MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Stenotrophomonas maltophilia K279a chromosome

Total Repeats: 11691

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_010943	CCT	2	6	1363969	1363974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3502	NC_010943	CAC	2	6	1363976	1363981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3503	NC_010943	GCA	2	6	1364084	1364089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3504	NC_010943	GTT	2	6	1364131	1364136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_010943	TGA	2	6	1364202	1364207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_010943	CCCAC	2	10	1366263	1366272	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
3507	NC_010943	ATG	2	6	1367636	1367641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_010943	CG	3	6	1367644	1367649	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3509	NC_010943	CTG	2	6	1367666	1367671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3510	NC_010943	A	8	8	1367725	1367732	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_010943	GGCCGG	2	12	1367736	1367747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_010943	CTG	2	6	1367756	1367761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3513	NC_010943	AGGGC	2	10	1367773	1367782	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3514	NC_010943	GGT	3	9	1368065	1368073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_010943	A	6	6	1368080	1368085	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_010943	AGCT	2	8	1368106	1368113	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3517	NC_010943	ATG	2	6	1368117	1368122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_010943	GGC	2	6	1369798	1369803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3519	NC_010943	GCG	2	6	1369829	1369834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3520	NC_010943	GCCG	2	8	1374162	1374169	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3521	NC_010943	TGG	2	6	1375188	1375193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_010943	GGTG	2	8	1375210	1375217	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_010943	GGTG	2	8	1375231	1375238	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_010943	CGCA	2	8	1375263	1375270	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3525	NC_010943	GCCC	2	8	1375281	1375288	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3526	NC_010943	GGGCA	2	10	1375305	1375314	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3527	NC_010943	T	6	6	1377977	1377982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_010943	TAC	2	6	1379699	1379704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_010943	CATT	2	8	1384144	1384151	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3530	NC_010943	T	6	6	1384150	1384155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_010943	GA	5	10	1384224	1384233	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_010943	GGCAT	2	10	1387179	1387188	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3533	NC_010943	TCCA	2	8	1387189	1387196	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3534	NC_010943	TTC	2	6	1387199	1387204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3535	NC_010943	CCG	2	6	1388225	1388230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3536	NC_010943	CCG	2	6	1388259	1388264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3537	NC_010943	GCG	2	6	1388284	1388289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3538	NC_010943	T	7	7	1388368	1388374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_010943	GCCG	2	8	1388388	1388395	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3540	NC_010943	TGGC	2	8	1388426	1388433	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3541	NC_010943	CTC	2	6	1388492	1388497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3542	NC_010943	GGAA	2	8	1388518	1388525	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_010943	AAC	2	6	1388691	1388696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3544	NC_010943	GAG	2	6	1388740	1388745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_010943	TCG	2	6	1388799	1388804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3546	NC_010943	ATCAGG	2	12	1388817	1388828	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3547	NC_010943	GAA	2	6	1388839	1388844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_010943	AGTG	2	8	1388881	1388888	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_010943	TCG	2	6	1388921	1388926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3550	NC_010943	TG	3	6	1388946	1388951	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_010943	CTT	2	6	1389439	1389444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_010943	TCA	2	6	1389481	1389486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3553	NC_010943	TCA	2	6	1389585	1389590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3554	NC_010943	TCT	2	6	1389633	1389638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3555	NC_010943	GCA	2	6	1389652	1389657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3556	NC_010943	CAGGGA	2	12	1389671	1389682	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3557	NC_010943	TTA	2	6	1389725	1389730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_010943	TGC	2	6	1389735	1389740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3559	NC_010943	ATGC	2	8	1389746	1389753	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3560	NC_010943	TCAA	2	8	1389777	1389784	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3561	NC_010943	CGG	2	6	1390260	1390265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3562	NC_010943	GC	3	6	1390306	1390311	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3563	NC_010943	G	7	7	1390366	1390372	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_010943	TCCT	2	8	1390387	1390394	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3565	NC_010943	TGC	2	6	1391997	1392002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3566	NC_010943	TCT	2	6	1392702	1392707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3567	