MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 plasmid pBS512_211

Total Repeats: 1260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010660	TCA	2	6	60512	60517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_010660	TTC	2	6	60522	60527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_010660	ATT	2	6	60531	60536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_010660	TAG	2	6	60571	60576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_010660	AT	3	6	60578	60583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_010660	AT	3	6	60633	60638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_010660	CAG	2	6	60665	60670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_010660	G	9	9	60693	60701	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
509	NC_010660	CGG	2	6	60744	60749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_010660	T	6	6	61575	61580	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_010660	A	7	7	61913	61919	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_010660	CAC	2	6	61920	61925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
513	NC_010660	TTC	2	6	61937	61942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_010660	CGA	2	6	61972	61977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_010660	TGAT	2	8	61994	62001	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
516	NC_010660	T	6	6	62020	62025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_010660	T	6	6	64375	64380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_010660	ATG	2	6	66185	66190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_010660	ATT	2	6	66194	66199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_010660	GGA	2	6	66211	66216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
521	NC_010660	CAGAC	2	10	66219	66228	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
522	NC_010660	CAC	2	6	66265	66270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
523	NC_010660	ATA	2	6	66274	66279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_010660	TA	3	6	67982	67987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_010660	GTT	2	6	68023	68028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_010660	GAT	2	6	68046	68051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_010660	G	6	6	68128	68133	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
528	NC_010660	TAT	2	6	68218	68223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_010660	AT	3	6	68251	68256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_010660	TAAT	2	8	69746	69753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_010660	TAG	2	6	69772	69777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_010660	TA	4	8	69800	69807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_010660	TAT	2	6	69836	69841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_010660	T	6	6	69915	69920	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_010660	ATT	2	6	69926	69931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_010660	TAA	2	6	69941	69946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_010660	T	7	7	70106	70112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_010660	AT	3	6	70132	70137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_010660	ATT	2	6	70139	70144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_010660	T	7	7	70157	70163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_010660	CGTTC	2	10	70512	70521	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
542	NC_010660	A	6	6	71089	71094	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_010660	AGAA	2	8	71124	71131	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
544	NC_010660	A	7	7	71130	71136	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_010660	ATT	2	6	71250	71255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_010660	GCG	2	6	71324	71329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_010660	T	6	6	71412	71417	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_010660	ATA	2	6	74945	74950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_010660	TAA	2	6	74952	74957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_010660	ATTA	2	8	74980	74987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_010660	T	6	6	75007	75012	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_010660	GCTT	2	8	76968	76975	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
553	NC_010660	GAA	2	6	77046	77051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
554	NC_010660	CGGC	2	8	77054	77061	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
555	NC_010660	GGA	2	6	77063	77068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
556	NC_010660	GC	3	6	77074	77079	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
557	NC_010660	GAA	2	6	77097	77102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
558	NC_010660	GCC	2	6	77103	77108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
559	NC_010660	T	6	6	78692	78697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_010660	A	6	6	79004	79009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_010660	AG	4	8	79041	79048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
562	NC_010660	CAT	2	6	79179	79184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_010660	CCT	2	6	79198	79203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
564	NC_010660	CAC	2	6	79214	79219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
565	NC_010660	ATC	2	6	79252	79257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_010660	GAT	2	6	79352	79357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NC_010660	ATT	2	6	79378	79383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_010660	TAG	2	6	80017	80022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
569	NC_010660	GTT	2	6	81392	81397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_010660	CGG	2	6	81591	81596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_010660	TGA	2	6	81647	81652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_010660	GCA	2	6	81670	81675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_010660	CAA	2	6	81681	81686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_010660	ACA	2	6	81706	81711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_010660	GT	3	6	81724	81729	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
576	NC_010660	ATG	2	6	81754	81759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
577	NC_010660	GGA	2	6	81851	81856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
578	NC_010660	AAC	2	6	81899	81904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_010660	GCCT	2	8	82171	82178	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
580	NC_010660	CCTC	2	8	82203	82210	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
581	NC_010660	T	7	7	82228	82234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_010660	TAATTT	2	12	82239	82250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_010660	ATG	2	6	82289	82294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_010660	TACT	2	8	82306	82313	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
585	NC_010660	TTA	2	6	82355	82360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_010660	A	7	7	82378	82384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_010660	AATA	2	8	82404	82411	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_010660	AACT	2	8	82418	82425	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
589	NC_010660	TCC	2	6	84558	84563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
590	NC_010660	T	7	7	84600	84606	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_010660	TAA	2	6	84662	84667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_010660	ATC	2	6	87708	87713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_010660	ATC	2	6	87718	87723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_010660	GAC	2	6	87737	87742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_010660	TAA	2	6	87777	87782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_010660	AGA	2	6	87806	87811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
