MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae G54 chromosome

Total Repeats: 6612

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_011072	A	6	6	2027829	2027834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6502	NC_011072	TATTT	2	10	2030220	2030229	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6503	NC_011072	CTTT	2	8	2030767	2030774	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6504	NC_011072	TA	3	6	2030791	2030796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6505	NC_011072	AAT	2	6	2030800	2030805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6506	NC_011072	TAA	2	6	2030833	2030838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6507	NC_011072	A	6	6	2030837	2030842	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6508	NC_011072	CTA	2	6	2032855	2032860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6509	NC_011072	ATC	2	6	2032916	2032921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6510	NC_011072	AATGG	2	10	2032928	2032937	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
6511	NC_011072	CAA	3	9	2032963	2032971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6512	NC_011072	TCAT	2	8	2032988	2032995	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6513	NC_011072	GCTA	2	8	2033080	2033087	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6514	NC_011072	CT	4	8	2036388	2036395	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6515	NC_011072	ACCTTG	2	12	2036400	2036411	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6516	NC_011072	TAT	2	6	2036418	2036423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6517	NC_011072	CTTTT	2	10	2038242	2038251	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
6518	NC_011072	CCT	2	6	2039285	2039290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6519	NC_011072	A	7	7	2039308	2039314	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6520	NC_011072	AT	3	6	2039440	2039445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6521	NC_011072	TA	3	6	2039452	2039457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6522	NC_011072	TAA	2	6	2040841	2040846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6523	NC_011072	TTC	2	6	2040881	2040886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6524	NC_011072	ATA	2	6	2040898	2040903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6525	NC_011072	GAT	2	6	2040910	2040915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6526	NC_011072	ATT	2	6	2040929	2040934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6527	NC_011072	A	6	6	2040940	2040945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6528	NC_011072	CTT	2	6	2042600	2042605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6529	NC_011072	ATA	2	6	2045083	2045088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6530	NC_011072	ACCT	2	8	2045168	2045175	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6531	NC_011072	CTT	2	6	2045748	2045753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6532	NC_011072	TAT	2	6	2045780	2045785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6533	NC_011072	T	6	6	2045811	2045816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6534	NC_011072	CTT	2	6	2047778	2047783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6535	NC_011072	ATT	2	6	2047808	2047813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6536	NC_011072	T	6	6	2047812	2047817	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6537	NC_011072	AAT	2	6	2048474	2048479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6538	NC_011072	ACT	2	6	2048505	2048510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6539	NC_011072	AT	3	6	2048655	2048660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6540	NC_011072	A	6	6	2049695	2049700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6541	NC_011072	AGA	2	6	2049841	2049846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6542	NC_011072	GATA	2	8	2049850	2049857	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6543	NC_011072	GAT	2	6	2050279	2050284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6544	NC_011072	AAAG	2	8	2050552	2050559	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6545	NC_011072	TGA	2	6	2050589	2050594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6546	NC_011072	TCC	2	6	2051023	2051028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6547	NC_011072	ATT	2	6	2051033	2051038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6548	NC_011072	T	6	6	2051037	2051042	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6549	NC_011072	GATA	2	8	2051072	2051079	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6550	NC_011072	TTA	2	6	2051139	2051144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6551	NC_011072	T	6	6	2051150	2051155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6552	NC_011072	ATT	2	6	2051162	2051167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6553	NC_011072	A	6	6	2051188	2051193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6554	NC_011072	A	6	6	2051223	2051228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6555	NC_011072	T	6	6	2052311	2052316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6556	NC_011072	CCT	2	6	2052346	2052351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6557	NC_011072	T	7	7	2053172	2053178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6558	NC_011072	CTT	2	6	2053182	2053187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6559	NC_011072	TCA	2	6	2053231	2053236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6560	NC_011072	TAT	2	6	2053245	2053250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6561	NC_011072	CTT	2	6	2054571	2054576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6562	NC_011072	A	7	7	2054599	2054605	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6563	NC_011072	TAA	2	6	2054610	2054615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6564	NC_011072	CTT	2	6	2059844	2059849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6565	NC_011072	TAT	2	6	2059859	2059864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6566	NC_011072	CCT	2	6	2062411	2062416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6567	NC_011072	TA	3	6	2062417	2062422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6568	NC_011072	TAT	2	6	2062431	2062436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6569	NC_011072	TC	4	8	2062508	2062515	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6570	NC_011072	TCTT	2	8	2065577	2065584	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6571	NC_011072	TATC	2	8	2065610	2065617	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6572	NC_011072	TAAA	2	8	2065655	2065662	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6573	NC_011072	A	6	6	2065660	2065665	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6574	NC_011072	TTC	2	6	2065673	2065678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6575	NC_011072	T	7	7	2066775	2066781	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6576	NC_011072	AAAT	2	8	2066805	2066812	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6577	NC_011072	TAG	2	6	2066905	2066910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6578	NC_011072	AATA	2	8	2066911	2066918	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6579	NC_011072	T	7	7	2071204	2071210	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6580	NC_011072	TCT	2	6	2071213	2071218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6581	NC_011072	TTG	2	6	2071293	2071298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6582	NC_011072	GTA	2	6	2071417	2071422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6583	NC_011072	A	6	6	2071440	2071445	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6584	NC_011072	GAT	2	6	2071511	2071516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6585	NC_011072	AATA	2	8	2071520	2071527	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6586	NC_011072	TCTCA	2	10	2071529	2071538	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
6587	NC_011072	CTC	2	6	2071567	2071572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6588	NC_011072	ATTT	2	8	2071610	2071617	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6589	NC_011072	TTA	2	6	2071962	2071967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6590	NC_011072	ACTG	2	8	2072002	2072009	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6591	NC_011072	AAT	2	6	2072816	2072821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6592	NC_011072	GGTT	2	8	2072825	2072832	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6593	NC_011072	T	8	8	2072831	2072838	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6594	NC_011072	T	6	6	2072873	2072878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6595	NC_011072	ATA	2	6	2072903	2072908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6596	NC_011072	A	6	6	2072920	2072925	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6597	NC_011072	A	6	6	2072941	2072946	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6598	NC_011072	AGG	2	6	2072981	2072986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6599	NC_011072	CAT	2	6	2073601	2073606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6600	NC_011072	CTA	2	6	2073623	2073628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6601	NC_011072	CCG	2	6	2073682	2073687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6602	NC_011072	T	6	6	2076016	2076021	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6603	NC_011072	TC	3	6	2076080	2076085	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6604	NC_011072	T	7	7	2076094	2076100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6605	NC_011072	T	6	6	2076115	2076120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6606	NC_011072	A	6	6	2076124	2076129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6607	NC_011072	TAT	2	6	2076153	2076158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6608	NC_011072	CAG	2	6	2076167	2076172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6609	NC_011072	ATT	2	6	2076242	2076247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6610	NC_011072	T	6	6	2076782	2076787	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6611	NC_011072	A	6	6	2076807	2076812	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6612	NC_011072	AAAG	2	8	2078135	2078142	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.