MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Stenotrophomonas maltophilia R551-3 chromosome

Total Repeats: 10147

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_011071	CTG	2	6	1273350	1273355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3002	NC_011071	GGCTC	2	10	1273429	1273438	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3003	NC_011071	GCC	2	6	1273457	1273462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3004	NC_011071	TTGAC	2	10	1273480	1273489	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3005	NC_011071	CGG	2	6	1274248	1274253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_011071	CAAG	2	8	1274341	1274348	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3007	NC_011071	GCG	2	6	1274349	1274354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_011071	CG	3	6	1275457	1275462	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3009	NC_011071	T	8	8	1275484	1275491	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_011071	GCCG	2	8	1275503	1275510	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3011	NC_011071	CGGC	2	8	1275542	1275549	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3012	NC_011071	CG	3	6	1275560	1275565	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3013	NC_011071	CAA	2	6	1275593	1275598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3014	NC_011071	A	6	6	1275597	1275602	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_011071	AGGGC	2	10	1275643	1275652	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3016	NC_011071	GGT	3	9	1275935	1275943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_011071	A	6	6	1275950	1275955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_011071	AGCT	2	8	1275976	1275983	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3019	NC_011071	ATG	2	6	1275987	1275992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_011071	TGAG	2	8	1276034	1276041	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_011071	GGC	2	6	1277668	1277673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3022	NC_011071	GCG	2	6	1277699	1277704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3023	NC_011071	GCCG	2	8	1282032	1282039	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3024	NC_011071	GT	4	8	1283050	1283057	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_011071	TGG	2	6	1283087	1283092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_011071	CAC	2	6	1283123	1283128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3027	NC_011071	GCT	2	6	1283186	1283191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3028	NC_011071	T	8	8	1285821	1285828	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_011071	TAC	2	6	1287535	1287540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_011071	G	6	6	1291868	1291873	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_011071	GGCT	2	8	1291897	1291904	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3032	NC_011071	CGA	2	6	1291932	1291937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_011071	CT	3	6	1292042	1292047	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3034	NC_011071	GA	4	8	1292066	1292073	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_011071	GT	3	6	1295011	1295016	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_011071	TGC	2	6	1295017	1295022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_011071	TCCA	2	8	1295042	1295049	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3038	NC_011071	CCG	2	6	1296078	1296083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3039	NC_011071	CCG	2	6	1296112	1296117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3040	NC_011071	GCG	2	6	1296137	1296142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3041	NC_011071	TTTG	2	8	1296225	1296232	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_011071	GCCAGC	2	12	1296261	1296272	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3043	NC_011071	TTGC	2	8	1296334	1296341	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3044	NC_011071	TCAA	2	8	1296366	1296373	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3045	NC_011071	GGTC	2	8	1296903	1296910	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3046	NC_011071	AC	3	6	1296930	1296935	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3047	NC_011071	TCC	2	6	1297926	1297931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3048	NC_011071	GCCTT	2	10	1297949	1297958	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3049	NC_011071	TGC	2	6	1298034	1298039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3050	NC_011071	CCTG	2	8	1298185	1298192	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3051	NC_011071	CAGG	2	8	1298227	1298234	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3052	NC_011071	GCC	2	6	1302331	1302336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3053	NC_011071	GGC	2	6	1302341	1302346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3054	NC_011071	TTTG	2	8	1302350	1302357	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_011071	GCCG	2	8	1302374	1302381	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3056	NC_011071	CGGC	2	8	1302411	1302418	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3057	NC_011071	GAGG	2	8	1304497	1304504	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_011071	GCA	2	6	1304567	1304572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3059	NC_011071	CGGCT	2	10	1304582	1304591	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3060	NC_011071	ATC	2	6	1304622	1304627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3061	NC_011071	CGA	2	6	1306146	1306151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3062	NC_011071	CAC	2	6	1308054	1308059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3063	NC_011071	CG	3	6	1310419	1310424	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3064	NC_011071	CA	3	6	1310492	1310497	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3065	NC_011071	GGAAT	2	10	1310499	1310508	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_011071	CGGC	2	8	1311020	1311027	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3067	NC_011071	GGGT	2	8	1311035	1311042	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_011071	GGGGA	2	10	1311916	1311925	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_011071	GC	3	6	1313376	1313381	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3070	NC_011071	GCG	2	6	1313423	1313428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3071	NC_011071	A	7	7	1315427	1315433	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_011071	GGCT	2	8	1317028	1317035	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3073	NC_011071	CGGC	2	8	1317069	1317076	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3074	NC_011071	GC	4	8	1317075	1317082	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3075	NC_011071	CAA	2	6	1317091	1317096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3076	NC_011071	GCA	2	6	1317101	1317106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3078	NC_011071	GTT	2	6	1317591	1317596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_011071	GCATC	2	10	1317636	1317645	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3080	NC_011071	GC	3	6	1318072	1318077	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3081	NC_011071	CGTGC	2	10	1318110	1318119	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3082	NC_011071	CGA	2	6	1318579	1318584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3084	NC_011071	GCCG	2	8	1319046	1319053	