MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Stenotrophomonas maltophilia K279a chromosome

Total Repeats: 11691

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_010943	GGT	2	6	4788426	4788431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11502	NC_010943	ATTTCA	2	12	4788582	4788593	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11503	NC_010943	GCC	2	6	4788696	4788701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11504	NC_010943	CCA	2	6	4788882	4788887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11505	NC_010943	TC	3	6	4788948	4788953	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11506	NC_010943	TACGG	2	10	4788994	4789003	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11507	NC_010943	CAAC	2	8	4789140	4789147	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11508	NC_010943	CAG	2	6	4789365	4789370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11509	NC_010943	CTC	2	6	4789405	4789410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11510	NC_010943	CTTT	2	8	4789508	4789515	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11511	NC_010943	GCT	2	6	4789524	4789529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11512	NC_010943	CCT	2	6	4789540	4789545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11513	NC_010943	CTGT	2	8	4789548	4789555	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11514	NC_010943	GTT	2	6	4789614	4789619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11515	NC_010943	ACG	2	6	4789629	4789634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11516	NC_010943	GT	3	6	4789651	4789656	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11517	NC_010943	GAG	2	6	4789781	4789786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11518	NC_010943	TCGG	2	8	4790149	4790156	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11519	NC_010943	AGT	2	6	4790159	4790164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11520	NC_010943	GGA	2	6	4790175	4790180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11521	NC_010943	C	6	6	4790185	4790190	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11522	NC_010943	TCG	2	6	4790336	4790341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11523	NC_010943	CAG	2	6	4790413	4790418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11524	NC_010943	GGGT	2	8	4790449	4790456	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
11525	NC_010943	TTG	2	6	4790487	4790492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11526	NC_010943	TCAA	2	8	4790651	4790658	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11527	NC_010943	TC	3	6	4790673	4790678	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11528	NC_010943	CGCT	2	8	4790717	4790724	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11529	NC_010943	TGG	2	6	4790805	4790810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11530	NC_010943	ACC	2	6	4790862	4790867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11531	NC_010943	TGG	2	6	4790911	4790916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11532	NC_010943	CGA	2	6	4790935	4790940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11533	NC_010943	AGG	2	6	4791081	4791086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11534	NC_010943	CAA	2	6	4791195	4791200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11535	NC_010943	GT	3	6	4791222	4791227	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11536	NC_010943	GCA	2	6	4791252	4791257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11537	NC_010943	GTA	2	6	4791385	4791390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11538	NC_010943	GT	3	6	4791392	4791397	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11539	NC_010943	ATG	2	6	4791417	4791422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11540	NC_010943	TCC	2	6	4791443	4791448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11541	NC_010943	CGG	2	6	4791459	4791464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11542	NC_010943	CCA	2	6	4791479	4791484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11543	NC_010943	CACGA	2	10	4791544	4791553	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
11544	NC_010943	GAC	2	6	4791557	4791562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11545	NC_010943	GCA	2	6	4791569	4791574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11546	NC_010943	TTC	2	6	4791645	4791650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11547	NC_010943	GGC	2	6	4791740	4791745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11548	NC_010943	TCC	2	6	4791909	4791914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11549	NC_010943	ACC	2	6	4792035	4792040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11550	NC_010943	ACGC	2	8	4792042	4792049	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11551	NC_010943	GCT	2	6	4792099	4792104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11552	NC_010943	TTTC	2	8	4792171	4792178	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11553	NC_010943	CAA	2	6	4792180	4792185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11554	NC_010943	CTT	2	6	4792208	4792213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11555	NC_010943	CTG	2	6	4792267	4792272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11556	NC_010943	ATC	2	6	4792317	4792322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11557	NC_010943	TCG	2	6	4792342	4792347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11558	NC_010943	TGG	2	6	4792351	4792356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11559	NC_010943	AG	3	6	4792532	4792537	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11560	NC_010943	TGC	2	6	4792550	4792555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11561	NC_010943	GAT	2	6	4792661	4792666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11562	NC_010943	GCTT	2	8	4792685	4792692	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11563	NC_010943	ATC	2	6	4792738	4792743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11564	NC_010943	TGC	2	6	4792822	4792827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11565	NC_010943	GCC	2	6	4792847	4792852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11566	NC_010943	T	6	6	4792886	4792891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11570	NC_010943	GCC	2	6	4792969	4792974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11571	NC_010943	TAT	2	6	4792975	4792980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11572	NC_010943	TTCG	2	8	4793008	4793015	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11573	NC_010943	ATC	2	6	4793016	4793021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11574	NC_010943	TCGT	2	8	4793022	4793029	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11575	NC_010943	GGT	2	6	4793031	4793036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11579	NC_010943	TGA	2	6	4793138	4793143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11584	NC_010943	GCC	2	6	4795090	4795095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11585	NC_010943	GC	3	6	4795127	4795132	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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11598	NC_010943	GGAT	2	8	4801637	4801644	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11599	NC_010943	CGGC	2	8	4802512	4802519	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11600	NC_010943	GCCG	2	8	4802553	4802560	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11601	NC_010943	GCCG	2	8	4802586	4802593	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11602	NC_010943	GCCG	2	8	4802620	4802627	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11603	NC_010943	GCCG	2	8	4802679	4802686	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11604	NC_010943	GCCG	2	8	4802735	4802742	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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11608	NC_010943	G	6	6	4809095	4809100	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11609	NC_010943	GTC	2	6	4809104	4809109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11611	NC_010943	CGT	2	6	4809145	4809150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11612	NC_010943	CCAT	2	8	4809224	4809231	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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11614	NC_010943	GCG	2	6	4809340	4809345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11619	NC_010943	CGGG	2	8	4809510	4809517	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11620	NC_010943	GCTT	2	8	4809604	4809611	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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11629	NC_010943	TCC	2	6	4810346	4810351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11630	NC_010943	C	7	7	4810355	4810361	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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11638	NC_010943	CCG	2	6	4815248	4815253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11639	NC_010943	ACG	2	6	4815273	4815278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11655	NC_010943	CGG	2	6	4829161	4829166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11656	NC_010943	GTGG	2	8	4829184	4829191	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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11659	NC_010943	GTCG	2	8	4829834	4829841	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11660	NC_010943	GCCG	2	8	4829843	4829850	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11661	NC_010943	CGGC	2	8	4829903	4829910	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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11677	NC_010943	GCCG	2	8	4842139	4842146	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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11688	NC_010943	GGT	2	6	4851034	4851039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11690	NC_010943	C	6	6	4851058	4851063	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.