MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476 chromosome

Total Repeats: 13670

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_011083	CATGC	2	10	2586778	2586787	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7002	NC_011083	TGG	2	6	2586859	2586864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7003	NC_011083	CATGC	2	10	2586896	2586905	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7004	NC_011083	CAT	2	6	2586966	2586971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7005	NC_011083	AGT	2	6	2587071	2587076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7006	NC_011083	ATA	2	6	2587916	2587921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7007	NC_011083	CTGCC	2	10	2587934	2587943	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
7008	NC_011083	ACG	2	6	2589563	2589568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7009	NC_011083	AACA	2	8	2589569	2589576	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7010	NC_011083	CA	3	6	2589630	2589635	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7011	NC_011083	AGG	2	6	2589677	2589682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7012	NC_011083	CGG	2	6	2589687	2589692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7013	NC_011083	TCA	2	6	2589703	2589708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7014	NC_011083	ACT	2	6	2589716	2589721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7015	NC_011083	CCG	2	6	2589733	2589738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7016	NC_011083	AGG	2	6	2589798	2589803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7017	NC_011083	CGG	2	6	2589808	2589813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7018	NC_011083	TCA	2	6	2589824	2589829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7019	NC_011083	CAC	2	6	2589832	2589837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7020	NC_011083	AGG	2	6	2589915	2589920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7021	NC_011083	CGG	2	6	2589925	2589930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7022	NC_011083	TCA	2	6	2589941	2589946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7023	NC_011083	CAC	2	6	2589949	2589954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7024	NC_011083	CCA	2	6	2590028	2590033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7025	NC_011083	A	6	6	2590038	2590043	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7026	NC_011083	T	6	6	2590059	2590064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7027	NC_011083	TGCGC	2	10	2590118	2590127	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
7028	NC_011083	GAC	2	6	2590142	2590147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7029	NC_011083	TCA	2	6	2593578	2593583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7030	NC_011083	TTGC	2	8	2593652	2593659	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7031	NC_011083	TTAA	2	8	2593708	2593715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7032	NC_011083	TAA	2	6	2593721	2593726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7033	NC_011083	CA	3	6	2594552	2594557	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7034	NC_011083	AGAT	2	8	2594563	2594570	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7035	NC_011083	AT	3	6	2595511	2595516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7036	NC_011083	A	6	6	2598837	2598842	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7037	NC_011083	TGT	2	6	2599887	2599892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7038	NC_011083	CCA	2	6	2599905	2599910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7039	NC_011083	CAAGTG	2	12	2599951	2599962	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7040	NC_011083	GCA	2	6	2599977	2599982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7041	NC_011083	T	6	6	2600013	2600018	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7042	NC_011083	CCA	2	6	2600910	2600915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7043	NC_011083	GC	3	6	2600950	2600955	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7044	NC_011083	GTA	2	6	2600974	2600979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7045	NC_011083	ATT	2	6	2601077	2601082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7046	NC_011083	CTGG	2	8	2601126	2601133	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7047	NC_011083	A	6	6	2602176	2602181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7048	NC_011083	T	6	6	2602198	2602203	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7049	NC_011083	TCACC	2	10	2602222	2602231	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
7050	NC_011083	GCC	2	6	2602481	2602486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7051	NC_011083	T	7	7	2602796	2602802	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7052	NC_011083	GAA	2	6	2605134	2605139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7053	NC_011083	T	7	7	2605158	2605164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7054	NC_011083	GCC	2	6	2605177	2605182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7055	NC_011083	GTGCA	2	10	2605194	2605203	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7056	NC_011083	CAG	2	6	2606392	2606397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7057	NC_011083	TTA	2	6	2608499	2608504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7058	NC_011083	GCA	2	6	2608935	2608940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7059	NC_011083	AATT	2	8	2609633	2609640	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7060	NC_011083	TCA	2	6	2609658	2609663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7061	NC_011083	TG	3	6	2609702	2609707	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7062	NC_011083	A	6	6	2610807	2610812	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7063	NC_011083	TCA	2	6	2614708	2614713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7064	NC_011083	TA	3	6	2614747	2614752	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7065	NC_011083	TGA	2	6	2614758	2614763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7066	NC_011083	TCCC	2	8	2614792	2614799	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
