MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Stenotrophomonas maltophilia K279a chromosome

Total Repeats: 11691

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_010943	AAAC	2	8	2036187	2036194	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5002	NC_010943	CG	4	8	2036254	2036261	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5003	NC_010943	GC	4	8	2036265	2036272	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5004	NC_010943	CTG	2	6	2036281	2036286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_010943	TGG	2	6	2037621	2037626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_010943	GGCC	2	8	2037627	2037634	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5007	NC_010943	CGGC	2	8	2037673	2037680	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5008	NC_010943	GCG	2	6	2039799	2039804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5009	NC_010943	GC	4	8	2039815	2039822	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5010	NC_010943	GTAGG	2	10	2043090	2043099	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_010943	GCGG	2	8	2043160	2043167	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5012	NC_010943	TCGT	2	8	2043218	2043225	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5013	NC_010943	T	6	6	2043350	2043355	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_010943	T	6	6	2043644	2043649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_010943	CTG	2	6	2043655	2043660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5016	NC_010943	GGCG	2	8	2044465	2044472	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5017	NC_010943	GTC	2	6	2044476	2044481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5018	NC_010943	G	9	9	2046063	2046071	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_010943	CCTGCA	2	12	2046086	2046097	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5020	NC_010943	GCCAAA	2	12	2046119	2046130	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5021	NC_010943	CCAT	2	8	2046215	2046222	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5022	NC_010943	TTCGAT	2	12	2046355	2046366	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5023	NC_010943	GGGT	2	8	2046426	2046433	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_010943	CGGG	2	8	2046476	2046483	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5025	NC_010943	ACGG	2	8	2046559	2046566	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5026	NC_010943	ACCC	2	8	2046591	2046598	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5027	NC_010943	TTGCTG	2	12	2046629	2046640	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5028	NC_010943	CGGC	2	8	2046676	2046683	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5029	NC_010943	CAGG	2	8	2046726	2046733	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5030	NC_010943	CCAA	2	8	2047334	2047341	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5031	NC_010943	TTGG	2	8	2047390	2047397	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_010943	CCAA	2	8	2047430	2047437	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5033	NC_010943	GCT	2	6	2047484	2047489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5034	NC_010943	CCTG	2	8	2048882	2048889	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5035	NC_010943	TGGGG	2	10	2048909	2048918	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_010943	GTC	2	6	2048960	2048965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5037	NC_010943	CACG	2	8	2048969	2048976	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5038	NC_010943	GCC	2	6	2048997	2049002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5039	NC_010943	GGCAGG	2	12	2050103	2050114	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
5040	NC_010943	AAT	2	6	2050164	2050169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_010943	AAG	2	6	2050190	2050195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_010943	CGGC	2	8	2051165	2051172	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5043	NC_010943	TCGG	2	8	2053117	2053124	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5044	NC_010943	CAG	2	6	2053128	2053133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5045	NC_010943	TCGAG	2	10	2053146	2053155	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5046	NC_010943	TGG	2	6	2053183	2053188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_010943	CACC	2	8	2053211	2053218	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5048	NC_010943	CACC	2	8	2053255	2053262	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5049	NC_010943	CACC	2	8	2053276	2053283	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5050	NC_010943	GGGC	2	8	2053757	2053764	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5051	NC_010943	GCG	2	6	2054261	2054266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5052	NC_010943	GTG	2	6	2054307	2054312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_010943	TCC	2	6	2054343	2054348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5054	NC_010943	TGTGG	2	10	2062129	2062138	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_010943	GGC	2	6	2062158	2062163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5056	NC_010943	T	7	7	2062171	2062177	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_010943	CCAA	2	8	2062193	2062200	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5058	NC_010943	CGG	2	6	2062234	2062239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5059	NC_010943	GACGGC	2	12	2064947	2064958	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5060	NC_010943	CG	3	6	2064963	2064968	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5061	NC_010943	GCCG	2	8	2064991	2064998	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5062	NC_010943	CGGC	2	8	2065049	2065056	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5063	NC_010943	GCCC	2	8	2066117	2066124	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5064	NC_010943	CGG	2	6	2066126	2066131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5065	NC_010943	CAG	2	6	2066516	2066521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5067	NC_010943	CAGCCG	2	12	2066590	2066601	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5068	NC_010943	AGT	2	6	2066762	2066767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_010943	CG	3	6	2067624	2067629	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5070	NC_010943	GGT	3	9	2067650	2067658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_010943	ATG	2	6	2067694	2067699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_010943	CTA	2	6	2067713	2067718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5073	NC_010943	GGCG	2	8	2067751	2067758	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5074	NC_010943	TGTT	2	8	2069514	2069521	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_010943	GCG	2	6	2075247	2075252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5076	NC_010943	TTGA	2	8	2075255	2075262	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_010943	CCAT	2	8	2075331	2075338	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5078	