MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Stenotrophomonas maltophilia R551-3 chromosome

Total Repeats: 10147

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_011071	ACC	2	6	4511234	4511239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10002	NC_011071	TGG	2	6	4511284	4511289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10003	NC_011071	CGA	2	6	4511308	4511313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10004	NC_011071	AGG	2	6	4511454	4511459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10005	NC_011071	CAA	2	6	4511568	4511573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10006	NC_011071	GT	3	6	4511595	4511600	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10007	NC_011071	GCA	2	6	4511625	4511630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10008	NC_011071	GTA	2	6	4511758	4511763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10009	NC_011071	GT	3	6	4511765	4511770	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10010	NC_011071	ATG	2	6	4511790	4511795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10011	NC_011071	TCC	2	6	4511816	4511821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10012	NC_011071	CGG	2	6	4511832	4511837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10013	NC_011071	CCA	2	6	4511852	4511857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10014	NC_011071	CACGA	2	10	4511917	4511926	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
10015	NC_011071	GAC	2	6	4511930	4511935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10016	NC_011071	GCA	2	6	4511942	4511947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10017	NC_011071	TTC	2	6	4512018	4512023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10018	NC_011071	GGC	2	6	4512113	4512118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10019	NC_011071	TCAGTG	2	12	4512238	4512249	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10020	NC_011071	TCC	2	6	4512282	4512287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10021	NC_011071	GTC	2	6	4512346	4512351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10022	NC_011071	ACC	2	6	4512408	4512413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10023	NC_011071	ACGC	2	8	4512415	4512422	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10024	NC_011071	GCT	2	6	4512472	4512477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10025	NC_011071	TTTC	2	8	4512544	4512551	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10026	NC_011071	CAA	2	6	4512553	4512558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10027	NC_011071	CTT	2	6	4512581	4512586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10028	NC_011071	CTG	2	6	4512640	4512645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10029	NC_011071	ATC	2	6	4512690	4512695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10030	NC_011071	TCG	2	6	4512715	4512720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10031	NC_011071	TGG	2	6	4512724	4512729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10032	NC_011071	TGC	2	6	4512925	4512930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10033	NC_011071	ATGA	2	8	4513037	4513044	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10034	NC_011071	GCTT	2	8	4513060	4513067	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10035	NC_011071	ATC	2	6	4513113	4513118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10036	NC_011071	TGC	2	6	4513197	4513202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10037	NC_011071	CTTC	2	8	4513207	4513214	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10038	NC_011071	GCC	2	6	4513222	4513227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10039	NC_011071	T	6	6	4513261	4513266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10040	NC_011071	GTT	2	6	4513291	4513296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10041	NC_011071	TGC	2	6	4513302	4513307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10042	NC_011071	TCG	2	6	4513309	4513314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10043	NC_011071	TCG	2	6	4513332	4513337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10044	NC_011071	GCC	2	6	4513344	4513349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10045	NC_011071	TAT	2	6	4513350	4513355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10046	NC_011071	TTCG	2	8	4513383	4513390	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10047	NC_011071	ATC	2	6	4513391	4513396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10048	NC_011071	TCGT	2	8	4513397	4513404	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10049	NC_011071	GGT	2	6	4513406	4513411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10050	NC_011071	GAA	2	6	4513438	4513443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10051	NC_011071	TGC	2	6	4513450	4513455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10052	NC_011071	T	7	7	4513500	4513506	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10053	NC_011071	TGA	2	6	4513513	4513518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10054	NC_011071	CG	3	6	4513575	4513580	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10055	NC_011071	TCCT	2	8	4515615	4515622	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10056	NC_011071	CAT	2	6	4515628	4515633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10057	NC_011071	CTG	2	6	4515644	4515649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10058	NC_011071	CCA	2	6	4515650	4515655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10059	NC_011071	GAT	2	6	4516551	4516556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10060	NC_011071	TCC	2	6	4517837	4517842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10061	NC_011071	CGG	2	6	4517901	4517906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10062	NC_011071	GCA	2	6	4520164	4520169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10063	NC_011071	AAG	2	6	4520242	4520247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10064	NC_011071	CGC	2	6	4520258	4520263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10065	NC_011071	TGC	2	6	4520273	4520278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10066	NC_011071	CGT	2	6	4520284	4520289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10067	NC_011071	CG	3	6	4522022	4522027	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10068	NC_011071	C	6	6	4522068	4522073	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10069	NC_011071	TTGA	2	8	4522077	4522084	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10070	NC_011071	CGGC	2	8	4522887	4522894	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10071	NC_011071	GCCG	2	8	4522928	4522935	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10072	NC_011071	GCC	2	6	4528556	4528561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10073	NC_011071	GCC	2	6	4528569	4528574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10074	NC_011071	G	6	6	4529264	4529269	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10075	NC_011071	G	6	6	4529288	4529293	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10076	NC_011071	GTC	2	6	4529297	4529302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10077	NC_011071	G	6	6	4529321	4529326	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10078	NC_011071	TGCT	2	8	4529340	4529347	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10079	NC_011071	CCAT	2	8	4529417	4529424	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10080	NC_011071	CCCT	2	8	4529456	4529463	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
