MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Stenotrophomonas maltophilia K279a chromosome

Total Repeats: 11691

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010943	CATT	2	8	184095	184102	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
502	NC_010943	T	6	6	185709	185714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_010943	TGG	2	6	185756	185761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
504	NC_010943	GCTT	2	8	185769	185776	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
505	NC_010943	CG	3	6	185784	185789	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
506	NC_010943	CAG	2	6	186262	186267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_010943	AGA	2	6	186276	186281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_010943	GCG	2	6	186298	186303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_010943	GAT	2	6	186323	186328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_010943	GC	3	6	186352	186357	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
511	NC_010943	GCC	2	6	186377	186382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
512	NC_010943	GTT	2	6	187144	187149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_010943	TGC	3	9	187778	187786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_010943	TGA	2	6	187924	187929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
515	NC_010943	CCA	2	6	187947	187952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
516	NC_010943	GAC	2	6	187960	187965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_010943	GAA	2	6	187976	187981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_010943	GAGAG	2	10	189570	189579	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
519	NC_010943	TG	3	6	189584	189589	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
520	NC_010943	ATC	2	6	191068	191073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_010943	CAG	2	6	191143	191148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_010943	CGGG	2	8	191171	191178	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
523	NC_010943	CTCC	2	8	192360	192367	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
524	NC_010943	GCG	2	6	192392	192397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_010943	CAA	2	6	192470	192475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_010943	CGG	2	6	192512	192517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_010943	GTG	2	6	193531	193536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
528	NC_010943	AAG	2	6	193542	193547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
529	NC_010943	TTAT	2	8	193587	193594	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_010943	CAGT	2	8	193599	193606	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
531	NC_010943	TC	4	8	193666	193673	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
532	NC_010943	GGC	2	6	193686	193691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_010943	CGA	2	6	193692	193697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_010943	AAT	2	6	193704	193709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_010943	GT	3	6	193715	193720	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
536	NC_010943	CT	6	12	194340	194351	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
537	NC_010943	TGC	2	6	195216	195221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_010943	CAC	2	6	195242	195247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
539	NC_010943	CAG	2	6	195737	195742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_010943	AGC	2	6	196737	196742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_010943	GCC	2	6	196744	196749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
542	NC_010943	GCAC	2	8	197273	197280	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
543	NC_010943	CCAA	2	8	197282	197289	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
544	NC_010943	ACA	2	6	200114	200119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_010943	GC	3	6	200137	200142	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
546	NC_010943	ATG	2	6	200158	200163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_010943	CT	3	6	200225	200230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
548	NC_010943	CGGG	2	8	201584	201591	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
549	NC_010943	CCCG	2	8	201599	201606	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
550	NC_010943	GTTC	2	8	202047	202054	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
551	NC_010943	AGGG	2	8	202082	202089	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
552	NC_010943	GGC	2	6	202188	202193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_010943	CCCT	2	8	202262	202269	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
554	NC_010943	GCG	2	6	204308	204313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_010943	CG	3	6	204377	204382	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
556	NC_010943	CGG	2	6	205491	205496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_010943	GGGC	2	8	210254	210261	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
558	NC_010943	GT	3	6	210271	210276	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
559	NC_010943	CGG	2	6	212036	212041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_010943	CG	3	6	212053	212058	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
561	NC_010943	GTT	2	6	212078	212083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
562	NC_010943	CG	3	6	212106	212111	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
563	NC_010943	TGC	2	6	212147	212152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_010943	TTGG	2	8	212191	212198	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
565	NC_010943	GCCG	2	8	213488	213495	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
566	NC_010943	GCCG	2	8	213519	213526	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
567	NC_010943	GCGA	2	8	213559	213566	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
568	NC_010943	CG	3	6	213620	213625	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
569	NC_010943	CGAGC	2	10	213647	213656	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
570	NC_010943	CGG	2	6	213667	213672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_010943	CGG	2	6	213722	213727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_010943	GAG	2	6	213731	213736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
573	NC_010943	GCA	2	6	213753	213758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_010943	GGC	2	6	213772	213777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_010943	CG	3	6	213804	213809	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
576	NC_010943	GAAA	2	8	213810	213817	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
577	NC_010943	AGA	2	6	213863	213868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
578	NC_010943	GA	3	6	213867	213872	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
