MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae G54 chromosome

Total Repeats: 898

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011072	CTAT	2	8	138	145	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_011072	ATAA	2	8	1699	1706	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011072	TTAG	2	8	3119	3126	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011072	GCTT	2	8	15426	15433	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_011072	CCTG	2	8	15474	15481	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_011072	GTGA	2	8	15754	15761	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011072	AGCG	2	8	15925	15932	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_011072	AGCC	2	8	16806	16813	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_011072	GTAA	2	8	17228	17235	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011072	GCGA	2	8	17384	17391	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_011072	ATTC	2	8	18250	18257	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_011072	CTAA	2	8	18604	18611	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_011072	GTCT	2	8	18629	18636	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_011072	TAGG	2	8	19260	19267	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011072	AATA	2	8	24025	24032	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011072	AGAA	2	8	26994	27001	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011072	TTGA	2	8	27717	27724	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011072	AATA	2	8	28820	28827	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011072	TTCT	2	8	29194	29201	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_011072	AATT	2	8	30286	30293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011072	CTAT	2	8	30390	30397	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_011072	ATTT	2	8	39254	39261	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011072	GGGA	2	8	39371	39378	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011072	GAAG	2	8	39394	39401	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011072	TGAC	2	8	39508	39515	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_011072	TATT	2	8	43228	43235	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011072	ATAG	2	8	47815	47822	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011072	TTTC	2	8	53122	53129	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_011072	TAAT	2	8	63366	63373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011072	GTTT	2	8	69370	69377	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011072	AAGA	2	8	70571	70578	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011072	ACTT	2	8	71992	71999	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_011072	TTGA	2	8	77892	77899	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011072	GAAG	2	8	83427	83434	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011072	AAAG	2	8	84418	84425	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011072	AAAT	2	8	86115	86122	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011072	CTTT	2	8	86176	86183	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_011072	AATT	2	8	89208	89215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011072	TTTG	2	8	90146	90153	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011072	ATTC	2	8	93891	93898	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_011072	AAAT	2	8	94049	94056	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011072	ATAA	2	8	94092	94099	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011072	GTTT	2	8	95182	95189	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011072	TGTA	2	8	95218	95225	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011072	ACAT	2	8	99169	99176	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_011072	AAAG	2	8	99187	99194	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011072	TCCA	2	8	103714	103721	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_011072	TCCA	2	8	103759	103766	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_011072	AGAA	2	8	106349	106356	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011072	AGCC	2	8	107157	107164	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_011072	TAGA	2	8	107244	107251	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011072	GAAG	2	8	107662	107669	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011072	AAAT	2	8	107746	107753	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011072	TTAC	2	8	107895	107902	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_011072	TTCA	2	8	110842	110849	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_011072	GTAG	2	8	113177	113184	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011072	GTAT	2	8	113235	113242	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011072	TGCT	2	8	113372	113379	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_011072	AGGA	2	8	113568	113575	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011072	GATA	2	8	114740	114747	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011072	TCTA	2	8	115214	115221	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_011072	TGAA	2	8	115306	115313	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011072	TTTA	2	8	115327	115334	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011072	AAGC	2	8	115412	115419	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_011072	TTAT	2	8	117177	117184	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011072	ATAA	2	8	117210	117217	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011072	GTAT	2	8	118384	118391	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011072	TTTA	2	8	118436	118443	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011072	ATTT	2	8	121700	121707	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011072	AATT	2	8	122296	122303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011072	AAGA	2	8	122592	122599	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011072	GAAA	2	8	123056	123063	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011072	GAAG	2	8	123166	123173	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011072	TTAT	2	8	125676	125683	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011072	TGAA	2	8	125694	125701	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011072	AAAG	2	8	129678	129685	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011072	TTGC	2	8	131980	131987	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_011072	TAGG	2	8	136820	136827	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011072	GTAG	2	8	136918	136925	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011072	AAGC	2	8	136939	136946	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_011072	CTGC	2	8	137107	137114	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_011072	GGGA	2	8	141420	141427	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011072	ATTT	2	8	141803	141810	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011072	AAAG	2	8	142048	142055	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011072	ATGA	2	8	143580	143587	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011072	TTTA	2	8	143701	143708	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011072	GGCT	2	8	146048	146055	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_011072	AATT	2	8	150346	150353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011072	GAAA	2	8	150424	150431	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011072	AGAT	2	8	151458	151465	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011072	CAAA	2	8	152467	152474	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_011072	TTTC	2	8	163853	163860	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_011072	TAAT	2	8	165094	165101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011072	AGCT	2	8	174395	174402	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_011072	AGAA	2	8	176249	176256	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011072	GGTA	2	8	180270	180277	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011072	AGAA	2	8	180728	180735	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011072	AAAT	2	8	181320	181327	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011072	ATTG	2	8	182839	182846	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011072	AGAA	2	8	186394	186401	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011072	AGAA	2	8	188225	188232	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011072	GCAT	2	8	188247	188254	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_011072	AGAA	2	8	192402	192409	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011072	GTTT	2	8	200263	200270	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011072	ACAA	2	8	200271	200278	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_011072	ACAA	2	8	205240	205247	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_011072	TAAA	2	8	209355	209362	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011072	TTTA	2	8	209429	209436	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011072	TCAT	2	8	209504	209511	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_011072	CTTG	2	8	210245	210252	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_011072	AAAG	2	8	211820	211827	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011072	AAGA	2	8	211919	211926	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011072	AATT	2	8	214316	214323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011072	GAAA	2	8	215494	215501	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011072	ACGA	2	8	215509	215516	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_011072	GAAA	2	8	219609	219616	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011072	GAAA	2	8	219630	219637	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011072	AATT	2	8	223984	223991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011072	TATT	2	8	224083	224090	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011072	ATTA	2	8	224099	224106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011072	ATTT	2	8	226839	226846	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011072	TAAA	2	8	228209	228216	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011072	TTTA	2	8	228228	228235	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011072	TTTA	2	8	228416	228423	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011072	AATA	2	8	230897	230904	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011072	CTGA	2	8	237179	237186	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_011072	GAAA	2	8	237262	237269	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011072	CAAT	2	8	244292	244299	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_011072	GAAA	2	8	244360	244367	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011072	CAAG	2	8	244536	244543	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_011072	CTAA	2	8	245834	245841	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_011072	AAAT	2	8	246002	246009	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011072	AAAC	2	8	246015	246022	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_011072	GAAG	2	8	248123	248130	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011072	CTTT	2	8	252661	252668	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_011072	ATAA	2	8	259310	259317	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011072	GATT	2	8	261610	261617	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011072	GCAG	2	8	262769	262776	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_011072	CAAA	2	8	262789	262796	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_011072	CAAA	2	8	262828	262835	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_011072	CTTT	2	8	269241	269248	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_011072	GGAA	2	8	269532	269539	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011072	ACAA	2	8	271205	271212	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_011072	AGGA	2	8	271536	271543	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011072	GTAA	2	8	279152	279159	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011072	GCTG	2	8	279239	279246	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_011072	AATA	3	12	282520	282531	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011072	TTTA	2	8	282534	282541	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_011072	ATTT	2	8	282549	282556	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_011072	TGAT	2	8	296037	296044	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_011072	CTAG	2	8	296395	296402	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
152	NC_011072	AGTT	2	8	298806	298813	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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