MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1 chromosome

Total Repeats: 97

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010730	TAACTT	2	12	12733	12744	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_010730	TCAAAA	2	12	27904	27915	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_010730	AGTTTA	2	12	41390	41401	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010730	ATTTAA	2	12	52042	52053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010730	ATTTAA	2	12	91064	91075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010730	TTTTTG	2	12	105452	105463	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010730	GATTTT	2	12	118922	118933	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010730	ATTAAA	2	12	123701	123712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010730	TAAAAA	2	12	157805	157816	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010730	TGAGCG	2	12	228463	228474	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_010730	TAAAGT	2	12	228556	228567	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010730	GGTAAA	2	12	252729	252740	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010730	AAATTT	2	12	266215	266226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010730	TTTGCA	2	12	275169	275180	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_010730	GTACCG	2	12	282165	282176	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_010730	ATGAAG	2	12	322495	322506	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010730	TAATTT	2	12	327682	327693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010730	CCTGCG	2	12	354749	354760	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
19	NC_010730	TTTTTC	2	12	359440	359451	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_010730	TTATTT	2	12	359489	359500	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010730	AGTAAA	2	12	370730	370741	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010730	GGAGGG	2	12	375573	375584	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010730	TGAAGA	2	12	378625	378636	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010730	AAAAAT	2	12	395109	395120	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010730	TAAAAA	2	12	442943	442954	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010730	TTTAAT	2	12	460893	460904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010730	TTAAAA	2	12	470474	470485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010730	AGTTTT	2	12	522109	522120	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010730	CTTCGG	2	12	572256	572267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_010730	TTTGAA	3	18	578410	578427	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010730	GGAGAT	2	12	580168	580179	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010730	TAATTC	2	12	582151	582162	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_010730	CTTCCA	2	12	592573	592584	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_010730	ACTTTC	2	12	652475	652486	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_010730	GAAATT	2	12	683040	683051	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010730	ATAAAA	2	12	744634	744645	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010730	CCTGCG	2	12	750089	750100	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
38	NC_010730	AGTAAA	2	12	768901	768912	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010730	TTTCTT	2	12	778648	778659	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_010730	TATAAT	3	18	801449	801466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010730	CCTGCG	2	12	822288	822299	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
42	NC_010730	TTTTTC	2	12	827071	827082	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_010730	AATAAA	2	12	838240	838251	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010730	TTCAAT	2	12	841988	841999	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_010730	ATTTTT	2	12	878266	878277	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010730	TAAACA	2	12	880037	880048	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_010730	CAATAT	2	12	897954	897965	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_010730	TTGGGA	2	12	898210	898221	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010730	TTTTTA	2	12	923034	923045	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010730	TTATAA	2	12	932777	932788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010730	AATTAA	2	12	933678	933689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010730	AACTTA	2	12	955947	955958	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_010730	CCACTT	2	12	956790	956801	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_010730	CCACTT	2	12	960350	960361	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_010730	CCACTT	2	12	961398	961409	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_010730	CCACTT	2	12	961898	961909	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_010730	AAAGTT	2	12	966375	966386	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010730	CTCTTT	2	12	971748	971759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_010730	AAAAAT	2	12	1027805	1027816	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010730	AACAAA	2	12	1030344	1030355	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_010730	CTTTAT	2	12	1102692	1102703	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_010730	GGTGAT	2	12	1109778	1109789	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010730	ATTGAA	2	12	1120168	1120179	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010730	TTTTTA	2	12	1125126	1125137	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010730	GTAATT	2	12	1128939	1128950	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010730	AAAAAC	2	12	1184401	1184412	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_010730	AATATA	2	12	1188113	1188124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010730	ATGTAT	2	12	1209449	1209460	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010730	CTTTAT	2	12	1235300	1235311	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_010730	TTATAT	2	12	1307096	1307107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010730	TAAGCG	2	12	1321145	1321156	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_010730	AATTTA	2	12	1332733	1332744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010730	ATTTAA	2	12	1333730	1333741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010730	AATAAA	2	12	1351396	1351407	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010730	ACTTTC	2	12	1356583	1356594	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_010730	AGAAAA	2	12	1358345	1358356	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010730	TAACCA	2	12	1366911	1366922	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_010730	AAAGCA	2	12	1389718	1389729	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_010730	GATAAT	2	12	1436949	1436960	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010730	CAATAA	2	12	1445378	1445389	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_010730	ATTTTT	2	12	1472684	1472695	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010730	TAAATT	2	12	1511361	1511372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010730	CTGCAA	2	12	1542904	1542915	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_010730	AATTTA	2	12	1562154	1562165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010730	TCAAGT	2	12	1563280	1563291	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_010730	GCTAAG	2	12	1581286	1581297	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_010730	AGATTT	2	12	1581375	1581386	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010730	TTTTAA	2	12	1592918	1592929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010730	ACATTT	2	12	1598059	1598070	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_010730	TTTATT	2	12	1601474	1601485	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010730	AAAGGC	2	12	1608968	1608979	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_010730	TTAATT	2	12	1634467	1634478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010730	ATAAAA	2	12	1664106	1664117	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010730	ATTTTT	2	12	1693631	1693642	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010730	CTTTCA	2	12	1711546	1711557	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_010730	TCAAAA	2	12	1777269	1777280	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_010730	GTTTAT	2	12	1834040	1834051	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.