MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 13053

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011080	TTGA	2	8	389642	389649	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_011080	TC	3	6	389668	389673	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1003	NC_011080	ATAG	2	8	389683	389690	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_011080	ATA	2	6	389759	389764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_011080	T	6	6	389827	389832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_011080	ATT	2	6	389942	389947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_011080	T	6	6	390004	390009	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_011080	ATA	2	6	390017	390022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_011080	GTC	2	6	390024	390029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_011080	ATG	2	6	390033	390038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_011080	AAT	2	6	391273	391278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_011080	TCA	2	6	391316	391321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_011080	TC	3	6	391478	391483	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1014	NC_011080	AAGG	2	8	391543	391550	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_011080	A	7	7	393163	393169	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_011080	AT	3	6	393182	393187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_011080	GAA	2	6	393210	393215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_011080	TGT	2	6	394456	394461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_011080	AAT	2	6	394520	394525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_011080	AGG	2	6	394572	394577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_011080	GATGC	2	10	394619	394628	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1022	NC_011080	TAA	2	6	394664	394669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_011080	A	6	6	394668	394673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_011080	AT	3	6	394713	394718	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_011080	TAA	2	6	394753	394758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_011080	TG	3	6	394791	394796	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_011080	TA	3	6	394822	394827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_011080	ATA	2	6	395415	395420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_011080	TGC	2	6	395424	395429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_011080	TGA	2	6	395506	395511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_011080	A	6	6	396161	396166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_011080	GA	3	6	396185	396190	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_011080	CTA	2	6	396208	396213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_011080	TGC	2	6	396214	396219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_011080	A	6	6	396253	396258	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_011080	AG	3	6	396273	396278	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_011080	A	6	6	396286	396291	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_011080	CAT	2	6	396326	396331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_011080	TTC	2	6	396343	396348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_011080	TTA	2	6	396416	396421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_011080	AT	3	6	396826	396831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_011080	GC	5	10	396841	396850	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1043	NC_011080	CAT	2	6	402895	402900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_011080	GTC	2	6	403014	403019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_011080	CA	3	6	405843	405848	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1046	NC_011080	A	6	6	406141	406146	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_011080	TAA	2	6	406177	406182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_011080	TA	3	6	406223	406228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_011080	GAC	2	6	406278	406283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_011080	CGC	2	6	406302	406307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1051	NC_011080	T	6	6	406325	406330	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_011080	TCCT	2	8	407639	407646	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1053	NC_011080	AAC	2	6	407673	407678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_011080	ATG	2	6	407687	407692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_011080	ATC	2	6	407718	407723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_011080	T	6	6	407730	407735	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_011080	ATTG	2	8	407747	407754	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_011080	TGAA	2	8	412737	412744	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_011080	GCC	2	6	412782	412787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1060	NC_011080	AGCG	2	8	412792	412799	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1061	NC_011080	CCCGT	2	10	412827	412836	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1062	NC_011080	TAC	2	6	413019	413024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_011080	GAC	2	6	413043	413048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_011080	CAGC	2	8	413084	413091	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1065	NC_011080	A	8	8	413095	413102	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_011080	CGTTT	2	10	413154	413163	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1067	NC_011080	TA	4	8	413204	413211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_011080	GGGA	2	8	413215	413222	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_011080	TCG	2	6	415788	415793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_011080	ATT	2	6	415879	415884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_011080	CCG	2	6	417001	417006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1072	NC_011080	T	6	6	417036	417041	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_011080	TAA	2	6	417098	417103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_011080	TTA	2	6	419941	419946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_011080	GAT	2	6	419959	419964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_011080	GTT	2	6	420003	420008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_011080	ACT	2	6	420053	420058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_011080	GAT	2	6	420099	420104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_011080	TAA	3	9	420109	420117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_011080	CAT	2	6	420417	420422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_011080	CGG	2	6	420444	420449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_011080	TCA	2	6	420513	420518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_011080	T	6	6	422197	422202	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_011080	TTTTC	2	10	422274	422283	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1085	NC_011080	CTTTG	2	10	422381	422390	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1086	NC_011080	AAGGCG	2	12	423337	423348	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1087	NC_011080	TACGG	2	10	423388	423397	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1088	NC_011080	AAT	2	6	423427	