10081	NC_011071	CGA	2	6	4529482	4529487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10082	NC_011071	GC	3	6	4529539	4529544	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10083	NC_011071	CGCC	2	8	4529622	4529629	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10084	NC_011071	CGGG	2	8	4529654	4529661	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10085	NC_011071	GCG	2	6	4529714	4529719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10086	NC_011071	CAGG	2	8	4529759	4529766	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10087	NC_011071	AC	3	6	4529783	4529788	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10088	NC_011071	TAG	2	6	4529826	4529831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10089	NC_011071	CTAT	2	8	4529836	4529843	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10090	NC_011071	CCG	2	6	4530323	4530328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10091	NC_011071	TGC	2	6	4530361	4530366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10092	NC_011071	GTT	2	6	4530373	4530378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10093	NC_011071	CCTCC	2	10	4530379	4530388	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
10094	NC_011071	CGCCCC	2	12	4530396	4530407	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
10095	NC_011071	CCG	2	6	4535043	4535048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10096	NC_011071	CCCGTT	2	12	4535542	4535553	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
10097	NC_011071	GCA	2	6	4544487	4544492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10098	NC_011071	CAA	2	6	4544586	4544591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10099	NC_011071	CAG	2	6	4544619	4544624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10100	NC_011071	A	6	6	4544648	4544653	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10101	NC_011071	CGG	2	6	4546215	4546220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10102	NC_011071	GC	3	6	4546230	4546235	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10103	NC_011071	CCA	2	6	4546238	4546243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10104	NC_011071	CGG	2	6	4548793	4548798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10105	NC_011071	CCGACC	2	12	4548854	4548865	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
10106	NC_011071	CCA	2	6	4549443	4549448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10107	NC_011071	CG	3	6	4549458	4549463	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10108	NC_011071	GCCG	2	8	4549475	4549482	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10109	NC_011071	CGGC	2	8	4549535	4549542	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10110	NC_011071	GCC	2	6	4549974	4549979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10111	NC_011071	CGA	2	6	4549991	4549996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10112	NC_011071	GGC	2	6	4550001	4550006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10113	NC_011071	CTG	2	6	4551606	4551611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10114	NC_011071	AAC	2	6	4552256	4552261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10115	NC_011071	AGG	2	6	4553294	4553299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10116	NC_011071	TCAG	2	8	4553342	4553349	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10117	NC_011071	CGC	2	6	4554346	4554351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10118	NC_011071	GCA	2	6	4556148	4556153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10119	NC_011071	TGC	2	6	4556216	4556221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10120	NC_011071	GCCG	2	8	4557724	4557731	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10121	NC_011071	CGGC	2	8	4557777	4557784	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10122	NC_011071	GAC	2	6	4559106	4559111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10123	NC_011071	GC	3	6	4559113	4559118	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10124	NC_011071	GGAAC	2	10	4559182	4559191	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
10125	NC_011071	CCGG	2	8	4560888	4560895	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10126	NC_011071	AC	3	6	4560905	4560910	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10127	NC_011071	CGGC	2	8	4562144	4562151	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10128	NC_011071	CCAA	2	8	4562155	4562162	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10129	NC_011071	GCGA	2	8	4562325	4562332	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10130	NC_011071	TCC	2	6	4562380	4562385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10131	NC_011071	CATT	2	8	4562413	4562420	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10132	NC_011071	CGGC	3	12	4563406	4563417	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10133	NC_011071	GCCG	2	8	4563429	4563436	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10134	NC_011071	CGC	2	6	4563450	4563455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10135	NC_011071	TGG	2	6	4564270	4564275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10136	NC_011071	CCG	2	6	4564278	4564283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10137	NC_011071	TC	3	6	4564312	4564317	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10138	NC_011071	GCG	2	6	4565508	4565513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10139	NC_011071	GGC	2	6	4565544	4565549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10140	NC_011071	CATC	2	8	4565576	4565583	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10141	NC_011071	TTC	2	6	4565587	4565592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10142	NC_011071	ATC	2	6	4565617	4565622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10143	NC_011071	GGA	2	6	4565658	4565663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10144	NC_011071	AGG	2	6	4567309	4567314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10145	NC_011071	GATG	2	8	4571434	4571441	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10146	NC_011071	GCG	2	6	4571492	4571497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10147	NC_011071	GGTC	2	8	4571508	4571515	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding

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