MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Stenotrophomonas maltophilia R551-3 chromosome

Total Repeats: 10147

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_011071	GCTCG	2	10	1780235	1780244	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4002	NC_011071	CCT	2	6	1780271	1780276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4003	NC_011071	C	7	7	1780316	1780322	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4004	NC_011071	GA	3	6	1780370	1780375	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_011071	A	6	6	1780463	1780468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_011071	GGA	2	6	1780485	1780490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_011071	CTT	2	6	1780500	1780505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_011071	CTG	2	6	1780527	1780532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_011071	ACG	2	6	1783908	1783913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_011071	CAT	2	6	1783991	1783996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_011071	TGC	2	6	1784758	1784763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4012	NC_011071	GTT	2	6	1784981	1784986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_011071	TCAT	2	8	1785048	1785055	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4014	NC_011071	AGGCA	2	10	1785106	1785115	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4015	NC_011071	CAGC	2	8	1785218	1785225	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4016	NC_011071	CAA	2	6	1785409	1785414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_011071	A	6	6	1785413	1785418	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_011071	TGG	2	6	1785479	1785484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_011071	CCG	2	6	1785502	1785507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4020	NC_011071	AGC	2	6	1785567	1785572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4021	NC_011071	TGT	2	6	1785604	1785609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_011071	GCC	2	6	1785634	1785639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4023	NC_011071	GTC	2	6	1785767	1785772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_011071	TTC	2	6	1785875	1785880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_011071	GCCT	2	8	1785930	1785937	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4026	NC_011071	CG	3	6	1785976	1785981	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4027	NC_011071	GGT	2	6	1785983	1785988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_011071	GGGCGC	2	12	1786109	1786120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4029	NC_011071	AGGATC	2	12	1787196	1787207	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4030	NC_011071	GCC	3	9	1787673	1787681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4031	NC_011071	TTG	2	6	1787705	1787710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_011071	AC	3	6	1787760	1787765	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4033	NC_011071	GACA	2	8	1787788	1787795	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4034	NC_011071	GGCTC	2	10	1788438	1788447	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4035	NC_011071	GCCC	2	8	1789032	1789039	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4036	NC_011071	GAT	2	6	1790211	1790216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_011071	CGGC	2	8	1790793	1790800	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4038	NC_011071	GGC	2	6	1792069	1792074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4039	NC_011071	ATC	2	6	1792138	1792143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4040	NC_011071	GCCG	2	8	1793092	1793099	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4041	NC_011071	CGGC	2	8	1793151	1793158	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4042	NC_011071	CAG	2	6	1794881	1794886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4043	NC_011071	GAGG	2	8	1794910	1794917	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_011071	GCC	2	6	1794942	1794947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4045	NC_011071	GCA	2	6	1796050	1796055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_011071	GGGT	2	8	1796070	1796077	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_011071	CCCGA	2	10	1796659	1796668	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
4048	NC_011071	GGA	2	6	1796705	1796710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_011071	TTC	2	6	1796787	1796792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4050	NC_011071	CTGC	2	8	1798751	1798758	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4051	NC_011071	GCC	2	6	1798788	1798793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4052	NC_011071	GCC	2	6	1800085	1800090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4053	NC_011071	AGGG	2	8	1800924	1800931	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_011071	TCAACG	2	12	1802222	1802233	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4055	NC_011071	GGGT	2	8	1802262	1802269	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_011071	G	6	6	1802278	1802283	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_011071	CGC	2	6	1802313	1802318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4058	NC_011071	CCT	2	6	1802365	1802370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4059	NC_011071	CCCG	2	8	1802377	1802384	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4060	NC_011071	ACCC	2	8	1802427	1802434	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4061	NC_011071	TGG	2	6	1802480	1802485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_011071	TTCG	2	8	1802513	1802520	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4063	NC_011071	AAC	2	6	1802572	1802577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4064	NC_011071	GCG	2	6	1802684	1802689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4065	NC_011071	CCGCC	2	10	1802706	1802715	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
4066	NC_011071	TGGT	2	8	1804940	1804947	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_011071	A	6	6	1804949	1804954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_011071	T	6	6	1804964	1804969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_011071	GGGCG	2	10	1805035	1805044	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
