MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Stenotrophomonas maltophilia K279a chromosome

Total Repeats: 11691

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010943	CGG	2	6	374483	374488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_010943	CGC	2	6	374698	374703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1003	NC_010943	GTT	2	6	375062	375067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_010943	CCG	2	6	376217	376222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1005	NC_010943	CGGCG	2	10	376231	376240	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1006	NC_010943	CGG	2	6	377589	377594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_010943	GT	3	6	379152	379157	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_010943	AGG	2	6	379570	379575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_010943	CCAC	2	8	380498	380505	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1010	NC_010943	GTG	2	6	380509	380514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_010943	TGCC	2	8	381650	381657	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1012	NC_010943	ACG	2	6	381696	381701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_010943	CCT	2	6	384149	384154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1014	NC_010943	TCG	2	6	384162	384167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_010943	CG	3	6	384184	384189	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1016	NC_010943	CG	4	8	384191	384198	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1017	NC_010943	CGATG	2	10	384297	384306	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1018	NC_010943	GCT	2	6	384317	384322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_010943	GC	3	6	384938	384943	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1020	NC_010943	GC	3	6	384946	384951	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1021	NC_010943	GGCCC	2	10	384968	384977	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1022	NC_010943	GGC	2	6	385038	385043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_010943	GGTT	2	8	386188	386195	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_010943	GCT	2	6	386223	386228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_010943	GCA	2	6	386280	386285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_010943	CGG	2	6	386326	386331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_010943	CGA	2	6	386344	386349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_010943	CAGTG	2	10	386356	386365	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1029	NC_010943	G	6	6	388269	388274	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_010943	CTG	2	6	388287	388292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_010943	ATG	2	6	388298	388303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_010943	ATC	4	12	388311	388322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_010943	GCA	2	6	389721	389726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_010943	CTG	2	6	389781	389786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_010943	CAG	2	6	389792	389797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_010943	GCG	2	6	389837	389842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_010943	G	6	6	390249	390254	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_010943	CGG	2	6	390264	390269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_010943	CCG	2	6	391086	391091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1040	NC_010943	TTCA	2	8	391156	391163	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1041	NC_010943	CTG	2	6	393790	393795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_010943	GCG	2	6	393805	393810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_010943	CAT	2	6	394607	394612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_010943	CTG	2	6	395437	395442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_010943	GCC	2	6	395446	395451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1046	NC_010943	GCA	2	6	399629	399634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_010943	GCCG	2	8	399646	399653	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1048	NC_010943	CA	3	6	399677	399682	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1049	NC_010943	CGGC	2	8	399702	399709	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1050	NC_010943	CG	3	6	400382	400387	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1051	NC_010943	GC	3	6	400394	400399	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1052	NC_010943	GC	3	6	403078	403083	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1053	NC_010943	GCA	2	6	407556	407561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_010943	GGC	3	9	407578	407586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_010943	ACCAGC	2	12	407588	407599	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1056	NC_010943	CA	3	6	407604	407609	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1057	NC_010943	TGG	2	6	407645	407650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_010943	GCC	2	6	407667	407672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1059	NC_010943	TCG	2	6	407674	407679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_010943	C	6	6	407685	407690	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1061	NC_010943	CGG	2	6	407789	407794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_010943	CGG	2	6	409247	409252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_010943	CCG	2	6	409295	409300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1064	NC_010943	TGCC	2	8	411485	411492	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1065	NC_010943	ATC	2	6	411508	411513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_010943	GCCGC	2	10	411794	411803	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1067	NC_010943	CCACG	2	10	411845	411854	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1068	NC_010943	A	7	7	413008	413014	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_010943	TGC	2	6	413031	413036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_010943	CTT	2	6	413043	413048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_010943	CGG	2	6	414537	414542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_010943	T	6	6	414543	414548	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_010943	TGG	2	6	414551	414556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_010943	CA	3	6	414671	414676	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1075	NC_010943	AGT	2	6	414695	414700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_010943	AAGG	2	8	415920	415927	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_010943	CCTT	2	8	415943	415950	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1078	NC_010943	GCT	2	6	415980	415985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_010943	TCC	2	6	415996	416001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1080	NC_010943	A	7	7	416038	416044	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_010943	TCC	2	6	416089	416094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1082	NC_010943	CCA	2	6	416111	416116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1083	NC_010943	ACA	2	6	416130	416135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_010943	