MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Stenotrophomonas maltophilia K279a chromosome

Total Repeats: 11691

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_010943	G	6	6	1151852	1151857	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_010943	CGC	2	6	1151881	1151886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3003	NC_010943	GCC	2	6	1153376	1153381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3004	NC_010943	G	6	6	1153496	1153501	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_010943	AGC	2	6	1155966	1155971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_010943	GA	5	10	1156030	1156039	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_010943	CAG	3	9	1156125	1156133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_010943	ATGG	2	8	1156182	1156189	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_010943	TTGC	2	8	1156220	1156227	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3010	NC_010943	GCC	2	6	1156260	1156265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3011	NC_010943	CCGCC	2	10	1156320	1156329	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
3012	NC_010943	CTG	2	6	1156349	1156354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3013	NC_010943	TTGCTG	3	18	1156355	1156372	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3014	NC_010943	CGGC	2	8	1156384	1156391	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3015	NC_010943	CGG	2	6	1156397	1156402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3016	NC_010943	GCC	2	6	1156420	1156425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3017	NC_010943	C	7	7	1156424	1156430	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3018	NC_010943	CCG	2	6	1159120	1159125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3019	NC_010943	GCG	3	9	1159129	1159137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3020	NC_010943	AGGA	2	8	1160574	1160581	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_010943	CGGG	2	8	1161901	1161908	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3022	NC_010943	GGC	2	6	1161965	1161970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3023	NC_010943	GGC	2	6	1163099	1163104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3024	NC_010943	GCG	2	6	1163124	1163129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3025	NC_010943	TTA	2	6	1164202	1164207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_010943	AGA	2	6	1164454	1164459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_010943	TTTTC	2	10	1166080	1166089	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3028	NC_010943	GGA	2	6	1167652	1167657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_010943	GCG	2	6	1169060	1169065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_010943	GCC	2	6	1169069	1169074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3031	NC_010943	GGC	2	6	1169151	1169156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_010943	CCAG	2	8	1169176	1169183	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3033	NC_010943	CGC	2	6	1169196	1169201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3034	NC_010943	GC	3	6	1169200	1169205	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3035	NC_010943	GC	3	6	1169241	1169246	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3036	NC_010943	CGG	2	6	1169273	1169278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_010943	TCC	2	6	1169323	1169328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3038	NC_010943	CG	3	6	1169333	1169338	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3039	NC_010943	CAGCTG	2	12	1169442	1169453	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3040	NC_010943	GCGGCA	2	12	1169468	1169479	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3041	NC_010943	GCG	3	9	1169480	1169488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3042	NC_010943	GTTT	2	8	1174194	1174201	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_010943	CAACGT	2	12	1174230	1174241	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3044	NC_010943	CGC	2	6	1174321	1174326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3045	NC_010943	ACTGC	2	10	1174402	1174411	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3046	NC_010943	CTG	2	6	1174415	1174420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3047	NC_010943	CTG	2	6	1174429	1174434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_010943	TTG	2	6	1174435	1174440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_010943	GTC	2	6	1174454	1174459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3050	NC_010943	AGCGA	2	10	1174474	1174483	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3051	NC_010943	GCTTTT	2	12	1174487	1174498	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3052	NC_010943	T	6	6	1174500	1174505	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_010943	CGGG	2	8	1174545	1174552	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3054	NC_010943	GC	3	6	1176432	1176437	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3055	NC_010943	GC	3	6	1176441	1176446	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3056	NC_010943	GGAAG	2	10	1176461	1176470	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_010943	GC	3	6	1176752	1176757	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3058	NC_010943	CGTC	2	8	1176800	1176807	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3059	NC_010943	CAG	2	6	1178840	1178845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3060	NC_010943	TCG	2	6	1178849	1178854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3061	NC_010943	ACC	2	6	1178901	1178906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3062	NC_010943	CCG	2	6	1178909	1178914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3063	NC_010943	TGG	2	6	1178940	1178945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_010943	GCA	2	6	1179044	1179049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3065	NC_010943	CCA	2	6	1179136	1179141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3066	NC_010943	CCGCA	2	10	1179163	1179172	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3067	NC_010943	ACG	2	6	1181024	1181029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3068	NC_010943	GC	3	6	1181030	1181035	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3069	NC_010943	ATG	2	6	1181039	1181044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_010943	GGC	2	6	1185884	1185889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3071	NC_010943	CACGG	2	10	1186544	1186553	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3072	NC_010943	CAT	2	6	1186581	1186586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3073	NC_010943	TGA	2	6	1186587	1186592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_010943	CGGC	2	8	1186656	1186663	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3075	NC_010943	CACC	2	8	1186721	1186728	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3076	NC_010943	AGGGC	2	10	1186729	1186738	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3077	NC_010943	GCG	2	6	1186770	1186775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3078	NC_010943	GTG	2	6	1189222	1189227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_010943	GGC	2	6	1189276	1189281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3080	NC_010943	GCAG	2	8	1189291	1189298	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3081	NC_010943	GC	3	6	1189301	1189306	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3082	NC_010943	CGGC	2	8	1189817	1189824	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3083	NC_010943	CGG	2	6	1191345	1191350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3085	NC_010943	GTG	2	6	1191368	1191373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_010943	GCC	2	6	1194446	1194451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3087	NC_010943	GGGC	2	8	1195343	1195350	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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3091	NC_010943	TGC	2	6	1201951	1201956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3092	NC_010943	GCCG	2	8	1202516	1202523	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3093	NC_010943	CGGC	