	4835435	4835443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13529	NC_011083	CA	3	6	4835471	4835476	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13530	NC_011083	CAG	2	6	4835489	4835494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13531	NC_011083	CCA	2	6	4835503	4835508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13532	NC_011083	ATG	2	6	4837008	4837013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13533	NC_011083	AAC	2	6	4837049	4837054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13534	NC_011083	ATGG	2	8	4837123	4837130	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13535	NC_011083	TTG	2	6	4837140	4837145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13536	NC_011083	ATGA	2	8	4837171	4837178	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13537	NC_011083	ATG	2	6	4837209	4837214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13538	NC_011083	TTAAT	2	10	4837249	4837258	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13539	NC_011083	CAAT	2	8	4837331	4837338	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13540	NC_011083	TAAT	2	8	4837366	4837373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13541	NC_011083	TTA	2	6	4837417	4837422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13542	NC_011083	GGC	2	6	4837440	4837445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13543	NC_011083	GGA	2	6	4837454	4837459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13544	NC_011083	TC	3	6	4839336	4839341	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13545	NC_011083	ATA	2	6	4839420	4839425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13546	NC_011083	CAG	3	9	4839437	4839445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13547	NC_011083	ATG	2	6	4840283	4840288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13548	NC_011083	AATGAT	2	12	4840297	4840308	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13549	NC_011083	TTAT	2	8	4841469	4841476	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13550	NC_011083	GTT	3	9	4841546	4841554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13551	NC_011083	TCA	2	6	4841599	4841604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13552	NC_011083	AT	3	6	4841659	4841664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13553	NC_011083	TTATCA	2	12	4841678	4841689	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13554	NC_011083	AGGA	2	8	4841958	4841965	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13555	NC_011083	G	8	8	4841983	4841990	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13556	NC_011083	G	8	8	4842101	4842108	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13557	NC_011083	G	8	8	4842215	4842222	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13558	NC_011083	GATT	2	8	4842382	4842389	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13559	NC_011083	GCGCT	2	10	4842463	4842472	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
13560	NC_011083	GGC	2	6	4843535	4843540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13561	NC_011083	TAG	2	6	4843546	4843551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13562	NC_011083	CGC	2	6	4845206	4845211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13563	NC_011083	AAG	2	6	4845220	4845225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13564	NC_011083	CCG	2	6	4846844	4846849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13565	NC_011083	T	6	6	4846907	4846912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13566	NC_011083	T	6	6	4846927	4846932	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13567	NC_011083	TGA	2	6	4846981	4846986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13568	NC_011083	TAA	2	6	4847064	4847069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13569	NC_011083	CGT	2	6	4847096	4847101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13570	NC_011083	TCG	2	6	4847844	4847849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13571	NC_011083	TCC	2	6	4847857	4847862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13572	NC_011083	CAC	2	6	4847889	4847894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13573	NC_011083	AT	3	6	4848148	4848153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13574	NC_011083	GCC	2	6	4850110	4850115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13575	NC_011083	GGC	2	6	4852563	4852568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13576	NC_011083	GAA	2	6	4852602	4852607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13577	NC_011083	CGG	2	6	4852618	4852623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13578	NC_011083	GCGCT	2	10	4853575	4853584	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
13579	NC_011083	GCC	2	6	4853629	4853634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13580	NC_011083	AGG	2	6	4853669	4853674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13581	NC_011083	CTGAT	2	10	4855010	4855019	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
13582	NC_011083	ATT	2	6	4855022	4855027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13583	NC_011083	TGT	2	6	4856282	4856287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13584	NC_011083	TCG	2	6	4856367	4856372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13585	NC_011083	AC	3	6	4856415	4856420	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13586	NC_011083	GCC	2	6	4856445	4856450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13587	NC_011083	AAC	2	6	4856461	4856466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13588	NC_011083	TTTAAT	2	12	4860955	4860966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13589	NC_011083	ATA	2	6	4860977	4860982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13590	NC_011083	TGT	2	6	4862704	4862709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13591	NC_011083	ATA	2	6	4862719	4862724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13592	NC_011083	TC	3	6	4862740	4862745	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13593	NC_011083	ATT	2	6	4862750	4862755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13594	NC_011083	TTA	2	6	4863793	4863798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13595	NC_011083	CTG	2	6	4864461	4864466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13596	NC_011083	AGCGCC	2	12	4865577	4865588	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
