MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae G54 chromosome

Total Repeats: 6612

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011072	GAA	2	6	278240	278245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_011072	A	6	6	278273	278278	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_011072	T	6	6	278299	278304	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_011072	ATT	2	6	278310	278315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_011072	TAGAA	2	10	278339	278348	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_011072	TA	3	6	278426	278431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_011072	A	7	7	278473	278479	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_011072	A	6	6	278532	278537	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_011072	AGT	2	6	278643	278648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_011072	GAT	2	6	278943	278948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_011072	TTC	2	6	278949	278954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_011072	AT	3	6	278989	278994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_011072	CTA	2	6	279092	279097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_011072	GTAA	2	8	279152	279159	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_011072	AAC	2	6	279211	279216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_011072	GCTG	2	8	279239	279246	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1017	NC_011072	ACC	2	6	279275	279280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1018	NC_011072	GGT	2	6	279290	279295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_011072	TCT	2	6	281620	281625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_011072	AATA	3	12	282520	282531	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_011072	TTTA	2	8	282534	282541	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_011072	ATTT	2	8	282549	282556	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_011072	T	7	7	282627	282633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_011072	A	7	7	282634	282640	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_011072	TAA	2	6	288698	288703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_011072	TAG	2	6	288708	288713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_011072	AAATA	2	10	289762	289771	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_011072	ATT	2	6	289798	289803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_011072	TTC	2	6	291193	291198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_011072	TA	3	6	291215	291220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_011072	TAT	2	6	291229	291234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_011072	T	6	6	291273	291278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_011072	GAA	2	6	291279	291284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_011072	TAG	2	6	291286	291291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_011072	GCT	2	6	295956	295961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_011072	TAG	2	6	295969	295974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_011072	TGAT	2	8	296037	296044	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_011072	GTA	2	6	296231	296236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_011072	TAT	2	6	296237	296242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_011072	GAAAAA	2	12	296357	296368	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_011072	CTAG	2	8	296395	296402	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1042	NC_011072	T	6	6	296409	296414	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_011072	A	6	6	298604	298609	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_011072	A	7	7	298624	298630	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_011072	TAG	2	6	298665	298670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_011072	TAT	2	6	298676	298681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_011072	TAG	2	6	298700	298705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_011072	ATT	2	6	298778	298783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_011072	AGTT	2	8	298806	298813	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_011072	CCG	2	6	298817	298822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1051	NC_011072	GGT	2	6	298842	298847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_011072	TCT	2	6	299383	299388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_011072	AG	3	6	299420	299425	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_011072	TAT	2	6	300962	300967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_011072	A	6	6	300971	300976	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_011072	A	6	6	301002	301007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_011072	AAT	2	6	301079	301084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_011072	T	6	6	302707	302712	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_011072	GGA	2	6	302750	302755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_011072	T	6	6	302781	302786	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_011072	ACAAGA	2	12	303037	303048	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1062	NC_011072	GGA	2	6	303152	303157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_011072	CA	3	6	303186	303191	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1064	NC_011072	TAT	2	6	303225	303230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_011072	ATA	3	9	303233	303241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_011072	TCT	2	6	303386	303391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_011072	TTA	2	6	303409	303414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_011072	TCA	2	6	303471	303476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_011072	TAG	2	6	303572	303577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_011072	CTA	2	6	303677	303682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_011072	A	8	8	303706	303713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_011072	A	6	6	303729	303734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_011072	ATG	2	6	303748	303753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_011072	GA	3	6	306655	306660	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_011072	TA	3	6	313965	313970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_011072	AGG	2	6	314013	314018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_011072	GT	3	6	315113	315118	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_011072	GCT	2	6	317690	317695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_011072	TAA	2	6	318616	318621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_011072	GAA	2	6	319214	319219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_011072	TTG	2	6	319227	319232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_011072	GCA	2	6	319241	319246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_011072	GAAG	2	8	319252	319259	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_011072	T	6	6	319260	319265	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_011072	CAAG	2	8	319277	319284	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1086	NC_011072	ATC	2	6	319292	319297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_011072	TGA	2	6	319369	319374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_011072	AAG	2	6	319392	319397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_011072	A	6	6	319634	319639	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_011072	GGT	2	6	319645	319650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_011072	T	6	6	319942	319947	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_011072	TGT	2	6	319955	319960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_011072	AAT	2	6	319967	319972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_011072	GA	3	6	320026	320031	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_011072	T	6	6	322086	322091	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_011072	AAAG	2	8	322100	322107	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_011072	TAT	2	6	322204	322209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_011072	ATT	2	6	322229	322234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_011072	T	6	6	322233	322238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_011072	AGGA	2	8	322269	322276	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_011072	T	6	6	322280	322285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_011072	TCT	2	6	327727	327732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_011072	A	6	6	327771	327776	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_011072	GAT	2	6	327794	327799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_011072	TAT	2	6	330589	330594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_011072	T	7	7	331177	331183	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_011072	ATA	3	9	331186	331194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_011072	GA	4	8	331211	331218	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_011072	AG	4	8	331771	331778	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_011072	GTA	2	6	331849	331854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_011072	GAT	2	6	331893	331898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_011072	GAAG	2	8	331903	331910	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_011072	T	6	6	331992	331997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_011072	TTCT	2	8	334615	334622	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1115	NC_011072	ATAAA	2	10	334640	334649	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_011072	GCAGTT	2	12	336805	336816	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1117	NC_011072	T	6	6	336827	336832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_011072	GAG	2	6	336833	336838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_011072	TA	3	6	336843	336848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_011072	AGG	2	6	336884	336889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_011072	AT	3	6	336890	336895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_011072	AAG	2	6	337960	337965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_011072	TGT	2	6	337972	337977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_011072	TAT	2	6	339304	339309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_011072	CAAA	2	8	339351	339358	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1126	NC_011072	ATC	2	6	339400	339405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_011072	T	6	6	339438	339443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_011072	GTA	2	6	339479	339484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_011072	TCA	2	6	339512	339517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_011072	GAT	2	6	339524	339529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_011072	TAA	2	6	339557	339562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_011072	TACA	2	8	339586	339593	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1133	NC_011072	ATT	2	6	339604	339609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_011072	TAA	2	6	339678	339683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_011072	T	7	7	339684	339690	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_011072	CTTT	2	8	339811	339818	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1138	NC_011072	TTA	2	6	339914	339919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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