7067	NC_011083	CGCGG	2	10	2614802	2614811	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
7068	NC_011083	GGA	2	6	2614812	2614817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7069	NC_011083	TAA	2	6	2615679	2615684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7070	NC_011083	A	7	7	2615732	2615738	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7071	NC_011083	TGA	2	6	2615781	2615786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7072	NC_011083	TCC	2	6	2616762	2616767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7073	NC_011083	AAGCG	2	10	2616826	2616835	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
7074	NC_011083	CTTT	2	8	2617437	2617444	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7075	NC_011083	ATTA	2	8	2617446	2617453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7076	NC_011083	GTTG	2	8	2617456	2617463	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7077	NC_011083	A	6	6	2618435	2618440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7078	NC_011083	TGAAA	2	10	2618467	2618476	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7079	NC_011083	TCA	2	6	2618490	2618495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7080	NC_011083	CGT	2	6	2618501	2618506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7081	NC_011083	CGATA	2	10	2618518	2618527	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7082	NC_011083	GCC	2	6	2621231	2621236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7083	NC_011083	TCT	2	6	2622350	2622355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7084	NC_011083	CGCC	2	8	2622364	2622371	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7085	NC_011083	GC	3	6	2632397	2632402	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7086	NC_011083	CCA	2	6	2635743	2635748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7087	NC_011083	T	6	6	2636125	2636130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7088	NC_011083	AGAA	2	8	2636189	2636196	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7089	NC_011083	GTG	2	6	2636238	2636243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7090	NC_011083	AAAT	2	8	2636286	2636293	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7091	NC_011083	TAC	2	6	2636316	2636321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7092	NC_011083	AAT	2	6	2636332	2636337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7093	NC_011083	C	8	8	2636411	2636418	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7094	NC_011083	GCG	2	6	2636446	2636451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7095	NC_011083	A	7	7	2636455	2636461	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7096	NC_011083	AGA	2	6	2636481	2636486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7097	NC_011083	GA	3	6	2636485	2636490	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7098	NC_011083	TGT	2	6	2638784	2638789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7099	NC_011083	ACG	2	6	2638885	2638890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7100	NC_011083	AC	3	6	2639012	2639017	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7101	NC_011083	ACTTT	2	10	2639027	2639036	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
7102	NC_011083	CTG	2	6	2642325	2642330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7103	NC_011083	AAC	2	6	2642432	2642437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7104	NC_011083	AAC	2	6	2643494	2643499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7105	NC_011083	AAC	2	6	2643511	2643516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7106	NC_011083	GC	3	6	2643540	2643545	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7107	NC_011083	T	6	6	2643580	2643585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7108	NC_011083	AT	3	6	2643596	2643601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7109	NC_011083	CTG	2	6	2644243	2644248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7110	NC_011083	ATC	2	6	2644385	2644390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7111	NC_011083	GC	3	6	2645746	2645751	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7112	NC_011083	GTA	2	6	2645770	2645775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7113	NC_011083	GCC	2	6	2645809	2645814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7114	NC_011083	GCG	2	6	2645819	2645824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7115	NC_011083	AAG	2	6	2645904	2645909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7116	NC_011083	CTTC	2	8	2645927	2645934	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7117	NC_011083	TCA	2	6	2645969	2645974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7118	NC_011083	T	6	6	2646082	2646087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7119	NC_011083	TTA	2	6	2648150	2648155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7120	NC_011083	ATTT	2	8	2648231	2648238	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7121	NC_011083	A	6	6	2653318	2653323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7122	NC_011083	ATTT	2	8	2653383	2653390	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7123	NC_011083	ATA	2	6	2653443	2653448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7124	NC_011083	CT	3	6	2653451	2653456	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7125	NC_011083	TAT	3	9	2653457	2653465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7126	NC_011083	AG	3	6	2653491	2653496	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7127	NC_011083	TTG	2	6	2653513	2653518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7128	NC_011083	CTA	2	6	2653617	2653622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7129	NC_011083	A	6	6	2653640	2653645	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7130	NC_011083	ATT	2	6	2653722	2653727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7132	NC_011083	ATTG	2	8	2653750	2653757	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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