MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 chromosome

Total Repeats: 21560

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_010658	CAGA	2	8	4592029	4592036	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21502	NC_010658	CTG	2	6	4592056	4592061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21503	NC_010658	CTT	2	6	4592083	4592088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21504	NC_010658	GAA	2	6	4592098	4592103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21505	NC_010658	GGT	2	6	4592116	4592121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21506	NC_010658	GC	3	6	4592331	4592336	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21507	NC_010658	GTT	2	6	4592451	4592456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21508	NC_010658	ATT	2	6	4592592	4592597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21509	NC_010658	GT	3	6	4592665	4592670	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21510	NC_010658	TGCGC	2	10	4593542	4593551	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
21511	NC_010658	GCC	2	6	4593615	4593620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21512	NC_010658	CTGAT	2	10	4594978	4594987	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
21513	NC_010658	TCA	2	6	4597116	4597121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21514	NC_010658	TAT	2	6	4597146	4597151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21515	NC_010658	AAAAT	2	10	4597167	4597176	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21516	NC_010658	TGG	2	6	4597250	4597255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21517	NC_010658	TACT	2	8	4597354	4597361	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21518	NC_010658	CGG	2	6	4597393	4597398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21519	NC_010658	GATC	2	8	4597459	4597466	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21520	NC_010658	CCTT	2	8	4597473	4597480	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21521	NC_010658	GTA	2	6	4598533	4598538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21522	NC_010658	CGCC	2	8	4600268	4600275	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
21523	NC_010658	GCGG	2	8	4600281	4600288	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
21524	NC_010658	GA	3	6	4601695	4601700	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21525	NC_010658	GGAG	2	8	4601704	4601711	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
21526	NC_010658	T	6	6	4602985	4602990	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21527	NC_010658	CGC	2	6	4603230	4603235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21528	NC_010658	TGA	3	9	4604947	4604955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21529	NC_010658	ATC	2	6	4605007	4605012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21530	NC_010658	AGTAAA	2	12	4605018	4605029	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21531	NC_010658	A	6	6	4605027	4605032	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21532	NC_010658	GCG	2	6	4607546	4607551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21533	NC_010658	CAG	2	6	4608120	4608125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21534	NC_010658	A	7	7	4608133	4608139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21535	NC_010658	CAA	2	6	4609674	4609679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21536	NC_010658	ATA	2	6	4609705	4609710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21537	NC_010658	T	6	6	4609714	4609719	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21538	NC_010658	T	7	7	4609739	4609745	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21539	NC_010658	TAG	2	6	4609748	4609753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21540	NC_010658	TTC	2	6	4612473	4612478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21541	NC_010658	CTG	2	6	4612497	4612502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21542	NC_010658	T	8	8	4613910	4613917	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21543	NC_010658	GGT	2	6	4613921	4613926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21544	NC_010658	CCTG	2	8	4614706	4614713	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21545	NC_010658	ATGC	2	8	4614714	4614721	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21546	NC_010658	AT	3	6	4614934	4614939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21547	NC_010658	TGA	2	6	4614968	4614973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21548	NC_010658	ATC	2	6	4614975	4614980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21549	NC_010658	ATT	2	6	4615006	4615011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21550	NC_010658	TAA	2	6	4615013	4615018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21551	NC_010658	CAT	2	6	4615031	4615036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21552	NC_010658	TAA	2	6	4615042	4615047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21553	NC_010658	GTG	2	6	4615050	4615055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21554	NC_010658	ATTT	2	8	4615071	4615078	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21555	NC_010658	T	6	6	4615076	4615081	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21556	NC_010658	T	6	6	4615119	4615124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21557	NC_010658	T	6	6	4615165	4615170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21558	NC_010658	TAA	2	6	4615230	4615235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21559	NC_010658	AAG	2	6	4615272	4615277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21560	NC_010658	AGTA	2	8	4615984	4615991	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.