NC_010943	TCC	2	6	1393358	1393363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3568	NC_010943	GCC	2	6	1393467	1393472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3569	NC_010943	CG	3	6	1393497	1393502	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3570	NC_010943	TCAATG	2	12	1393549	1393560	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3571	NC_010943	TGG	2	6	1393572	1393577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_010943	CAGG	2	8	1393659	1393666	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3573	NC_010943	CG	3	6	1397724	1397729	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3574	NC_010943	GCC	2	6	1397748	1397753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3575	NC_010943	T	6	6	1397765	1397770	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_010943	CGCC	2	8	1397779	1397786	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3577	NC_010943	CG	3	6	1397797	1397802	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3578	NC_010943	GCCG	2	8	1397811	1397818	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3579	NC_010943	CGGC	2	8	1397848	1397855	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3580	NC_010943	GCA	2	6	1397903	1397908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3581	NC_010943	GGT	2	6	1397963	1397968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_010943	GCCG	2	8	1397972	1397979	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3583	NC_010943	CGGC	2	8	1398009	1398016	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3584	NC_010943	G	7	7	1398122	1398128	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_010943	GCCG	2	8	1398132	1398139	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3586	NC_010943	CGGC	2	8	1398169	1398176	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3587	NC_010943	GCA	2	6	1398226	1398231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3588	NC_010943	GGT	2	6	1398286	1398291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_010943	GCCG	2	8	1398295	1398302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3590	NC_010943	GGC	2	6	1398323	1398328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3591	NC_010943	CGGC	2	8	1398332	1398339	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3592	NC_010943	GAGG	2	8	1400450	1400457	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_010943	GCA	2	6	1400521	1400526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3594	NC_010943	CGGCT	2	10	1400536	1400545	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3595	NC_010943	ATC	2	6	1400576	1400581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3596	NC_010943	CGT	2	6	1401985	1401990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3597	NC_010943	GCCT	2	8	1402006	1402013	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3598	NC_010943	CGA	2	6	1402032	1402037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3599	NC_010943	GCCG	2	8	1406311	1406318	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3600	NC_010943	CGG	2	6	1406852	1406857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3601	NC_010943	CGGC	2	8	1406895	1406902	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3602	NC_010943	TGGG	2	8	1406918	1406925	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_010943	GGT	2	6	1407769	1407774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_010943	GC	3	6	1409260	1409265	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3605	NC_010943	C	6	6	1411232	1411237	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3606	NC_010943	GC	4	8	1412956	1412963	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3607	NC_010943	CAA	2	6	1412972	1412977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3608	NC_010943	GCA	2	6	1412982	1412987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3609	NC_010943	AAC	2	6	1413462	1413467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3610	NC_010943	GTT	2	6	1413472	1413477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_010943	GCATC	2	10	1413517	1413526	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3612	NC_010943	CAT	2	6	1413977	1413982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3613	NC_010943	CGTGC	2	10	1413992	1414001	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3614	NC_010943	CGA	2	6	1414461	1414466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3615	NC_010943	GCCG	2	8	1414888	1414895	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3616	NC_010943	TGC	2	6	1414915	1414920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3617	NC_010943	CGGC	2	8	1414947	1414954	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3618	NC_010943	CGGC	2	8	1414995	1415002	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3619	NC_010943	GTG	2	6	1416468	1416473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_010943	GCTGGC	2	12	1416556	1416567	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3621	NC_010943	ACCG	2	8	1416635	1416642	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3622	NC_010943	CAGC	2	8	1416661	1416668	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3623	NC_010943	CCG	2	6	1416681	1416686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3624	NC_010943	AGT	2	6	1416762	1416767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_010943	TGGGG	2	10	1417830	1417839	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_010943	ACG	2	6	1417852	1417857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3627	NC_010943	CGC	2	6	1417877	1417882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3628	NC_010943	GGC	2	6	1417893	1417898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3629	NC_010943	ATC	2	6	1419446	1419451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3630	NC_010943	GTG	2	6	1419471	1419476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3632	NC_010943	TGT	2	6	1419544	1419549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3763	NC_010943	CAG	2	6	1443431	1443436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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