2	8	1202558	1202565	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3094	NC_010943	ACC	2	6	1202566	1202571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3095	NC_010943	CCG	2	6	1202607	1202612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3096	NC_010943	TTC	2	6	1202624	1202629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3097	NC_010943	GCCG	2	8	1203221	1203228	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3098	NC_010943	CAC	2	6	1203237	1203242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3099	NC_010943	GGA	2	6	1203869	1203874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_010943	GGC	2	6	1203887	1203892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3101	NC_010943	CG	3	6	1203898	1203903	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3102	NC_010943	CCT	2	6	1204455	1204460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3103	NC_010943	CTG	2	6	1204491	1204496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3104	NC_010943	GGA	2	6	1204837	1204842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_010943	CGG	2	6	1204870	1204875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3106	NC_010943	GCG	2	6	1205009	1205014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3107	NC_010943	CGTGG	2	10	1205023	1205032	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3108	NC_010943	CTG	2	6	1205035	1205040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3109	NC_010943	GAC	2	6	1205065	1205070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3110	NC_010943	CCGTC	2	10	1205076	1205085	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3111	NC_010943	GC	4	8	1205101	1205108	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3112	NC_010943	GGTT	2	8	1205527	1205534	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_010943	GCC	2	6	1205589	1205594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3114	NC_010943	T	6	6	1205622	1205627	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_010943	GC	3	6	1205653	1205658	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3116	NC_010943	GC	4	8	1205681	1205688	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3117	NC_010943	CGCC	2	8	1205698	1205705	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3118	NC_010943	GCG	2	6	1205800	1205805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3119	NC_010943	GCG	2	6	1205807	1205812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3120	NC_010943	TCA	2	6	1205854	1205859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3121	NC_010943	AGC	2	6	1205872	1205877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3122	NC_010943	GCCG	2	8	1206319	1206326	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3123	NC_010943	GGC	2	6	1206380	1206385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3124	NC_010943	GCC	2	6	1206393	1206398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3125	NC_010943	TAGCG	2	10	1207377	1207386	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3126	NC_010943	T	7	7	1207467	1207473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_010943	GGC	2	6	1208396	1208401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3128	NC_010943	CGC	2	6	1211024	1211029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3129	NC_010943	GC	4	8	1211028	1211035	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3130	NC_010943	CGC	2	6	1211056	1211061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3131	NC_010943	GC	3	6	1211060	1211065	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3132	NC_010943	CG	3	6	1211069	1211074	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3133	NC_010943	GCCG	2	8	1215470	1215477	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3134	NC_010943	ATG	2	6	1215493	1215498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3136	NC_010943	TGG	2	6	1215605	1215610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3139	NC_010943	GCC	2	6	1216781	1216786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3146	NC_010943	CCGG	2	8	1221598	1221605	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3248	NC_010943	CCGT	2	8	1282329	1282336	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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3251	NC_010943	GCA	2	6	1284178	1284183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3252	NC_010943	CGAA	2	8	1284232	1284239	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3253	NC_010943	TGGA	2	8	1284802	1284809	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3254	NC_010943	A	6	6	1284812	1284817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3255	NC_010943	TGG	2	6	1284918	1284923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3256	NC_010943	GCG	2	6	1286480	1286485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3257	NC_010943	C	7	7	1286533	1286539	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3258	NC_010943	C	6	6	1287211	1287216	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3259	NC_010943	CT	4	8	1287232	1287239	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3260	NC_010943	ACG	2	6	1287254	1287259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3261	NC_010943	CGT	2	6	1287276	1287281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3262	NC_010943	T	6	6	1287281	1287286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3263	NC_010943	CGGGC	2	10	1287299	1287308	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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3265	NC_010943	CAGG	2	8	1287348	1287355	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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3389	NC_010943	GCT	2	6	1310435	1310440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3390	NC_010943	CCCGG	2	10	1311671	1311680	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3391	NC_010943	GGC	2	6	1312480	1312485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3392	NC_010943	CGG	2	6	1312493	1312498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3393	NC_010943	GTT	2	6	1312543	1312548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3395	NC_010943	GGC	3	9	1314436	1314444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3396	NC_010943	CTG	2	6	1314449	1314454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3397	NC_010943	CG	3	6	1314477	1314482	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3398	NC_010943	GCCG	2	8	1314513	1314520	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3399	NC_010943	A	6	6	1314541	1314546	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3400	NC_010943	CGG	2	6	1314621	1314626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3401	NC_010943	G	7	7	1316070	1316076	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3402	NC_010943	CAG	2	6	1316083	1316088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3403	NC_010943	CAT	2	6	1316124	1316129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3405	NC_010943	CGGC	2	8	1316195	1316202	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3422	NC_010943	CG	3	6	1324088	1324093	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3423	NC_010943	GCC	2	6	1324160	1324165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3428	NC_010943	TA	3	6	1324277	1324282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3436	NC_010943	CGC	2	6	1336538	1336543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3437	NC_010943	A	7	7	1336572	1336578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3483	NC_010943	CGGG	2	8	1354378	1354385	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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3492	NC_010943	GCAAGC	2	12	1360737	1360748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3493	NC_010943	GC	3	6	1360747	1360752	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3494	NC_010943	GCCGG	2	10	1360769	1360778	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3495	NC_010943	AGC	2	6	1360846	1360851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3499	NC_010943	GGT	2	6	1363924	1363929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3500	NC_010943	CCG	2	6	1363945	1363950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

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