MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1 chromosome

Total Repeats: 6484

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_010730	AGA	2	6	1095480	1095485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_010730	ATC	2	6	1095575	1095580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_010730	GTAA	2	8	1095629	1095636	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_010730	TTC	2	6	1095665	1095670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4005	NC_010730	GAC	2	6	1095685	1095690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_010730	TCC	2	6	1097709	1097714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4007	NC_010730	T	7	7	1099049	1099055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_010730	A	6	6	1099090	1099095	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_010730	CAG	2	6	1099101	1099106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_010730	T	6	6	1099191	1099196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_010730	TCA	2	6	1099213	1099218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4012	NC_010730	A	6	6	1099257	1099262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_010730	TAA	2	6	1099305	1099310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_010730	TTC	2	6	1099318	1099323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4015	NC_010730	AAT	2	6	1099346	1099351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_010730	TTA	2	6	1099355	1099360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_010730	TAT	2	6	1099367	1099372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_010730	CTT	2	6	1099385	1099390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4019	NC_010730	A	6	6	1099403	1099408	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_010730	CAT	3	9	1099413	1099421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4021	NC_010730	CGA	2	6	1099430	1099435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4022	NC_010730	T	6	6	1099506	1099511	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_010730	AGA	2	6	1099515	1099520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_010730	CTC	2	6	1099537	1099542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4025	NC_010730	ACA	2	6	1099578	1099583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4026	NC_010730	CT	4	8	1099584	1099591	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4027	NC_010730	CTT	2	6	1099593	1099598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_010730	GAT	2	6	1101596	1101601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_010730	ATA	2	6	1101622	1101627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_010730	CAG	2	6	1102677	1102682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4031	NC_010730	CTTTAT	2	12	1102692	1102703	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4032	NC_010730	TGTTC	2	10	1102717	1102726	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4033	NC_010730	TC	3	6	1102725	1102730	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4034	NC_010730	TA	3	6	1102742	1102747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_010730	CAAA	2	8	1102775	1102782	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4036	NC_010730	T	6	6	1102803	1102808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_010730	ATT	2	6	1102824	1102829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_010730	TAA	2	6	1102894	1102899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_010730	A	6	6	1102906	1102911	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_010730	GGA	2	6	1102921	1102926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_010730	CTT	2	6	1103512	1103517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4042	NC_010730	AGA	2	6	1103524	1103529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_010730	GGA	2	6	1103532	1103537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_010730	AAT	2	6	1105931	1105936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_010730	ATT	3	9	1106004	1106012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_010730	GAA	2	6	1106024	1106029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_010730	TCCT	2	8	1106032	1106039	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4048	NC_010730	GAT	2	6	1106077	1106082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_010730	GAA	2	6	1106084	1106089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_010730	A	6	6	1106096	1106101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_010730	A	6	6	1106105	1106110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_010730	GGTGAT	2	12	1109778	1109789	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_010730	AAT	2	6	1109813	1109818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_010730	TAAAG	2	10	1109844	1109853	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_010730	T	6	6	1109864	1109869	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_010730	CTT	2	6	1109885	1109890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4057	NC_010730	AAAAG	2	10	1109906	1109915	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_010730	TTTA	2	8	1109984	1109991	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_010730	CAGC	2	8	1110000	1110007	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4060	NC_010730	GAA	2	6	1110008	1110013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_010730	T	6	6	1110021	1110026	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_010730	ATT	2	6	1110598	1110603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_010730	ATA	2	6	1110605	1110610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_010730	TA	3	6	1110613	1110618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_010730	AT	3	6	1110645	1110650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_010730	TAT	2	6	1110667	1110672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_010730	A	7	7	1110710	1110716	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_010730	GAA	2	6	1110718	1110723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_010730	TTG	2	6	1110743	1110748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_010730	CTC	2	6	1110762	1110767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4071	NC_010730	AGCGA	2	10	1110783	1110792	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4072	NC_010730	TAT	2	6	1110811	1110816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_010730	CAAA	2	8	1110823	1110830	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4074	NC_010730	A	6	6	1110838	1110843	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_010730	TCA	2	6	1110904	