CAC	2	6	416143	416148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1085	NC_010943	GAT	2	6	416159	416164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_010943	CGAA	2	8	416165	416172	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1087	NC_010943	GGC	2	6	416206	416211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_010943	GCA	2	6	416231	416236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_010943	AGGA	2	8	416309	416316	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_010943	AAGC	2	8	416366	416373	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1091	NC_010943	ATCA	2	8	416388	416395	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1092	NC_010943	GCA	2	6	416503	416508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_010943	CT	3	6	416521	416526	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1094	NC_010943	CCA	2	6	416702	416707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1095	NC_010943	CGA	2	6	416711	416716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_010943	GAT	2	6	416736	416741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_010943	GCA	2	6	416785	416790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_010943	GAA	2	6	416844	416849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_010943	GAAA	2	8	416880	416887	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_010943	CAG	2	6	416953	416958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_010943	GCGT	2	8	417009	417016	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1102	NC_010943	GGT	2	6	417018	417023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_010943	AGG	2	6	417143	417148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_010943	ACACTG	2	12	417181	417192	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_010943	CGC	2	6	417312	417317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1106	NC_010943	GAA	2	6	417408	417413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_010943	TGC	2	6	417484	417489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_010943	GTC	2	6	417496	417501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_010943	TCGTG	2	10	417505	417514	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1110	NC_010943	TGG	2	6	417574	417579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_010943	CCG	2	6	417594	417599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1112	NC_010943	GGA	2	6	417610	417615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_010943	TCA	2	6	417635	417640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_010943	AC	3	6	417661	417666	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1115	NC_010943	TAC	2	6	417668	417673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_010943	TGC	2	6	417801	417806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_010943	AC	3	6	417831	417836	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1118	NC_010943	TTG	2	6	417858	417863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_010943	CCT	2	6	417972	417977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1120	NC_010943	GTC	2	6	418117	418122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_010943	CCA	2	6	418142	418147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1122	NC_010943	GGT	2	6	418191	418196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_010943	CCA	2	6	418248	418253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1124	NC_010943	AGCG	2	8	418334	418341	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1125	NC_010943	GA	3	6	418380	418385	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_010943	ATTG	2	8	418399	418406	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_010943	CAA	2	6	418566	418571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_010943	ACCC	2	8	418602	418609	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1129	NC_010943	GCT	2	6	418639	418644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_010943	CGA	2	6	418717	418722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_010943	G	6	6	418868	418873	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_010943	TCC	2	6	418878	418883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1133	NC_010943	TAC	2	6	418893	418898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_010943	GACC	2	8	418900	418907	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1135	NC_010943	AC	3	6	419402	419407	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1136	NC_010943	CGTC	2	8	419420	419427	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1137	NC_010943	AAC	2	6	419439	419444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1154	NC_010943	GGT	2	6	420850	420855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1172	NC_010943	ACG	2	6	421783	421788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1197	NC_010943	TGG	2	6	423238	423243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1251	NC_010943	ATCCC	2	10	427179	427188	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1252	NC_010943	GCT	2	6	427280	427285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1255	NC_010943	CGGC	2	8	427454	427461	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1256	NC_010943	GCC	2	6	427494	427499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1257	NC_010943	AAAAG	2	10	427510	427519	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1258	NC_010943	GCTCT	2	10	427539	427548	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1259	NC_010943	GGC	2	6	429317	429322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1262	NC_010943	CGGA	2	8	431459	431466	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1263	NC_010943	GAA	3	9	433035	433043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1264	NC_010943	CGGC	2	8	433060	433067	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1265	NC_010943	CTAGC	2	10	433776	433785	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1266	NC_010943	A	6	6	433832	433837	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1267	NC_010943	CGT	2	6	433845	433850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1268	NC_010943	CGT	2	6	433891	433896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1407	NC_010943	CACC	2	8	488469	488476	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1408	NC_010943	CACC	2	8	488581	488588	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1409	NC_010943	CACC	2	8	488693	488700	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1410	NC_010943	GGT	2	6	488744	488749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1411	NC_010943	CACC	2	8	488805	488812	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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1413	NC_010943	CACC	2	8	488916	488923	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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1446	NC_010943	GC	3	6	497088	497093	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1447	NC_010943	CTGG	2	8	497108	497115	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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1452	NC_010943	CGG	2	6	497857	497862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1455	NC_010943	GCG	2	6	498043	498048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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