MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Stenotrophomonas maltophilia R551-3 chromosome

Total Repeats: 10147

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_011071	ACG	2	6	2782582	2782587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6002	NC_011071	TGT	2	6	2782636	2782641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_011071	CAGC	2	8	2782734	2782741	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6004	NC_011071	ATC	2	6	2782810	2782815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6005	NC_011071	A	6	6	2782841	2782846	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_011071	GA	3	6	2782884	2782889	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_011071	TGCT	2	8	2783006	2783013	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6008	NC_011071	ATGG	2	8	2783024	2783031	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_011071	CTC	2	6	2784930	2784935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6010	NC_011071	CAT	2	6	2784938	2784943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6011	NC_011071	AAC	2	6	2784996	2785001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6012	NC_011071	ATC	2	6	2785002	2785007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6013	NC_011071	CGT	2	6	2785028	2785033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6014	NC_011071	AAG	2	6	2785041	2785046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_011071	ACC	2	6	2785074	2785079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6016	NC_011071	CGCA	2	8	2785210	2785217	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6017	NC_011071	AAC	2	6	2786337	2786342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6018	NC_011071	CAGC	2	8	2786362	2786369	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6019	NC_011071	CAT	2	6	2786483	2786488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6020	NC_011071	GC	3	6	2786505	2786510	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6021	NC_011071	CCT	2	6	2786511	2786516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6022	NC_011071	CGC	2	6	2786549	2786554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6023	NC_011071	GCT	2	6	2786642	2786647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6024	NC_011071	CCG	2	6	2786662	2786667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6025	NC_011071	GCC	2	6	2786675	2786680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6026	NC_011071	TC	3	6	2787316	2787321	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6027	NC_011071	GCG	2	6	2787349	2787354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6028	NC_011071	GCA	2	6	2787410	2787415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6029	NC_011071	GA	3	6	2787430	2787435	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_011071	CTG	3	9	2787492	2787500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6031	NC_011071	TCGTG	2	10	2787613	2787622	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6032	NC_011071	GCA	2	6	2787732	2787737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6033	NC_011071	GCCCGA	2	12	2787767	2787778	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6034	NC_011071	CA	3	6	2787816	2787821	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6035	NC_011071	GCA	2	6	2787862	2787867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6036	NC_011071	ACT	2	6	2787943	2787948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6037	NC_011071	CG	3	6	2788082	2788087	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6038	NC_011071	GCCA	2	8	2788750	2788757	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6039	NC_011071	CAATT	2	10	2788787	2788796	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6040	NC_011071	CGGCG	2	10	2788801	2788810	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6041	NC_011071	CTGC	2	8	2788835	2788842	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6042	NC_011071	ACC	2	6	2788900	2788905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6043	NC_011071	CGC	2	6	2788930	2788935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6044	NC_011071	TCG	2	6	2788967	2788972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6045	NC_011071	GCT	2	6	2788988	2788993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6046	NC_011071	TCA	2	6	2789199	2789204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6047	NC_011071	GAAG	2	8	2789210	2789217	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_011071	TTC	2	6	2790101	2790106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6049	NC_011071	CGC	2	6	2790116	2790121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6050	NC_011071	CATTCT	2	12	2790127	2790138	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6051	NC_011071	CTG	2	6	2790147	2790152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6052	NC_011071	GCA	2	6	2790164	2790169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6053	NC_011071	CTT	2	6	2790196	2790201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6054	NC_011071	TCA	2	6	2790255	2790260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6055	NC_011071	CG	3	6	2790267	2790272	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6056	NC_011071	ACG	2	6	2790314	2790319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6057	NC_011071	GCAAC	2	10	2790330	2790339	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6058	NC_011071	TCGAA	2	10	2790366	2790375	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6059	NC_011071	CGC	2	6	2790396	2790401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6060	NC_011071	TGA	2	6	2790427	2790432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_011071	GGC	8	24	2790434	2790457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6062	NC_011071	GGC	2	6	2790464	2790469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6063	NC_011071	GGT	2	6	2790473	2790478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_011071	TGG	2	6	2790493	2790498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_011071	GGA	2	6	2790512	2790517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_011071	GTT	2	6	2790576	2790581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_011071	CG	3	6	2790732	2790737	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6068	NC_011071	TC	3	6	2799712	2799717	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6069	NC_011071	A	9	9	2799718	2799726	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_011071	CG	3	6	2799730	2799735	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6071	NC_011071	GGGC	2	8	2799736	2799743	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6072	