NC_010943	GCG	2	6	2075390	2075395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5079	NC_010943	CGGA	2	8	2075396	2075403	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5080	NC_010943	A	6	6	2075433	2075438	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_010943	TTG	2	6	2075464	2075469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5084	NC_010943	CG	3	6	2075541	2075546	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5085	NC_010943	GGGT	2	8	2075563	2075570	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_010943	CACC	2	8	2075652	2075659	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5087	NC_010943	CCAA	2	8	2075672	2075679	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5088	NC_010943	TC	3	6	2076922	2076927	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5089	NC_010943	T	6	6	2076931	2076936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_010943	CACC	2	8	2076962	2076969	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5091	NC_010943	CAG	2	6	2079406	2079411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5093	NC_010943	GGTG	2	8	2080185	2080192	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_010943	GCCG	2	8	2080204	2080211	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5095	NC_010943	CGGC	2	8	2080256	2080263	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5097	NC_010943	T	7	7	2080336	2080342	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_010943	CAC	2	6	2083707	2083712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5099	NC_010943	TCCC	2	8	2083732	2083739	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5100	NC_010943	GGGCG	2	10	2083743	2083752	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
5101	NC_010943	GGC	2	6	2087034	2087039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5102	NC_010943	GCC	2	6	2087046	2087051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5103	NC_010943	TG	4	8	2087057	2087064	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_010943	GCCG	2	8	2087070	2087077	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5105	NC_010943	GAT	2	6	2087092	2087097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_010943	GT	3	6	2087103	2087108	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_010943	CGGC	2	8	2087128	2087135	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5108	NC_010943	CCA	2	6	2087921	2087926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5109	NC_010943	CGG	3	9	2088648	2088656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5110	NC_010943	CTGG	2	8	2088657	2088664	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5111	NC_010943	CG	3	6	2088686	2088691	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5112	NC_010943	CCAA	2	8	2090809	2090816	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5113	NC_010943	CCGG	2	8	2090862	2090869	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5114	NC_010943	GC	3	6	2090888	2090893	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5117	NC_010943	CCAA	2	8	2091002	2091009	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5118	NC_010943	TGG	2	6	2091036	2091041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_010943	CACC	2	8	2091042	2091049	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5120	NC_010943	GAT	2	6	2091071	2091076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_010943	TTG	2	6	2091161	2091166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_010943	AC	3	6	2091190	2091195	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5123	NC_010943	GCCG	2	8	2093043	2093050	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5124	NC_010943	GGC	2	6	2093054	2093059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5126	NC_010943	CGG	2	6	2093135	2093140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5127	NC_010943	GCCG	2	8	2093149	2093156	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5128	NC_010943	CGGC	2	8	2093206	2093213	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5129	NC_010943	ACC	2	6	2093214	2093219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5130	NC_010943	GGT	2	6	2093241	2093246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_010943	GCCG	2	8	2093254	2093261	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5132	NC_010943	GC	3	6	2094075	2094080	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5134	NC_010943	CTG	2	6	2095041	2095046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5135	NC_010943	TGG	2	6	2095048	2095053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5137	NC_010943	TTGG	2	8	2095119	2095126	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5138	NC_010943	TCCG	2	8	2095132	2095139	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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5255	NC_010943	GTT	2	6	2153783	2153788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5259	NC_010943	CCT	2	6	2153975	2153980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5260	NC_010943	CGA	2	6	2154035	2154040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5265	NC_010943	CA	3	6	2154915	2154920	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5266	NC_010943	AG	3	6	2155982	2155987	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5268	NC_010943	CTT	2	6	2156057	2156062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5269	NC_010943	TC	4	8	2157788	2157795	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5270	NC_010943	TGA	2	6	2157905	2157910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5279	NC_010943	AGGGC	2	10	2166755	2166764	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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5299	NC_010943	GGA	2	6	2176491	2176496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5382	NC_010943	CGGCG	2	10	2215835	2215844	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5383	NC_010943	GAC	2	6	2215845	2215850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5388	NC_010943	GCTCCG	2	12	2216627	2216638	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5389	NC_010943	GC	3	6	2218118	2218123	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5390	NC_010943	GCG	2	6	2218129	2218134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5391	NC_010943	CG	3	6	2218133	2218138	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5392	NC_010943	ACGG	2	8	2218145	2218152	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5393	NC_010943	GGCC	2	8	2218163	2218170	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5394	NC_010943	GCC	2	6	2219687	2219692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5395	NC_010943	CG	3	6	2219727	2219732	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5397	NC_010943	TTC	2	6	2221869	2221874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5398	NC_010943	GCC	2	6	2227355	2227360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5399	NC_010943	CG	3	6	2227361	2227366	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5400	NC_010943	GGT	2	6	2232124	2232129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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