13597	NC_011083	TGTA	2	8	4867010	4867017	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13598	NC_011083	TGT	2	6	4867022	4867027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13599	NC_011083	TGT	2	6	4867078	4867083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13600	NC_011083	AAGCG	2	10	4867093	4867102	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
13601	NC_011083	CAG	2	6	4867130	4867135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13602	NC_011083	AAGCGC	2	12	4868465	4868476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13603	NC_011083	CAGC	2	8	4870242	4870249	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13604	NC_011083	A	6	6	4870272	4870277	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13605	NC_011083	ATG	2	6	4870335	4870340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13606	NC_011083	GTTAT	2	10	4872318	4872327	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13607	NC_011083	CGG	2	6	4872354	4872359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13608	NC_011083	ACA	2	6	4872776	4872781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13609	NC_011083	A	8	8	4873349	4873356	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13610	NC_011083	CAA	2	6	4874890	4874895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13611	NC_011083	ATA	2	6	4874921	4874926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13612	NC_011083	T	6	6	4874930	4874935	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13613	NC_011083	T	8	8	4874955	4874962	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13614	NC_011083	T	7	7	4874975	4874981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13615	NC_011083	ATT	2	6	4874999	4875004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13616	NC_011083	ATTTT	2	10	4875026	4875035	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13617	NC_011083	TAA	2	6	4875044	4875049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13618	NC_011083	CTG	2	6	4877714	4877719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13619	NC_011083	GC	4	8	4879099	4879106	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13620	NC_011083	CCA	2	6	4880839	4880844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13621	NC_011083	AAAGT	2	10	4883407	4883416	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
13622	NC_011083	CCTG	2	8	4884155	4884162	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13623	NC_011083	TTG	2	6	4884736	4884741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13624	NC_011083	TA	3	6	4884774	4884779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13625	NC_011083	AAATA	2	10	4884780	4884789	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13626	NC_011083	CTT	2	6	4884811	4884816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13627	NC_011083	TCTGT	2	10	4884817	4884826	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
13628	NC_011083	GGC	2	6	4884836	4884841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13629	NC_011083	TAA	2	6	4884928	4884933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13630	NC_011083	AAG	2	6	4884944	4884949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13631	NC_011083	TGA	2	6	4884956	4884961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13632	NC_011083	T	6	6	4884985	4884990	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13633	NC_011083	ATA	2	6	4884992	4884997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13634	NC_011083	ATT	3	9	4884998	4885006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13635	NC_011083	GGA	2	6	4885011	4885016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13637	NC_011083	ACG	2	6	4885054	4885059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13638	NC_011083	ATT	2	6	4885750	4885755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13639	NC_011083	CAA	2	6	4885840	4885845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13640	NC_011083	TGA	2	6	4885922	4885927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13641	NC_011083	AGCGA	2	10	4885999	4886008	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
13642	NC_011083	GGA	2	6	4886023	4886028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13643	NC_011083	GA	3	6	4886036	4886041	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13644	NC_011083	GGCG	2	8	4886057	4886064	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13645	NC_011083	CGC	2	6	4886084	4886089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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13649	NC_011083	TCA	2	6	4886202	4886207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13650	NC_011083	ATT	2	6	4886257	4886262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13651	NC_011083	AGC	2	6	4886368	4886373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13652	NC_011083	TGA	2	6	4886383	4886388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13653	NC_011083	AGC	2	6	4886415	4886420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13654	NC_011083	T	6	6	4886431	4886436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13655	NC_011083	T	6	6	4886475	4886480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13656	NC_011083	AGG	2	6	4886608	4886613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13658	NC_011083	CAA	2	6	4887565	4887570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13659	NC_011083	CAT	2	6	4887571	4887576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13660	NC_011083	TAA	2	6	4887682	4887687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13661	NC_011083	AT	3	6	4887705	4887710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13662	NC_011083	TGA	2	6	4887739	4887744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13663	NC_011083	ATC	2	6	4887746	4887751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13664	NC_011083	TCA	2	6	4887770	4887775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13666	NC_011083	TGA	2	6	4887822	4887827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13667	NC_011083	TAAAT	2	10	4887850	4887859	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13668	NC_011083	TAAA	2	8	4887865	4887872	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13669	NC_011083	CAG	2	6	4887873	4887878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13670	NC_011083	ATA	2	6	4888763	4888768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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