NC_011071	CAA	2	6	2799870	2799875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6073	NC_011071	AGT	2	6	2799903	2799908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6077	NC_011071	CAT	2	6	2800017	2800022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6081	NC_011071	GGA	2	6	2803584	2803589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_011071	CG	3	6	2803592	2803597	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6083	NC_011071	CCG	2	6	2803616	2803621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6084	NC_011071	TG	3	6	2804195	2804200	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6087	NC_011071	GCC	2	6	2806383	2806388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6088	NC_011071	CGG	2	6	2806389	2806394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6089	NC_011071	GTC	2	6	2811989	2811994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6091	NC_011071	C	7	7	2812064	2812070	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6092	NC_011071	TTCA	2	8	2812078	2812085	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6093	NC_011071	TTCG	2	8	2812747	2812754	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6094	NC_011071	CAC	2	6	2812830	2812835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6095	NC_011071	CCA	2	6	2812857	2812862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6096	NC_011071	CAA	2	6	2813297	2813302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6097	NC_011071	CCTT	2	8	2813341	2813348	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6098	NC_011071	TTGG	2	8	2813971	2813978	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_011071	CG	3	6	2814024	2814029	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6100	NC_011071	CCTGA	2	10	2814047	2814056	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6101	NC_011071	CT	3	6	2814103	2814108	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6102	NC_011071	ACGC	2	8	2814119	2814126	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6103	NC_011071	TGG	2	6	2814379	2814384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6105	NC_011071	GGC	2	6	2814545	2814550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6107	NC_011071	TTG	2	6	2816183	2816188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_011071	GC	3	6	2816202	2816207	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6109	NC_011071	TGC	2	6	2816830	2816835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6110	NC_011071	GCG	2	6	2816885	2816890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6112	NC_011071	GGCA	2	8	2816947	2816954	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6113	NC_011071	CGG	2	6	2817765	2817770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6114	NC_011071	CGG	2	6	2817807	2817812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6116	NC_011071	CAGC	2	8	2817844	2817851	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6117	NC_011071	GCGG	2	8	2817864	2817871	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6118	NC_011071	CGCGG	2	10	2817877	2817886	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6119	NC_011071	GCT	2	6	2817906	2817911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6120	NC_011071	CGA	2	6	2818102	2818107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6121	NC_011071	T	6	6	2818108	2818113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_011071	GAC	2	6	2818183	2818188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6123	NC_011071	TCA	2	6	2818232	2818237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6124	NC_011071	TCG	2	6	2818304	2818309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6125	NC_011071	CGG	2	6	2818319	2818324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6126	NC_011071	CAG	2	6	2818345	2818350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6127	NC_011071	CGAT	2	8	2818431	2818438	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6128	NC_011071	CAT	3	9	2818455	2818463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6129	NC_011071	AGC	3	9	2818490	2818498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6130	NC_011071	CAC	2	6	2818503	2818508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6131	NC_011071	ACT	2	6	2818585	2818590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6133	NC_011071	GCT	2	6	2818615	2818620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6134	NC_011071	CCG	2	6	2818657	2818662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6135	NC_011071	GTA	2	6	2818745	2818750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6139	NC_011071	CGGG	2	8	2819872	2819879	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6140	NC_011071	CAA	2	6	2819913	2819918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6143	NC_011071	CTCCG	2	10	2820478	2820487	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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6164	NC_011071	CGC	2	6	2824676	2824681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6171	NC_011071	GCG	2	6	2825449	2825454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6219	NC_011071	GGCTC	2	10	2847346	2847355	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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6240	NC_011071	GCCCT	2	10	2858531	2858540	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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6243	NC_011071	GCA	2	6	2859571	2859576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6244	NC_011071	GCGTG	2	10	2861008	2861017	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
6245	NC_011071	CGT	2	6	2861035	2861040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6246	NC_011071	CAG	2	6	2861093	2861098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6249	NC_011071	GGC	2	6	2861144	2861149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6250	NC_011071	ATC	2	6	2864164	2864169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6252	NC_011071	GGCG	2	8	2864226	2864233	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6253	NC_011071	GGC	2	6	2864306	2864311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6254	NC_011071	TTGCA	2	10	2864361	2864370	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6255	NC_011071	GTT	2	6	2864398	2864403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6256	NC_011071	CCT	2	6	2864413	2864418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6257	NC_011071	CG	4	8	2864468	2864475	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6258	NC_011071	GAA	2	6	2864488	2864493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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