MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 chromosome

Total Repeats: 21560

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21001	NC_010658	GCAT	2	8	4503223	4503230	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21002	NC_010658	TTA	2	6	4503269	4503274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21003	NC_010658	CAT	2	6	4503297	4503302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21004	NC_010658	AT	3	6	4503305	4503310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21005	NC_010658	A	6	6	4503320	4503325	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21006	NC_010658	CAT	2	6	4503364	4503369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21007	NC_010658	TTA	3	9	4503438	4503446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21008	NC_010658	AGA	2	6	4503447	4503452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21009	NC_010658	ATT	2	6	4503455	4503460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21010	NC_010658	TTTC	2	8	4503481	4503488	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
21011	NC_010658	CAAG	2	8	4503505	4503512	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21012	NC_010658	TACA	2	8	4503529	4503536	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21013	NC_010658	TAA	2	6	4503572	4503577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21014	NC_010658	ATT	2	6	4503581	4503586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21015	NC_010658	TAA	2	6	4503599	4503604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21016	NC_010658	ATT	2	6	4503668	4503673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21017	NC_010658	TCTTT	2	10	4503774	4503783	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
21018	NC_010658	GTT	2	6	4503823	4503828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21019	NC_010658	ATA	2	6	4503834	4503839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21020	NC_010658	TAG	2	6	4503865	4503870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21021	NC_010658	ATT	2	6	4503932	4503937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21022	NC_010658	TAT	2	6	4503950	4503955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21023	NC_010658	CAT	2	6	4503964	4503969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21024	NC_010658	CAT	2	6	4504004	4504009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21025	NC_010658	TTC	2	6	4504012	4504017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21026	NC_010658	ATT	2	6	4504145	4504150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21027	NC_010658	T	6	6	4504183	4504188	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21028	NC_010658	TAATG	2	10	4504205	4504214	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
21029	NC_010658	AAT	2	6	4504222	4504227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21030	NC_010658	TAA	2	6	4504266	4504271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21031	NC_010658	A	7	7	4504302	4504308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21032	NC_010658	A	6	6	4504313	4504318	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21033	NC_010658	TTAA	2	8	4504837	4504844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21042	NC_010658	CGTT	2	8	4506887	4506894	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21043	NC_010658	ATGA	2	8	4506919	4506926	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21044	NC_010658	GTGAAA	2	12	4506948	4506959	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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21047	NC_010658	TCC	2	6	4507007	4507012	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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21049	NC_010658	AT	3	6	4507037	4507042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21050	NC_010658	GGA	2	6	4507142	4507147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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21052	NC_010658	TAA	2	6	4508755	4508760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21053	NC_010658	TGA	2	6	4509197	4509202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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21057	NC_010658	TAA	2	6	4512130	4512135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21058	NC_010658	A	6	6	4512271	4512276	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21059	NC_010658	ATA	2	6	4512286	4512291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21060	NC_010658	AAT	2	6	4512302	4512307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21061	NC_010658	ATA	2	6	4512329	4512334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21062	NC_010658	CTG	2	6	4512336	4512341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21063	NC_010658	AAT	2	6	4512406	4512411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21064	NC_010658	ACA	2	6	4512415	4512420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21065	NC_010658	ACA	2	6	4512430	4512435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21066	NC_010658	T	6	6	4513438	4513443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21067	NC_010658	AT	3	6	4513459	4513464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21068	NC_010658	CCAA	2	8	4513472	4513479	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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21073	NC_010658	A	7	7	4516787	4516793	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21074	NC_010658	TA	4	8	4516820	4516827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21083	NC_010658	AG	3	6	4521789	4521794	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21084	NC_010658	T	7	7	4521858	4521864	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21092	NC_010658	ATG	2	6	4527185	4527190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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21097	NC_010658	GCC	2	6	4527391	4527396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21098	NC_010658	GA	3	6	4527398	4527403	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21099	NC_010658	GTT	2	6	4527414	4527419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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21110	NC_010658	CAT	2	6	4527886	4527891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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21112	NC_010658	AGTG	2	8	4527999	4528006	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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21116	NC_010658	CGA	2	6	4528146	4528151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21117	NC_010658	TGC	2	6	4528154	4528159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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21119	NC_010658	GCG	2	6	4528252	4528257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21120	NC_010658	CGAC	2	8	4528305	4528312	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
21121	NC_010658	GTT	2	6	4528359	4528364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21122	NC_010658	CCAG	2	8	4528404	4528411	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
21123	NC_010658	AGC	2	6	4528487	4528492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21124	NC_010658	GGA	2	6	4528578	4528583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21125	NC_010658	GTC	2	6	4528601	4528606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21126	NC_010658	GCG	2	6	4528696	4528701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21127	NC_010658	TCG	2	6	4529715	4529720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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21382	NC_010658	A	6	6	4569621	4569626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21383	NC_010658	ATT	2	6	4570673	4570678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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