1110909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4076	NC_010730	TCT	2	6	1110915	1110920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4077	NC_010730	TAA	2	6	1110948	1110953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_010730	CTA	2	6	1110968	1110973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4079	NC_010730	TACT	2	8	1110998	1111005	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4080	NC_010730	TGC	2	6	1111056	1111061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4081	NC_010730	TCT	2	6	1111097	1111102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4082	NC_010730	CTT	2	6	1111277	1111282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4083	NC_010730	TTC	2	6	1111288	1111293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4084	NC_010730	TGT	2	6	1111314	1111319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_010730	TAAA	2	8	1111323	1111330	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_010730	AGG	2	6	1111337	1111342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_010730	AGT	2	6	1111343	1111348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4089	NC_010730	GAA	2	6	1111395	1111400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4091	NC_010730	TGT	2	6	1111472	1111477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_010730	GAAA	2	8	1111497	1111504	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_010730	TTC	2	6	1111506	1111511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4094	NC_010730	ACA	2	6	1111528	1111533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4095	NC_010730	AAG	2	6	1111553	1111558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_010730	TGA	2	6	1111655	1111660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_010730	TA	3	6	1111665	1111670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_010730	CTT	2	6	1111674	1111679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4099	NC_010730	AGAT	2	8	1111714	1111721	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_010730	ACT	2	6	1111747	1111752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4101	NC_010730	ACA	2	6	1111757	1111762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4102	NC_010730	A	6	6	1111776	1111781	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_010730	AG	3	6	1111815	1111820	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_010730	TA	3	6	1111845	1111850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_010730	AT	3	6	1111942	1111947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_010730	AGT	2	6	1111968	1111973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_010730	ATAG	2	8	1112013	1112020	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_010730	TGA	2	6	1112051	1112056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_010730	AGA	2	6	1112159	1112164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_010730	A	6	6	1112189	1112194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_010730	A	6	6	1112256	1112261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_010730	TAA	2	6	1112442	1112447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_010730	ATT	2	6	1112471	1112476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_010730	TC	3	6	1112483	1112488	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4115	NC_010730	TCA	2	6	1112552	1112557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4116	NC_010730	CCT	2	6	1112972	1112977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4117	NC_010730	T	6	6	1112977	1112982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_010730	ATC	2	6	1113018	1113023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_010730	AGGA	2	8	1113080	1113087	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_010730	ATT	2	6	1113169	1113174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_010730	A	7	7	1113199	1113205	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_010730	GAA	2	6	1113236	1113241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_010730	A	6	6	1113276	1113281	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_010730	GAA	2	6	1113312	1113317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_010730	TTTTC	2	10	1113326	1113335	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4126	NC_010730	TAAG	2	8	1113344	1113351	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_010730	ATG	2	6	1113462	1113467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_010730	AT	3	6	1113511	1113516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_010730	A	6	6	1113577	1113582	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_010730	AGG	2	6	1113593	1113598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_010730	A	6	6	1115043	1115048	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_010730	CCT	2	6	1115049	1115054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4133	NC_010730	A	6	6	1115059	1115064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_010730	TAT	2	6	1115435	1115440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_010730	TAT	2	6	1115541	1115546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4136	NC_010730	TAA	2	6	1115547	1115552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4143	NC_010730	TATTT	2	10	1117211	1117220	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4149	NC_010730	AGTT	2	8	1120117	1120124	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4251	NC_010730	AAG	2	6	1149031	1149036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4252	NC_010730	AGCGA	2	10	1149107	1149116	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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4254	NC_010730	AT	4	8	1149151	1149158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4256	NC_010730	TCA	2	6	1149189	1149194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4258	NC_010730	TA	3	6	1153154	1153159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4259	NC_010730	TTA	2	6	1153164	1153169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4260	NC_010730	T	6	6	1153188	1153193	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4261	NC_010730	ATC	2	6	1153205	1153210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4262	NC_010730	A	7	7	1153229	1153235	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4263	NC_010730	AAT	2	6	1153295	1153300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4264	NC_010730	CTATA	2	10	1153305	1153314	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4265	NC_010730	AGG	2	6	1153322	1153327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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