423432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_011080	TTA	2	6	424622	424627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_011080	G	7	7	428088	428094	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_011080	GC	3	6	428115	428120	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1092	NC_011080	GCAG	2	8	429158	429165	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1093	NC_011080	CTT	2	6	429228	429233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_011080	TA	3	6	429235	429240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_011080	GTT	2	6	429294	429299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_011080	GAG	2	6	429608	429613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_011080	TC	3	6	432515	432520	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1098	NC_011080	ATT	2	6	432575	432580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_011080	CGA	2	6	433255	433260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_011080	GGT	2	6	434445	434450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_011080	TAC	2	6	434463	434468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_011080	CGG	2	6	434470	434475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_011080	A	6	6	434498	434503	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_011080	A	6	6	434511	434516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_011080	CGG	2	6	434522	434527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_011080	CTG	2	6	434596	434601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_011080	TCG	2	6	434612	434617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_011080	GCC	2	6	434715	434720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1109	NC_011080	CAG	2	6	434725	434730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_011080	TAA	2	6	434734	434739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_011080	AAG	2	6	434744	434749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_011080	GC	3	6	437121	437126	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1113	NC_011080	GAT	2	6	437454	437459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_011080	CTCG	2	8	437649	437656	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1115	NC_011080	TTG	2	6	437681	437686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_011080	TA	3	6	439861	439866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_011080	ATG	2	6	439887	439892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_011080	ACC	2	6	439938	439943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1119	NC_011080	GCTAA	2	10	439960	439969	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1120	NC_011080	AT	3	6	441267	441272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_011080	ATT	2	6	441330	441335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_011080	T	6	6	441337	441342	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_011080	TAT	2	6	441350	441355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_011080	GCG	2	6	441388	441393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_011080	ATT	2	6	441403	441408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_011080	TTC	2	6	441418	441423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_011080	TTC	2	6	441464	441469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_011080	TAA	2	6	441494	441499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_011080	ACA	2	6	441784	441789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_011080	GTT	2	6	441792	441797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_011080	AGA	2	6	441859	441864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_011080	TAA	2	6	441888	441893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_011080	GTT	2	6	441910	441915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_011080	TCAA	2	8	441971	441978	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1135	NC_011080	AT	3	6	441985	441990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_011080	GTAA	2	8	441999	442006	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_011080	GGT	2	6	442021	442026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1275	NC_011080	TA	3	6	508375	508380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1276	NC_011080	GGC	2	6	508390	508395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1277	NC_011080	CGT	3	9	508436	508444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1278	NC_011080	AGA	2	6	508463	508468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1279	NC_011080	A	6	6	509778	509783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1280	NC_011080	G	6	6	509784	509789	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1281	NC_011080	TG	3	6	509833	509838	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1282	NC_011080	GGT	2	6	509873	509878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1283	NC_011080	ACTAA	2	10	509916	509925	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1284	NC_011080	GA	3	6	509926	509931	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1285	NC_011080	TAA	2	6	512312	512317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1286	NC_011080	T	7	7	512354	512360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1287	NC_011080	CCA	2	6	512393	512398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1289	NC_011080	GAAGA	2	10	512490	512499	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1290	NC_011080	T	6	6	512828	512833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1292	NC_011080	ATGCG	2	10	512923	512932	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1293	NC_011080	CAG	2	6	513001	513006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1295	NC_011080	TCG	2	6	514935	514940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1298	NC_011080	AAC	3	9	515537	515545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1299	NC_011080	GCC	2	6	516046	516051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1311	NC_011080	G	6	6	527709	527714	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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1317	NC_011080	CTG	2	6	528961	528966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1322	NC_011080	T	6	6	531204	531209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1323	NC_011080	GTA	2	6	531713	531718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1326	NC_011080	TGG	2	6	532363	532368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1393	NC_011080	TTA	2	6	566825	566830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1406	NC_011080	TAG	2	6	574016	574021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1408	NC_011080	TTA	2	6	574065	574070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1409	NC_011080	CTAT	2	8	574097	574104	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1410	NC_011080	AC	3	6	575324	575329	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1412	NC_011080	AC	3	6	575359	575364	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1413	NC_011080	CAT	2	6	575372	575377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1414	NC_011080	AAT	2	6	575380	575385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1415	NC_011080	CAG	2	6	575394	575399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1416	NC_011080	ATC	2	6	579197	579202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1422	NC_011080	T	6	6	581806	581811	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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