597	NC_010660	TAA	2	6	87837	87842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_010660	TAC	2	6	87847	87852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_010660	ACA	2	6	87917	87922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_010660	ATAC	2	8	87949	87956	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
601	NC_010660	G	9	9	88017	88025	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
602	NC_010660	ATA	2	6	89498	89503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_010660	GTC	2	6	89506	89511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_010660	TCA	2	6	89523	89528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_010660	GCA	2	6	89551	89556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_010660	GAGATG	2	12	89596	89607	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
607	NC_010660	TCCT	2	8	89780	89787	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
608	NC_010660	ACA	2	6	90134	90139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_010660	TGG	2	6	90987	90992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
610	NC_010660	TCG	2	6	91143	91148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_010660	G	7	7	91173	91179	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
612	NC_010660	TGG	2	6	91211	91216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
613	NC_010660	GTC	2	6	91228	91233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_010660	CGT	3	9	91243	91251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_010660	GTG	2	6	91396	91401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
616	NC_010660	TC	3	6	91432	91437	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
617	NC_010660	GGCT	2	8	91555	91562	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
618	NC_010660	GCA	2	6	91576	91581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_010660	TGC	2	6	91626	91631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_010660	TAT	2	6	91669	91674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_010660	GCA	2	6	91713	91718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_010660	GCG	2	6	91749	91754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_010660	CAA	2	6	91798	91803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_010660	C	6	6	91846	91851	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
625	NC_010660	TGT	2	6	91884	91889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
626	NC_010660	TGC	2	6	91926	91931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_010660	TGA	2	6	93066	93071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NC_010660	CAG	2	6	93103	93108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_010660	G	9	9	93113	93121	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
630	NC_010660	CCTGA	2	10	94427	94436	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
631	NC_010660	CCA	2	6	94461	94466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
632	NC_010660	C	8	8	94480	94487	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
633	NC_010660	GAC	2	6	94496	94501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_010660	CTGG	2	8	94525	94532	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
635	NC_010660	GTG	2	6	95025	95030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
636	NC_010660	CCA	2	6	95032	95037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
637	NC_010660	AGT	2	6	95042	95047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
638	NC_010660	TGC	2	6	97402	97407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_010660	ACA	2	6	97437	97442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_010660	CG	3	6	97446	97451	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
641	NC_010660	CAC	2	6	97455	97460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
642	NC_010660	AAG	2	6	97463	97468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
643	NC_010660	ACA	2	6	97533	97538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
644	NC_010660	GTC	2	6	97620	97625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
645	NC_010660	CGAAC	2	10	97638	97647	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
646	NC_010660	GCTCCT	2	12	97653	97664	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
647	NC_010660	GA	4	8	97673	97680	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
648	NC_010660	GAAT	2	8	97683	97690	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
649	NC_010660	GCGA	2	8	97738	97745	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
650	NC_010660	CAG	2	6	97830	97835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
651	NC_010660	GGC	2	6	97853	97858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
652	NC_010660	TTG	2	6	98074	98079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
653	NC_010660	C	6	6	98156	98161	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
654	NC_010660	GAG	2	6	98218	98223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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656	NC_010660	CAT	2	6	98278	98283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
657	NC_010660	GGA	2	6	98413	98418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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659	NC_010660	TATCTT	2	12	98616	98627	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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661	NC_010660	AGA	2	6	98670	98675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
662	NC_010660	GTA	2	6	98683	98688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
663	NC_010660	AT	3	6	98789	98794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
664	NC_010660	ACA	2	6	98818	98823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
665	NC_010660	TGAA	2	8	98827	98834	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
666	NC_010660	AGC	2	6	98863	98868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
667	NC_010660	TAAG	2	8	98922	98929	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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674	NC_010660	TAG	2	6	99291	99296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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676	NC_010660	TCG	2	6	99333	99338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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679	NC_010660	TAA	2	6	100525	100530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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682	NC_010660	AT	3	6	100642	100647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
683	NC_010660	T	6	6	100657	100662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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687	NC_010660	TGA	2	6	102070	102075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
688	NC_010660	AAT	2	6	102148	102153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
689	NC_010660	A	6	6	102191	102196	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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772	NC_010660	GCT	2	6	141366	141371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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774	NC_010660	CTG	2	6	141400	141405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
775	NC_010660	TCA	2	6	141568	141573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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777	NC_010660	T	6	6	141597	141602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
778	NC_010660	CTT	3	9	141689	141697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
779	NC_010660	A	8	8	141702	141709	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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781	NC_010660	CTT	2	6	141749	141754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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