MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 chromosome

Total Repeats: 21560

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_010658	TGG	2	6	406062	406067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_010658	A	8	8	406071	406078	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_010658	ATA	3	9	406158	406166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_010658	A	7	7	406166	406172	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_010658	GC	3	6	407041	407046	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1506	NC_010658	CGC	2	6	407534	407539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1507	NC_010658	CGC	2	6	407635	407640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1508	NC_010658	GCC	2	6	407671	407676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1509	NC_010658	AGC	2	6	407681	407686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_010658	TAA	2	6	410285	410290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_010658	A	6	6	410319	410324	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_010658	ATTT	2	8	410352	410359	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_010658	TC	3	6	412701	412706	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1514	NC_010658	TAT	2	6	412725	412730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_010658	TGG	2	6	412733	412738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_010658	A	7	7	412759	412765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_010658	AGG	2	6	412804	412809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_010658	CCT	2	6	414612	414617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1519	NC_010658	TGC	2	6	414644	414649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_010658	AG	3	6	414681	414686	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_010658	GCA	2	6	416208	416213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_010658	AAC	2	6	416243	416248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_010658	CT	3	6	417117	417122	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1524	NC_010658	GC	4	8	417156	417163	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1525	NC_010658	AATT	2	8	421710	421717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_010658	TGA	2	6	421734	421739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_010658	TAA	2	6	421802	421807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_010658	TAA	2	6	421841	421846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_010658	TGA	3	9	421897	421905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_010658	TAA	2	6	421932	421937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_010658	TAA	2	6	421956	421961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_010658	TTG	2	6	421968	421973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_010658	AT	3	6	422002	422007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_010658	TG	3	6	422026	422031	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_010658	ATTTT	2	10	422034	422043	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_010658	T	8	8	422040	422047	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_010658	GCG	2	6	422108	422113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_010658	GC	3	6	422178	422183	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1539	NC_010658	TGGCG	2	10	422188	422197	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1540	NC_010658	GT	3	6	422204	422209	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_010658	CGGG	2	8	422211	422218	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1542	NC_010658	GCT	2	6	422245	422250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_010658	TC	3	6	422311	422316	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1544	NC_010658	CAG	2	6	422326	422331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_010658	GAT	2	6	422414	422419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_010658	CGG	2	6	422440	422445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1547	NC_010658	GCT	2	6	422467	422472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1548	NC_010658	GCAGC	2	10	422531	422540	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1549	NC_010658	GCC	2	6	422578	422583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1550	NC_010658	GTG	2	6	422638	422643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_010658	GCC	2	6	422701	422706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1552	NC_010658	GACG	2	8	422803	422810	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1553	NC_010658	CGGG	2	8	422815	422822	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1554	NC_010658	CA	3	6	422842	422847	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1555	NC_010658	GCGG	2	8	422854	422861	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1556	NC_010658	GCA	2	6	422872	422877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_010658	GCA	2	6	422893	422898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_010658	GTC	2	6	422903	422908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1559	NC_010658	CGG	2	6	422988	422993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_010658	CTG	2	6	423077	423082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_010658	GCA	2	6	423096	423101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_010658	GC	3	6	423112	423117	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1563	NC_010658	GCA	2	6	423133	423138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_010658	TGG	2	6	423150	423155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_010658	ACG	2	6	423195	423200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_010658	GTG	2	6	423212	423217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_010658	TCACCG	2	12	423273	423284	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1568	NC_010658	TGC	2	6	423306	423311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_010658	GTG	2	6	423341	423346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_010658	A	6	6	423347	423352	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_010658	GACG	2	8	423415	423422	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1572	NC_010658	CGG	2	6	423423	423428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1573	NC_010658	CGG	2	6	423431	423436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1574	NC_010658	CAC	2	6	423481	423486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1575	NC_010658	CGGG	2	8	423493	423500	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1576	NC_010658	ACG	2	6	423519	423524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1577	NC_010658	CGG	2	6	423537	423542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1578	NC_010658	GCC	2	6	423567	423572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1579	NC_010658	ATG	2	6	423579	423584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_010658	CGCTAC	2	12	423632	423643	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1581	NC_010658	CGA	2	6	423669	423674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_010658	GCA	2	6	423690	423695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_010658	CGG	2	6	423708	423713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1584	NC_010658	CTA	2	6	423745	423750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1585	NC_010658	CGC	2	6	423817	423822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1586	NC_010658	CAC	2	6	423901	423906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1587	NC_010658	GGGC	2	8	423910	423917	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1588	NC_010658	TGC	2	6	423940	423945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_010658	TCA	2	6	423954	423959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1590	NC_010658	CAG	2	6	424022	424027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_010658	GGC	2	6	424028	424033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1592	NC_010658	TGACC	2	10	424063	424072	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1593	NC_010658	GGCT	2	8	424196	424203	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1594	NC_010658	GA	3	6	424204	424209	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_010658	ACG	2	6	424257	424262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1596	NC_010658	GCC	2	6	424269	424274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1597	NC_010658	CTG	2	6	424319	424324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1598	NC_010658	GCA	2	6	424327	424332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1599	NC_010658	GCC	2	6	424393	424398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1600	NC_010658	CGC	2	6	424455	424460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1601	NC_010658	GCA	2	6	424512	424517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_010658	GGCA	2	8	424519	424526	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1603	NC_010658	CGAC	2	8	424752	424759	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1604	NC_010658	CGG	2	6	424761	424766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1605	NC_010658	ATG	2	6	424863	424868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_010658	CGG	2	6	424905	424910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_010658	ACGG	2	8	424918	424925	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1608	NC_010658	ACG	2	6	424926	424931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_010658	CAC	2	6	424940	424945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1610	NC_010658	CAGC	2	8	424957	424964	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1611	NC_010658	GCC	2	6	425040	425045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1612	NC_010658	TGTCGC	2	12	425094	425105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_010658	GAC	2	6	425149	425154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1614	NC_010658	CGC	2	6	425208	425213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1615	NC_010658	CAG	2	6	425282	425287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_010658	GGTGT	2	10	425309	425318	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_010658	TGG	2	6	425331	425336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_010658	GCT	2	6	425338	425343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_010658	GCC	2	6	425391	425396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1620	NC_010658	GGC	2	6	425434	425439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1621	NC_010658	ACC	2	6	425493	425498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1622	NC_010658	ATG	2	6	425556	425561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_010658	GAG	2	6	425582	425587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_010658	GCA	2	6	425626	425631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_010658	TAC	2	6	425654	425659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_010658	AACCGG	2	12	425660	425671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1627	NC_010658	TAC	2	6	425672	425677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_010658	G	10	10	425725	425734	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_010658	T	6	6	426189	426194	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_010658	AAT	2	6	426275	426280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_010658	CAC	2	6	426392	426397	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1632	NC_010658	AGG	2	6	426415	426420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1634	NC_010658	GCA	2	6	426490	426495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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