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3085	NC_011071	CGGC	2	8	1319105	1319112	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3086	NC_011071	CGGC	2	8	1319152	1319159	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3087	NC_011071	GTG	2	6	1320625	1320630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_011071	GCC	2	6	1322642	1322647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3089	NC_011071	ACG	2	6	1323355	1323360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3093	NC_011071	TGG	2	6	1325080	1325085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3095	NC_011071	ATTC	2	8	1325155	1325162	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3098	NC_011071	GCG	2	6	1327893	1327898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3099	NC_011071	CG	3	6	1327946	1327951	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3100	NC_011071	CTGC	2	8	1327956	1327963	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3101	NC_011071	GGC	2	6	1328033	1328038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3102	NC_011071	GAGC	2	8	1328051	1328058	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3103	NC_011071	GCA	2	6	1329016	1329021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3104	NC_011071	CGTTG	2	10	1329067	1329076	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3105	NC_011071	TGA	2	6	1329077	1329082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3107	NC_011071	TTC	2	6	1331524	1331529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3108	NC_011071	CG	3	6	1331535	1331540	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3109	NC_011071	GGA	2	6	1331593	1331598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3112	NC_011071	GC	3	6	1336853	1336858	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3113	NC_011071	GC	3	6	1338591	1338596	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3114	NC_011071	CGC	2	6	1338610	1338615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3116	NC_011071	C	6	6	1338635	1338640	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3117	NC_011071	TGC	2	6	1338686	1338691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3119	NC_011071	GCCG	2	8	1340825	1340832	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3120	NC_011071	ATG	2	6	1340863	1340868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_011071	TTGG	2	8	1340924	1340931	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_011071	CGGC	2	8	1340945	1340952	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3123	NC_011071	CAG	2	6	1340973	1340978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3124	NC_011071	GAAA	2	8	1345175	1345182	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_011071	AGGC	2	8	1345215	1345222	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3126	NC_011071	TTCCT	2	10	1345234	1345243	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
3127	NC_011071	TGCG	2	8	1345317	1345324	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3128	NC_011071	GGC	2	6	1348141	1348146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3129	NC_011071	GGC	2	6	1348152	1348157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3130	NC_011071	GGCC	2	8	1350303	1350310	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3131	NC_011071	GAT	2	6	1350312	1350317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_011071	GC	3	6	1350370	1350375	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3133	NC_011071	GCC	2	6	1350390	1350395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3251	NC_011071	CCGA	2	8	1418080	1418087	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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3257	NC_011071	GCC	2	6	1418893	1418898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3258	NC_011071	GAGC	2	8	1418900	1418907	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3259	NC_011071	CGGC	2	8	1419488	1419495	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3260	NC_011071	CGT	2	6	1420473	1420478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3261	NC_011071	AGA	2	6	1420483	1420488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3262	NC_011071	CGGG	2	8	1420557	1420564	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3263	NC_011071	G	6	6	1420562	1420567	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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3399	NC_011071	CGGT	2	8	1497111	1497118	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3400	NC_011071	GGCTC	2	10	1497236	1497245	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3401	NC_011071	AAGG	2	8	1497376	1497383	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3402	NC_011071	CGAC	2	8	1497456	1497463	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3403	NC_011071	AAG	2	6	1497474	1497479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3404	NC_011071	CGG	2	6	1497517	1497522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3425	NC_011071	CG	3	6	1503313	1503318	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3426	NC_011071	CG	3	6	1503374	1503379	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3427	NC_011071	CG	3	6	1505144	1505149	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3429	NC_011071	CACC	2	8	1505286	1505293	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3430	NC_011071	CAG	2	6	1505296	1505301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3431	NC_011071	GGGT	2	8	1505321	1505328	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3432	NC_011071	CGGG	2	8	1505371	1505378	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3433	NC_011071	GCG	2	6	1505465	1505470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3434	NC_011071	TTGACG	3	18	1505517	1505534	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3435	NC_011071	TGCAGG	2	12	1505542	1505553	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3436	NC_011071	CTG	2	6	1505562	1505567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3437	NC_011071	TCG	2	6	1506179	1506184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3438	NC_011071	GC	4	8	1506200	1506207	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3439	NC_011071	GC	3	6	1506750	1506755	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3440	NC_011071	CCGC	2	8	1506756	1506763	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3441	NC_011071	CGC	2	6	1506784	1506789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3443	NC_011071	CTT	2	6	1506827	1506832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3447	NC_011071	CCAT	2	8	1511508	1511515	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3450	NC_011071	CGGCA	2	10	1515340	1515349	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3451	NC_011071	GCCG	2	8	1515365	1515372	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3452	NC_011071	CGGC	2	8	1515423	1515430	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3453	NC_011071	CGATG	2	10	1517756	1517765	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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3495	NC_011071	GGC	2	6	1534323	1534328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3497	NC_011071	GCG	2	6	1537309	1537314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3498	NC_011071	GCCG	2	8	1538726	1538733	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3499	NC_011071	CGGC	2	8	1538763	1538770	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3500	NC_011071	CCGGT	2	10	1538816	1538825	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding

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