579	NC_010943	CGA	2	6	214378	214383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_010943	CCG	2	6	214384	214389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
581	NC_010943	GGC	2	6	214420	214425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_010943	GTG	2	6	214936	214941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
583	NC_010943	GTA	2	6	214944	214949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_010943	GTA	2	6	214952	214957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
585	NC_010943	TCAG	2	8	215012	215019	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
586	NC_010943	CGG	2	6	215121	215126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_010943	TGC	2	6	215149	215154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_010943	GC	4	8	215273	215280	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
589	NC_010943	GCCC	2	8	218184	218191	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
590	NC_010943	GCCG	2	8	218217	218224	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
591	NC_010943	GCCG	2	8	218251	218258	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
592	NC_010943	C	6	6	218316	218321	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
593	NC_010943	CTG	2	6	219839	219844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_010943	ACG	2	6	219846	219851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_010943	GAT	2	6	219858	219863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
596	NC_010943	GGTG	2	8	220851	220858	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
597	NC_010943	TGA	2	6	220888	220893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
598	NC_010943	CGGC	2	8	220907	220914	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
599	NC_010943	GCC	2	6	221360	221365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
600	NC_010943	GGC	2	6	221369	221374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_010943	GCC	2	6	221417	221422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
602	NC_010943	GCG	2	6	221441	221446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_010943	GGAT	2	8	224141	224148	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
604	NC_010943	ACC	2	6	224168	224173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
605	NC_010943	GAG	2	6	224177	224182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
606	NC_010943	GCCG	2	8	224351	224358	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
607	NC_010943	CAC	2	6	224412	224417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
608	NC_010943	GAC	2	6	225688	225693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_010943	GGGT	2	8	225712	225719	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
610	NC_010943	GCG	2	6	225749	225754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_010943	ACCC	2	8	225798	225805	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
612	NC_010943	CGGC	2	8	225853	225860	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
613	NC_010943	GGC	2	6	225877	225882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_010943	CCCA	2	8	225923	225930	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
615	NC_010943	CGG	2	6	228255	228260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_010943	CGC	2	6	228268	228273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
617	NC_010943	GCG	2	6	231449	231454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_010943	CG	3	6	231472	231477	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
619	NC_010943	AGG	2	6	231479	231484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
620	NC_010943	CCG	2	6	232175	232180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
621	NC_010943	TGC	2	6	232181	232186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_010943	GCCG	2	8	232206	232213	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
623	NC_010943	GCCG	2	8	232254	232261	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
624	NC_010943	GCAG	2	8	232290	232297	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
625	NC_010943	GCCG	2	8	233100	233107	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
626	NC_010943	CGGC	2	8	233154	233161	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
627	NC_010943	AAC	2	6	234268	234273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_010943	GCT	2	6	234282	234287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_010943	GCCG	2	8	234288	234295	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
630	NC_010943	GCC	2	6	234297	234302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
631	NC_010943	GCCG	2	8	234868	234875	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
632	NC_010943	GAAA	2	8	237152	237159	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
633	NC_010943	CGG	2	6	237163	237168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_010943	CCG	2	6	237177	237182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
635	NC_010943	CCA	2	6	237273	237278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
636	NC_010943	GGGT	2	8	237327	237334	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
637	NC_010943	ACCC	2	8	237412	237419	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
638	NC_010943	GCTGTT	3	18	237445	237462	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
639	NC_010943	CGGC	2	8	237478	237485	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
640	NC_010943	ACA	2	6	238367	238372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
641	NC_010943	GCG	2	6	238391	238396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
642	NC_010943	GC	4	8	238412	238419	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
643	NC_010943	CGG	2	6	238440	238445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
644	NC_010943	CG	3	6	238453	238458	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
645	NC_010943	C	7	7	238495	238501	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
646	NC_010943	ACC	2	6	238522	238527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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649	NC_010943	TCCC	2	8	239253	239260	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
650	NC_010943	GCCG	2	8	240567	240574	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
651	NC_010943	GC	3	6	240665	240670	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
652	NC_010943	CCG	2	6	241525	241530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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661	NC_010943	GGC	2	6	241898	241903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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664	NC_010943	TCCC	2	8	244653	244660	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
665	NC_010943	GCAC	2	8	244665	244672	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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678	NC_010943	GATG	2	8	250428	250435	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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776	NC_010943	GGC	2	6	288828	288833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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