4070	NC_011071	CCT	2	6	1805285	1805290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4071	NC_011071	CAG	2	6	1805293	1805298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4072	NC_011071	CG	3	6	1805309	1805314	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4073	NC_011071	GCCG	2	8	1805339	1805346	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4074	NC_011071	TGC	2	6	1807731	1807736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4075	NC_011071	C	6	6	1809430	1809435	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4076	NC_011071	GC	3	6	1809441	1809446	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4077	NC_011071	CGG	2	6	1809453	1809458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4078	NC_011071	GCC	2	6	1812342	1812347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4079	NC_011071	TTC	2	6	1813083	1813088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4080	NC_011071	CG	3	6	1814689	1814694	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4081	NC_011071	TCA	2	6	1814695	1814700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4082	NC_011071	CG	3	6	1814701	1814706	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4083	NC_011071	T	7	7	1814755	1814761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_011071	CTG	2	6	1814783	1814788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4085	NC_011071	AGC	2	6	1814792	1814797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4086	NC_011071	CGC	2	6	1814813	1814818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4087	NC_011071	GC	3	6	1814822	1814827	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4088	NC_011071	GC	3	6	1814854	1814859	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4089	NC_011071	GCC	2	6	1814875	1814880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4090	NC_011071	GCC	2	6	1815965	1815970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4091	NC_011071	GCC	2	6	1817288	1817293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4092	NC_011071	CG	3	6	1817700	1817705	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4093	NC_011071	GAC	2	6	1819577	1819582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4094	NC_011071	CTG	2	6	1820574	1820579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4095	NC_011071	GCA	2	6	1820583	1820588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4096	NC_011071	CA	3	6	1820587	1820592	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4097	NC_011071	T	6	6	1820614	1820619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_011071	GCAACG	4	24	1820652	1820675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4099	NC_011071	CTG	2	6	1820697	1820702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4100	NC_011071	CCAT	2	8	1820767	1820774	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4101	NC_011071	CGG	2	6	1820823	1820828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4102	NC_011071	TCTG	2	8	1820860	1820867	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4103	NC_011071	GGGT	2	8	1820968	1820975	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_011071	GCG	2	6	1821005	1821010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4105	NC_011071	ACCC	2	8	1821054	1821061	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4106	NC_011071	TGCAGG	2	12	1821123	1821134	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4107	NC_011071	AAAC	2	8	1821148	1821155	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4108	NC_011071	CG	4	8	1821215	1821222	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4109	NC_011071	GC	4	8	1821226	1821233	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4110	NC_011071	CTG	2	6	1821242	1821247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4111	NC_011071	CG	3	6	1821255	1821260	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4112	NC_011071	CTT	2	6	1822573	1822578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4113	NC_011071	CGG	2	6	1822603	1822608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4114	NC_011071	GCG	2	6	1824765	1824770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4115	NC_011071	GC	3	6	1824781	1824786	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4116	NC_011071	GC	3	6	1824794	1824799	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4117	NC_011071	CTGT	2	8	1826611	1826618	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4118	NC_011071	GTAGG	2	10	1828054	1828063	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_011071	GCGG	2	8	1828124	1828131	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4120	NC_011071	TCGT	2	8	1828182	1828189	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4121	NC_011071	T	6	6	1828314	1828319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_011071	T	6	6	1828608	1828613	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_011071	GCT	2	6	1828621	1828626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NC_011071	GGGT	2	8	1830998	1831005	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_011071	GGCGG	2	10	1831078	1831087	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
4126	NC_011071	CGC	2	6	1831104	1831109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4127	NC_011071	GCT	2	6	1831194	1831199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4128	NC_011071	TTCGAT	2	12	1831276	1831287	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4129	NC_011071	ATCC	2	8	1831292	1831299	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4130	NC_011071	CGCAT	2	10	1831301	1831310	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4131	NC_011071	GGGT	2	8	1831344	1831351	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_011071	TC	3	6	1831443	1831448	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4133	NC_011071	TTGC	2	8	1831473	1831480	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4250	NC_011071	TCCG	2	8	1880753	1880760	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4251	NC_011071	CCAA	2	8	1880804	1880811	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4252	NC_011071	TCCATG	2	12	1880846	1880857	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4254	NC_011071	ACCC	2	8	1880888	1880895	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4255	NC_011071	C	6	6	1880899	1880904	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4256	NC_011071	CCGC	2	8	1880916	1880923	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4257	NC_011071	GAAC	2	8	1884615	1884622	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4258	NC_011071	TTG	2	6	1884643	1884648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4259	NC_011071	CGAT	2	8	1889332	1889339	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4261	NC_011071	TGG	2	6	1889378	1889383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4262	NC_011071	TAG	2	6	1889416	1889421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4263	NC_011071	TGCGC	2	10	1889478	1889487	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4264	NC_011071	TAC	2	6	1889488	1889493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4265	NC_011071	TGA	2	6	1889559	1889564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4398	NC_011071	CGG	2	6	1966963	1966968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4399	NC_011071	CGGC	2	8	1966997	1967004	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4400	NC_011071	GCC	2	6	1967031	1967036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4401	NC_011071	GCCG	2	8	1974548	1974555	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4425	NC_011071	CGGG	2	8	1986055	1986062	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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4432	NC_011071	GATC	2	8	1989801	1989808	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4433	NC_011071	GGGC	2	8	1989817	1989824	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4434	NC_011071	TGC	2	6	1989855	1989860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4436	NC_011071	GGGTG	2	10	1989937	1989946	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
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4442	NC_011071	GGGT	2	8	1990302	1990309	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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4472	NC_011071	ACGG	2	8	2004892	2004899	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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